遊戲背景
故事是由EVA故事展開的前一年開始的，進入NERV機關的玩家你，原本是一名放棄教育生涯的教師。進入NERV之後，接受的任務就是對淩波麗進行培養，同時參與到對使徒侵襲工作的反抗中來。但是，随着劇情的發生，你逐漸發現這一切并不是那麼簡單，而你和绫波的關系倒是越走越近。
遊戲一共經曆一年的時間，直到補完發生，結局出現為止。中間的大大小小事件盡量保持了原作風格，以章節來劃分段落，同時穿插着绫波和玩家之間的各式各樣的事件。與其說玩家，不如說绫波是真正的主角，許多事件都以绫波的角度去描繪。換了一個角度後，不但增加了新鮮感，并且同樣的情節也讓人有了更深一個層次的認識。
遊戲特點
《新世紀福音戰士》這部動畫以複雜的情節，生動的人物，和豐富的心理描寫着稱。而本遊戲遵循了原作的風格，雖然依然留下了許多未解的謎題，但卻更增加了恢弘的氣勢和吸引人的懸念。不僅如此，遊戲還照搬了大量原創情節，淩波麗和主人公将會展開豐富多彩的交流和互動。可以說，如果你是EVA的忠實愛好者，你會在這款遊戲裡重溫原作幾乎全部情節，并體驗到許多新的感覺；如果你對EVA不甚了解，也會在遊戲中體會到美少女養成的樂趣，并輕易地融入到EVA的世界裡去。
EVA零号機的駕駛員，有着不尋常的血紅瞳孔。性格中缺乏一般的情感表現，除了碇元度她幾乎不對任何人表露感情。無論交給她多麼危險的任務，她都不會有任何的異議。。。在她的房間裡除了生活必須的東西外沒有其他的任何裝飾品。我那時還沒上網，隻是從其他雜志聽說過《福音戰士》這部卡通，對淩波麗的了解也僅是覺得她的造型很特别，想不到她的性格竟是如此的與衆不同。等到在網上看到有關介紹、看了tv版和劇場版的《福音戰士》後，才了解到她神秘的故事。。。
公元2000年，南極發生了大爆炸，冰封的大陸在一瞬間融化，引起世界海洋水位上漲甚至海嘯，淹沒了地球上的很大一部分陸地，随後，内戰、民族紛争、自然災害接踵而來，人類因此滅亡了一半。這次災難被稱為“第二次沖擊"（TheSecondImpact)。在聖經《創世紀》記載中，神用洪水毀滅一切生物，隻是指示挪亞制造方舟帶上一家人和地球上的部分生物以重建家園，
這被稱為“第一次沖擊”。聯合國對外界說是外星來的巨大隕石撞擊，其實是葛城探險隊在南極意外地發現了亞當（第一使徒）的胚胎，結果因故發生大爆炸。在TV版和劇場版中沒有對此作完整的說明,TV版中講到在南極出現的與EVA非常相似的“光之巨人”（第二使徒）是造成爆炸的原因，還有後來的南極爆炸時出現的巨大天使翅膀（非常大，幾乎有小半個南半球大）。在劇場版中出現了光之巨人失控展開兩對翅膀發生大爆炸的畫面。
講到人類最終要進化成為單體生物回歸Lilith（第三次沖擊），于是一個神秘組織因此建立，名為Seele（德語：靈魂），下有人工進化研究所、人類補完委員會等機構，從事亞當的研究，終于在2004年前成功地從亞當複制成功了人造的“神”-EVA，也就是德語的夏娃，用于收集人的靈魂。
正在某大學生物系任教的冬月發現自己的一名學生碇唯在生物方面很有天才，便對其産生了興趣，也注意到了一個人：唯的丈夫碇元度。其實唯是Seele的人，他們在進行一項人類進化的“人類補完計劃”，這幾人成了NERV（德語：神經）最初的成員，《新世紀福音戰士》的故事也由此開始。
遊戲攻略
時間表
4/1OP
4/10第1學期始業式
4/24,4/25遠足
5/1~5/6第三使徒來襲
5/8真嗣入學
5/22~5/27第四使徒來襲
5/26~6/1淩波談到真嗣
6/7發新的ID卡
6/8送新的ID卡給绫波
6/12~6/17第五使徒來襲
6/19三者面談
6/26~7/1第六使徒來襲
7/3明日香入學
7/7七夕
7/10~7/12期末測驗
7/14遊泳大會
7/19第1學期終業式
7/21~7/27補習
8/5第七使徒來襲1
8/7真嗣和明日香練舞
8/11第七使徒來襲2
8/13夏季同人志發表會
8/19夏日祭典
9/1第2學期始業式
9/11~9/13發現第八使徒
9/15~9/16溫泉之旅
9/14~9/16修學旅行
9/25~9/30第九使徒來襲
10/7體育祭
10/16~10/21第十使徒來襲
10/30文化祭練習
11/3文化祭
11/6~11/11第十一使徒來襲
11/14機體交換實驗
11/15~11/22绫波談到真嗣
11/27~12/2第十二使徒來襲
12/7~12/9期末測驗
12/21~12/23謎之訓練
12/23第2學期終業式
12/24聖誕夜
12/25~12/27補習
12/31除夕,冬季同人志發表會
1/1新年,賀年卡
1/9第3學期始業式
1/11第十三使徒來襲
1/12機體交換實驗報告
1/13第十四使徒來襲
1/14~1/16淩波入院
2/13拯救真嗣計劃
2/14情人節
2/18第十五使徒來襲
2/27~2/29期末測驗
3/14情人節回禮
3/23第3學期終業式
3/24第十六使徒來襲
3/27淩波再生,記憶回複
3/28LCL裡的淩波
3/29第十七使徒來襲
3/30和淩波道别,消滅第十七使徒
