基本内容
病原體侵入人體後，人體就是病原體生存的場所，醫學上稱為病原體的宿主。
病原體在宿主中進行生長繁殖、釋放毒性物質等引起機體不同程度的病理變化，這一過程稱為感染。不過人體或動物不像人工培養細菌的培養基，可以讓病菌不受限制地肆意生長繁殖，輕易地導緻機體死亡。病原體入侵人體後，在發生感染的同時，能激發人體免疫系統産生一系列免疫應答與之對抗，這稱之為免疫。
感染和免疫是一對矛盾，其結局如何，根據病原體和宿主兩方面力量強弱而定。如果宿主足夠強壯，可以根本不形成感染;即使形成了感染，病原體也多半會逐漸消亡，于是患者康複;如果宿主很虛弱而病原體很兇猛，則感染擴散，病人将會死亡。
除了宿主自身的力量，有效的抗菌藥物和其它措施的協同作用也是必不可少的，在多種因素的共同作用下，大多數疾病是可以很快治好的。依靠不斷發展的科學進步，總是能夠不斷控制和消滅有害人類和動物的微生物。
有研究表明，澆灌糞肥的蔬菜會被病原微生物污染，距離施肥時間越近，蔬菜表面大腸菌群數量越多，用自來水浸泡、沖洗等方法對去除蔬菜表面的大腸菌群有一定效果，其中以沖洗效果最佳。此外，最好的殺滅蔬菜病原菌的方法是沸水浸泡。
分類n
根據病原微生物的組成及結構，可将其分為三大類：
非細胞型微生物主要包括病毒和朊粒等。病毒無細胞結構，僅由蛋白質外衣包裹核酸構成，如甲型肝炎病毒、SARS冠狀病毒等。朊粒是一種感染性蛋白質分子，能夠引起動物和人類腦組織慢性海綿體變性，如瘋牛病鯠冄頭條及人類的庫魯病。
原核細胞型微生物n由裸露的DNA盤繞形成原始核質，沒有核膜和細胞器，包括細菌、立克次體、衣原體、支原體、螺旋體，屬于廣義的細菌範疇。
真核細胞型微生物n包括真菌、原蟲等。此類微生物具有核膜和複雜的細胞器，如引起瘧疾的瘧原蟲及引起皮膚病的黴菌等 。
結構與特性
細菌(bacteria)的生物學分類屬于原核細胞生物界，廣義的細菌概念包括所有原核細胞型微生物，有細菌、放線菌、衣原體、支原體、立克次氏體和螺旋體；狹義的細菌的概念專指其中的細菌。它種類繁多，數量龐大，最具代表性，一般情況下通常是指狹義概念的細菌 。
細菌的大小形态細菌是肉眼看不見，需經顯微鏡放大幾百倍或一千倍才能看見的微小生物。通常以微米(μm)為測量單位。由于細菌是透明的，因此，要經過染色，才可以看見它們的輪廓、形态，甚至結構。通常，電鏡觀察細菌的超微結構時用nm（1/1000μm）測量其大小，光鏡觀察細菌時用μm(1/1000mm)測量。當然，不同的細菌，甚至有時同一類細菌也可因菌齡、細菌生長所處的環境因素不同，其大小、形态都有不同或有一定程度的差異。
臨床最常用的細菌染色方法是革蘭染色法。經過革蘭氏染色可将細菌分為兩大類：紫色的是革蘭氏陽性菌，紅色的是革蘭氏陰性菌。由于兩類細菌的細胞壁結構不同，決定了其染色性不同，且對人體的緻病性和對抗生素的敏感性也有較大差異。結核杆菌革蘭氏染色法不着色，經抗酸染色後呈紅色。n
