民族起源
胡圖族是中部非洲的一個族群，主要聚居于盧旺達和布隆迪，是該兩國的最大族群。根據美國中央情報局的資料，84%的盧旺達人以及85%的布隆迪人屬胡圖族。胡圖族與圖西族十分相近，他們的語言、體格和文化都沒有很大的分别，其差異主要在于社會階級。比利時和德國殖民時期，外來殖民者選擇膚色較淺、鼻梁較高的人群作為統治階級，稱為圖西族。
在殖民主義消失後，胡圖族掌握了盧旺達的政權，開始對圖西族進行報複。與此同時，在布隆迪當權的圖西族也對胡圖族進行了種族清洗。1990年圖西族成立開始進行颠覆政府的活動，随後兩族對立導緻了胡圖族政府開始操縱盧旺達大屠殺，上百萬名圖西族人被殺。圖西族的盧旺達愛國陣線最終聯合鄰國烏幹達軍隊成功奪取政權。
盧旺達大屠殺
胡圖和圖西兩族分别占盧旺達全國人口的85%和14%，前者講法語,以農耕為生；後者操英語和斯瓦希利語,從事遊牧業。1994年4月,盧旺達的胡圖族哈比亞利馬納總統和布隆迪總統一起乘坐的飛機在盧旺達首都機場上空被擊毀,兩位總統雙雙遇難。
從此,盧旺達爆發了長達4個月的大屠殺和武裝沖突。根據國際紅十字會估算,在短短100多天裡,盧旺達700多萬人口中有近80萬人被殺，400萬人無家可歸，其中200萬人逃往國外，釀成了世紀罕見的災難。這次仇殺的被害者大多為圖西族人（占人口多數），不僅如此，胡圖族屠殺者對主張民族和解的本民族同胞同樣濫殺。
此前20年時間，兩族間就曾發生過3次較大的武裝沖突(1959年、1963年和1973年)。盧旺達鄰國布隆迪的民族問題也與其相似，胡圖族與圖西族分别占全國人口的85%和13%，兩族間也多次發生大規模的流血沖突和軍事政變，造成數十萬人喪生，上百萬人淪為難民，這為以後的剛果（金）的大屠殺埋下了禍根。
遺傳學
現代的Y染色體的遺傳研究表明，密切的種族的胡圖族和其他鄰近的班圖族人民，特别是圖西族之間的血緣關系。像圖西人的胡圖族主要屬于E1b1a單倍型類群（83%），這與從西部非洲的班圖人擴張。少數人進行的E2（8%），B（4%），E1b1b（3%）和R1（1%）的分支。
一代又一代的基因抹殺任何可能曾經存在這兩個班圖語的民族-著名的是身高體建立和面部特征鮮明的物理區别。由于頻譜的物理變化中的人民，比利時當局法律規定的種族歸屬，在20世紀20年代，基于對經濟的标準。正式的和離散的社會分工，因此強加給不明确的生物區别。
在幾十年的幹預在一定程度上，這些類别的透氣性具體化了的生物的區别，産生一個更高的精英和更短的下層階級，但關系不大的基因庫已經存在了幾個世紀前。社會範疇，因此真實的，但有一點，如果任何檢測的胡圖族和圖西族之間的遺傳分化。
後殖民曆史
1890年到1918年時盧旺達為德國的殖民地，1918年到1962年為比利時的殖民地。少數民族圖西族（約18%）始終統治着占約80%左右人口的胡圖族。在比利時人離開後，政權交還給占多數人口的胡圖人。在1962年盧旺達獨立後，政府也未妥善處理民族之間的對立問題。
在20多年的時間裡，盧旺達政府一直對圖西族實行種族歧視政策。在大屠殺前的三年裡，國家控制的媒體甚至把圖西族人視同為國家的敵人，大力加以撻伐和煽動，引起圖西族人的恐懼和仇恨。一家受到黨政軍多名要人支持的RTLM廣播電台在大屠殺前九個月，宣傳對圖西族人的仇恨，甚至公開宣布須被處決的名單。
布隆迪于1962年7月1日獲得完全獨立。圖西族國王（Mwambutsa IV Bangiriceng)建立君主立憲制。但卻在1966年時由軍人出身的首相罷黜了原本的王子（他才剛篡位沒有多久），開始進入軍人獨裁執政的時期。1972年4月下旬至9月，估計有20萬至30萬胡圖族人被殺害，約30萬人成為難民。
1976年讓-巴蒂斯特·巴加紮上校在一場不流血政變中的上台。雖然巴加紮領導的是以圖西族為主的軍事政權，但他鼓勵土地的改革，選舉制度改革和民族和解。1984年巴加紮作為唯一的候選人，當選為國家元首。這種少數民族占高位的不正常社會結構埋下國家不穩定的惡種，并且在1993年10月時到達最高峰。
那時剛上任才四個月、布隆迪有史以來第一位胡圖人身份的元首，也是首任民選總統的梅契爾·恩達達雅（Melchior Ndadaye），遭到主要是胡圖族極端分子中政府高官暗殺。恩達達雅的死，導緻全面性的種族沖突，在這場種族沖突中至少有二十萬的雙方人口遭到屠殺，而當中原來有人口6.5萬的圖西人被屠殺至剩下5000人不到。
截至2006年，胡圖族和圖西族之間的暴力事件已經平息，但在盧旺達和布隆迪的局勢仍然緊張，數十萬盧旺達人仍然生活在國外（見大湖地區的難民危機）。