3/31人類補完計劃開始,END
CG獲得
[文化祭CG]
公主:社會适應200以上,對碇真嗣好意高
女巫:社會适應200以上,對玩家好意高
樹木:社會适應199以下
[體育祭CG]
吃面包比賽:社會适應200以上
稱贊淩波得名:體育祭第三名以内
[休息CG]
淩波幫玩家捶背:社會适應300以上,肉體強度200以上
淩波幫玩家縫補扣子:社會适應300以上,道德感覺200以上
淩波趴在玩家背上:社會适應300以上,ph200以上
[外出CG]
淩波泡溫泉:9/12發現第八使徒之後
修學旅行:9/11發現第八使徒之後
淩波穿着比基尼泳裝:社會适應150以上(比基尼泳裝購買必要)
淩波穿着白色泳裝:社會适應150以上
淩波穿着藍色泳裝:社會适應149以下
淩波溺水:绫波穿着比基尼泳裝:疲勞系數高,肉體強度100以下,社會适應150以上(比基尼泳裝購買必要)
淩波穿着白色泳裝:疲勞系數高,肉體強度100以下,社會适應150以上
淩波穿着藍色泳裝:疲勞系數高,肉體強度100以下,社會适應149以下
淩波幫玩家擦防曬油:绫波穿着比基尼泳裝:社會适應150以上,對玩家好意60以上(比基尼泳裝購買必要)
淩波穿着白色泳裝:社會适應150以上,對玩家好意60以上
淩波穿着藍色泳裝:社會适應149以下,對玩家好意60以上
淩波的比基尼泳裝被海浪沖掉:社會适應150以上,ph50以上,對玩家好意60以上(比基尼泳裝購買必要)
淩波外出後忘記回來(探望绫波):海水浴:感受能力300以上,疲勞系數200以上,精神防壁100以下
映畫:感受能力300以上,疲勞系數200以上,精神防壁100以下
遊園地:感受能力300以上,疲勞系數200以上,精神防壁100以下
淩波外出遇見結婚式:11月的日曜日發生一次,對玩家好意60以上必要
淩波喂玩家吃冰:外出選擇餐廳,穿着制服,社會适應高,對玩家好意70以上必要
淩波幫玩家擦眼淚:戀愛電影:社會适應300以上
普通電影:社會适應300以上
山羊咬住淩波的裙子:遊園地的動物園,社會适應高,感受能力200以上
淩波安撫迷路的小孩:遊園地的雲霄飛車,社會适應高,道德感覺200以上
淩波綁鞋帶:遊園地的摩天輪,戀愛狀态
淩波玩秋千:遊園地的健身區,社會适應高,肉體強度200以上
[節日CG]
夏祭後與淩波牽手回家:對玩家好意高
淩波制作情人節巧克力:對玩家好意60以上
淩波于情人節親吻玩家:對玩家好意80以上
淩波于聖誕節送禮:對玩家好意99以下
淩波聖誕節親吻玩家:對玩家好意100~119
淩波聖誕節住在玩家屋内:對玩家好意120以上
同人志發表會:夏:7/2~8/6購入同人志必要,8/13外出
冬:12/3~12/24購入同人志必要,12/31外出
[物品CG]
淩波新的ID卡:6/7發放,對玩家好意高
星之沙:修學旅行後,對玩家好意50以上
地方名産:修學旅行後,對玩家好意25~49
旗子飾品:修學旅行後,對玩家好意24以下
淩波寫的詩集:10/23~10/27去學校,基本語彙&社會适應&感受能力高
淩波自制餅幹:10/23~10/27去學校,基本語彙&社會适應&感受能力高
情人節巧克力(買):對玩家好意30~59
情人節巧克力(自制):對玩家好意60以上
情人節回禮(蛋糕):淩波對玩家好意70以上
情人節回禮(餅幹):淩波對玩家好意40~69
情人節回禮(冰):淩波對玩家好意39以下
淩波收到情書:戀愛狀态,平時5%發生
冰箱内的脾酒:淩波非行狀态後第一個日曜日發現
绫波的狀況
社會适應低:社會适應74以下
社會适應高:社會适應75以上
戀愛狀态:對玩家,真嗣,碇司令其一好意75以上,ph200以上
非行狀态:道德感覺,社會适應49以下,感受能力200以上=>疲勞系數45以上
同人志愛好狀态:社會适應50以下,'同人志書籍購入
病氣狀态:疲勞系數較肉體強度+精神防壁值之50%高
受傷狀态:戰鬥後機體損傷75%
"淩波育成計劃攻略"問題補完版~
1:于"Dress&Casual商店"内之所有衣服必須在"社會适應達到75以上"時方能穿着
比基尼泳裝則必須追加"ph分泌達到50以上"于執行"海水浴"時方會穿着
2:于"animateg商店"内之三件衣服則必須為"同人志愛好狀況"時方能穿着
ps:同人志愛好狀況(社會适應50以下)=>7/2~8/6(12/3~12/24)之日曜日購入同人志書籍後(最少一本)再于8/13(12/31)當天有"夏(冬)季同人志發表會"購入大量同人志書籍即可
注意:以上兩者"不能"同時進行
活動與好感
執行:心理教育=>對玩家好感:+0~2
知能強化=>對玩家好感:+0~1
修習=>對玩家好感:+0~1
看病=>對玩家好感:+1~2
遊客園=>對玩家好感:+0~1
海水浴=>對玩家好感:+0~1
電影=>對玩家好感:+0~1
外出=>對玩家好感:-1~2
學校=>對真嗣好感:+0~2
同步率測驗=>對碇司令好感:+0~2
模拟戰鬥=>對碇司令好感:+0~2
謎之訓練=>對碇司令好感:+0~3
