簽發流程
通常船公司的提單，如果不加任何不良批注，就表明該提單是清潔已裝船提單，一般客人信用證中都會要求全套的清潔提單，至于提單上是否顯示CLEAN ON BOARD，船公司基本不會顯示這些字樣的，但是對于這一點，各個銀行有不同的做法，大多數銀行都不要求提單上顯示CLEAN ON BOARD字樣。也就是說，他們不會把沒有CLEAN ON BOARD作為單據的不符點，但是有的銀行就一定要有。比如部分地區的中國銀行就會出現這個問題，一般接到信用證申請以後跟銀行确認，他們針對信用證上的該條是否要求提單必須顯示，如果要求，那趕快通知客人不要在單據要求中顯示該條目，同時告訴客人原因。
清潔提單的簽發要看LC怎麼要求的，大多數是FULL SETS OF MARINE CLEAN ON BOARD B/L，提單無須寫明clean on board字樣，但有個别客戶LC會要求B/L MARKED CLEAN ON BOARD，就隻能要求提單上必須出現clean on board字樣。當然并非所有有關貨物的批注都構成不清潔提單。例如，承運人對于提單上列有貨物的數量、質量、價值或特性并不負責，即使托運人在提單上聲明了内容、價值、重量、尺寸、标記、質量、數量等，承運人也視作不詳。這些聲明并不構成提單的“不清潔”。承運人對因包裝性質（如裝入紙袋、塑料袋内的貨物）而引起損失或損壞予以保留的條款，即免責權利，也并不作為聲明貨物有缺陷，不構成“不清潔提單”。如果大副收據所列貨物唛頭、件數、重量等内容與提單所申報的不符，提單應根據大副收據作更正，這種更正過的提單應該說不構成不清潔提單，但可能遇到刁難挑剔的客戶，也會以不潔提單為由而拒付。
在海運實踐過程中，有些客戶信用證要求在海運提單上顯示“CLEAN ON BOARD”字樣，實際上隻要提單上沒有特殊批注的提單均屬于清潔提單，不影響銀行結彙。而一般船公司都不會在提單上顯示“CLEAN ON BOARD”，如MSC/NORASIA等等。HAPAG-LLOYD船公司如果要求可以顯示在提單上，不過必須傳真L/C正本複印件給到船公司，另外在提單的貨描處必須加上： CLEAN ON BOARD：WEIGHT，MEASURE，MARKS，NUMBER，QUALITY，CONDITION，CONTENTS，VALUE，QUANTITY， IF MENTIONED IN THIS B/L FUNISHED BY THE SHIPPERS AND COULD NOT BE CHECKED BY THE MASTER/CARRIER。
相關責任
根據法律，對于因貨物包裝不良的原因造成的貨物損失，承運人不承擔責任。包裝有内包裝和外包裝之分，外包裝一般是目力所及的。如果沒有複蓋物，内包裝也可能為目力所及。如果雖然簽發了清潔提單，但承運人或代其簽發提單的人确能證明在接收/裝船時，該貨物表面存在瑕疵，是否可以免除承運人的責任？如果根據接收/裝船時的客觀條件，比如光線等因素，一般人可以明顯地發現表面存在瑕疵，而承運人或代其簽發提單的人卻不作批注，（應該批注而不批注），對由此而産生的損失承運人并不能免則。
根據ISBP79.“已裝運表面狀況良好”、“已載于船”、“清潔已裝船”或其他包含“已裝運”或“已裝船”之類用語的措辭與“已裝運上船”具有同等效力。
ISBP91.即使信用證可能要求“清潔已裝船提單”或注明“清潔已裝船”的提單，提單也無需出現“清潔”字樣。
法律法規
1978年聯合國海上貨物運輸公約（漢堡規則）第十六條規定：“提單：保留和證據效力。
1.如果承運人或代其簽發提單的其他人确知或有合理的根據懷疑提單所載有關貨物的品類、主要标志，包數或件數、重量或數量等項目沒有準确地表
示實際接管的貨物，或在簽發“已裝船”提單的情況下，沒有準确地表示已實際裝船的貨物，或者他無适當的方法來核對這些項目，則承運人或該其他人必須在提單上作出保留，注明不符之處、懷疑根據、或無适當的核對方法。
2.如果承運人或代他簽發提單的其他人未在提單上批注貨物的外表狀況，則應視為他已在提單上注明貨物的外表狀況良好。
3.除按本條第1款規定就有關項目和其範圍作出許可在保留以外：
（1）提單是承運人接管，或如簽發“已裝船”提單時，裝載提單所述貨物的初步證據；
（2）如果提單已轉讓給相信提單上有關貨物的描述而照此行事的包括收貨人在内的第三方，則承運人提出與此相反的證據不予接受。
4.如果提單未按照第十五條第1款的規定載明運費或以其他方式說明運費由收貨人支付或未載明在裝貨港發生的滞期費由收貨人支付，則該提單是收貨人不支付運費或滞期費的初步證據。如果提單已轉讓給相信提單上無任何此種說明而照此行事的包括收貨人在内的第三方，則承運人提出的與此相反的證據不予接受。”
《中華人民共和國海商法》第七十六條規定：“承運人或者代其簽發提單的人未在提單上批注貨物表面狀況的，視為貨物的表面狀況良好”。
當承運人簽發了清潔提單以後，就不能再主張：“因包裝不堅固發生貨損，承運人不承擔賠償責任”。如果承運人主張“因包裝不堅固發生貨損，承運人不承擔賠償責任”，必須在提單上批注包裝有瑕疵。
