解剖學特點
結構較複雜，分為上丘腦、背側丘腦、後丘腦、底丘腦和下丘腦。
(1)上丘腦主要的結構為松果體，松果體是一内分泌腺。
(2)背側丘腦為兩個卵圓形的灰質團塊，左右各一個。每個卵圓形的灰質團塊又分為丘腦前核、丘腦内側核和丘腦外側核。丘腦前核具有與内髒活動有關的功能，丘腦内側核可能是軀體和内髒感覺沖動的整合中樞，丘腦外側核是軀體感覺通路的最後一級中繼站，它把皮膚感覺、本體感覺沖動傳向大腦皮質中央後回。
(3)後丘腦包括内側膝狀體和外側膝狀體。内側膝狀體内有内側膝狀體核，是聽覺傳導路中最後一個中繼站，接受聽覺纖維的傳入，并發出纖維到達大腦皮質聽覺中樞。外側膝狀體内有外側膝狀體核，是視覺傳導路中最後一個中繼站，接受視覺纖維的傳入，并發出纖維到達大腦皮質視覺中樞。
(4)底丘腦為中腦和間腦的過渡地區。
(5)下丘腦是自主性神經的皮質下中樞，與某些激素的分泌、情緒反應、某些代謝(如水、鹽、糖、脂肪等代謝)的調節和體溫、心血管運動、呼吸運動的調節以及食欲、睡眠、覺醒、生物鐘(或晝夜節律)等的調節均有關系。許多生理心理學研究都涉及間腦，尤其是下丘腦。
間腦和端腦在胚胎早期同由前腦翼闆衍發而來，間腦位居前腦的後部中央，端腦發育成為左右大腦半球。由于端腦的高度擴展，間腦除了腹側屬于下丘腦的部分露于腦表面以外，其餘部分皆為左右大腦半球所包繞。在腦的正中矢狀切面上，自後連合至乳頭體後緣的連線代表間腦和中腦的交界，自室間孔至視交叉的連線代表間腦和端腦的交界。間腦的室腔稱為第三腦室。
兩側間腦的内側面形成第三腦室的旁壁。在内側面與背面交界處，有一條隆起的纖維束——丘腦髓紋，上有第三腦室脈絡組織附着。丘腦髓紋向後連接缰三角，左右缰三角之間有缰連合連接，此連合的後方有松果體。約在第三腦室壁的中央部，有連接左右室壁的丘腦間粘合(或中央塊)。它的腹側有下丘腦溝，自中腦水管走向室間孔。
屬于下丘腦的結構圍繞着第三腦室底，從前向後有連接終闆的視交叉、漏鬥、灰結節和乳頭體。在間腦的背面，第三腦室兩側為屬于背側丘腦的卵圓形灰質團塊所挾持，前端有隆凸的丘腦前結節，後方有膨大的枕。背面的外側有屬于端腦的尾狀核，它與間腦之間為終紋。在枕的下外側，有内側膝狀體和外側膝狀體。間腦的外側面與端腦的内囊融合。間腦的腹面是露在腦外表的部分，前有視交叉和視束，漏鬥、垂體和灰結節居中，乳頭體成對，位于灰結節後方。
損害
間腦各部分都有其特殊功能，但主要功能表現為對軀體性與内髒性感覺(嗅覺除外)沖動的接受和初步整合，中繼給大腦皮質特定感覺區；它又是大腦皮質下自主神經和内分泌的調節中樞。故間腦損害時，出現感覺障礙和自發性感覺過敏，尤其是痛的過敏明顯，以及植物性神經與内分泌紊亂現象，如體溫、水的代謝、睡眠、情緒等異常現象。
