簡介
凡是細胞核具有核膜，能進行有絲分裂，細胞質中存在線粒體、葉綠體等細胞器的微小生物，稱為真核微生物。原生動物、微型後生動物、藻類、真菌均屬于真核微生物。真核生物的細胞與原核生物的細胞相比，其形态更大、結構更為複雜、細胞器的功能更為專一。真核生物已發展出許多由膜包圍着的細胞器，如内質網、高爾基體、溶酶體、微體、線粒體和葉綠體等，更重要的是真核細胞已進化出有核膜包裹着的完整的細胞核，其中存在着構造極其精巧的染色體，它的雙鍊DNA長鍊與組蛋白及其他蛋白密切結合，更完善地執行生物的遺傳功能。
特點
①核發育完全（有核膜将細胞核和細胞質分開，兩者有明顯界限）。
②有高度分化的細胞器，如線粒體、中心體、高爾基體、内質網、溶酶體和葉綠體。
③進行有絲分裂。
基本結構
真核細胞與原核細胞相比，個體更大，結構更複雜，顯著特征是有明顯的細胞核，還有一些由膜包裹的細胞器。有細胞壁的真核細胞其内部為原生質體，由細胞質膜包裹着，其中為細胞質和細胞核。細胞質是透明而黏稠的溶膠，由各種細胞器及其他物質組成。除細胞器以外的膠狀溶液為細胞漿或稱細胞基質。内含細胞骨架、各種酶、儲藏物質等内含物。真核微生物主要包括真菌、顯微藻類和原生動物等。
分類
原生動物
原生動物是動物中最原始、最低等、結構最簡單的單細胞動物。在動物學中被列入原生動物門。因其形體微小，長度在10～300µm，需在光學顯微鏡下才能看到。它們在自然界中分布廣泛，特别是海水、淡水中大量存在。水體中的原生動物是重要的浮遊生物。在活性污泥處理廢水中原生動物以吞食細菌為生，對淨化污水起到重要的作用。
原生動物為單細胞，沒有細胞壁，有分化的細胞器，有一個或多個細胞核有核膜。有獨立生活的生命特征和生理功能，如攝食、營養、呼吸、排洩、生長、繁殖、運動以及對刺激的反應等。上述各種功能是由相應的細胞器執行的，如：胞口、胞咽、食物泡、吸管是攝食、消化、營養的細胞器；收集管、伸縮泡、胞肛是排洩的細胞器；鞭毛、纖毛、剛毛、僞足是運動和捕食的細胞器；眼點是感覺細胞器。有的細胞器執行多種功能，如僞足、鞭毛、纖毛、剛毛既能執行運動功能，又能執行攝食功能，甚至還有感覺功能。
真菌
真菌的細胞構造包括細胞壁、細胞膜、細胞質、細胞核、線粒體、核糖體、内質網、高爾基體、液泡等。
大多數真菌是由菌絲構成的菌絲體。真菌菌絲的寬度約5～10µm，比細菌和放線菌大幾倍到幾十倍。真菌菌絲可分為無隔膜菌絲和有隔膜菌絲。無隔膜菌絲是長管狀的單細胞菌絲，沒有隔膜，内含多個核。大多數卵菌和接合菌的菌絲為無隔膜菌絲。有隔膜菌絲是有隔膜的多細胞菌絲，每個細胞含有一個或多個核。橫隔膜上開着小孔，可讓細胞質和細胞核自由流通，各細胞功能相同。子囊菌和擔子菌的菌絲為有隔膜菌絲。
根據生理功能，真菌菌絲可分為營養菌絲和繁殖菌絲。營養菌絲是伸入培養基内攝取營養物質的菌絲。它有多種變态，以更好地吸收養分。常見的變态營養菌絲有匍匐菌絲、假根、吸器、菌環、菌網等。
顯微藻類
藻類是單細胞或多細胞的真核微生物，通常是植物學研究的對象，但不同種類間個體大小和形态差别懸殊，許多要用顯微鏡才能觀察，所以将顯微藻類歸作微生物研究的範疇。藻類細胞内含有各種色素，能進行光合作用，吸收CO2并釋放O2，營光能自養或兼性光能自養生活。藻類多為水生類型，在陸地上亦分布廣泛，土壤中的藻類主要有矽藻、綠藻和黃藻，是構成土壤生物群落的重要成分。
