基本内容
工程系包括土木工程系、化學工程系、電子與信息工程系、生物工程系、熱能工程系、計算機科學與工程系、汽車工程系、機械工程系等等。
土木工程系
土木工程系是一個建築學裡的前期專業學科。它包含了很多内容，很多專業知識。大學裡主要課程有理論力學、材料力學、結構力學、土力學、水力學、工程地質、土木工程材料、工程測量、混凝土結構、鋼結構、高層結構、地下結構、橋梁結構、道路勘測設計、水工結構、結構實驗、施工技術及組織。
開設課程 : 力學、土木工程、水利工程。主要課程：工程力學、流體力學、岩士力學、地基與基礎、工程地質學、工程水文學、工程制圖、計算機應用、建築材料、混凝土結構、鋼結構、工程結構、給水排水工程、施工技術與管理。
化學工程系
清華大學化學工程系始建于1946年，在半個多世紀的發展中曾進行過若幹次調整，目前按照“厚基礎寬專業”思想在系内設立化學工程與工業生物工程、高分子 材料與工程兩個專業，主要學科方向包括化學工程（含反應工程、分離工程、化工熱力學）、過程與系統工程、生物化工、應用化學、高分子材料與化工。
電子與信息工程系
電子與信息工程系，簡稱電信系。主要課程有電路與系統、通信軟件與交換技術、信号處理與智能技術、寬帶無線與多媒體系統、軍事通信與信息技術、互聯網技術與工程、微波與信息網絡、數字視頻技術與通信、圖像處理與智能信息系統。
生物工程系
生物工程是工程科學與生命科學相互滲透、融合的一門重要的交叉學科。在空天領域，存在着大量的生物與醫學工程問題，例如，飛行員逃生的生物力學問題、駕駛艙的工效問題、超重的抗荷問題等；航天員較長期空間飛行導緻的心血管功能障礙、骨質丢失、肌肉萎縮、免疫功能下降、内分泌紊亂等多種生理病理變化等問題。因此，航空航天生物與醫學工程及空間生命科學是本世紀及未來探索和研究的熱點，其研究成果及相關技術不僅直接關乎宇航員、飛行員的生命保障和支持，還能為人類的健康服務。
熱能工程系
熱能工程系是能源與動力工程學院下的教學、科研單位，培養從事船舶動力裝置設計、空調系統設計、研究、制造以及能源綜合利用的高級工程技術人才。以船舶動力設備、空調系統設備、工業鍋爐和換熱設備的設計、研究為主，同時研究開發熱能轉換、能源利用、環境保護以及節能技術。
計算機科學與工程系
計算機科學與工程系，是培養符合教育部門實際需要的計算機教學及應用管理方面的。專業課程有離散數學、數據結構、計算機組成原理、操作系統、編譯原理、數據庫原理、面向對象程序設計(C#/Java/C++)、計算機網絡技術、統一建模語言及建模工具（UML）、面向對象系統分析設計、J2EE架構與程序設計、.NET架構與程序設計、軟件測試方法與技術、軟件項目管理等。
汽車工程系
汽車工程系設置的車輛工程、動力機械及工程學科均為國家重點學科。車輛工程（汽車工程）專業：以汽車車身及底盤、汽車電子控制、人機環境的研究與産品開發等為主要學習内容，主要專業課程有汽車構造、汽車理論、汽車設計、汽車空氣動力學、車身結構與設計、汽車電子控制技術、振動與噪聲控制、CAD/CAM技術、現代汽車制造工藝學、汽車複蓋件成型技術等。
熱能與動力工程（汽車内燃機）專業：以汽車發動機設計開發、電子控制、燃燒排放控制的研究與産品開發等為主要學習内容，主要專業課程有内燃機原理與結構、内燃機設計、内燃機排放及其控制、熱力學、工程流體力學、内燃機測試技術、電工電子技術、内燃機電子控制技術等。
交通運輸（汽車運用工程）專業：以汽車、發動機故障診斷與檢測和交通安全與管理的研究與産品開發等為主要學習内容，主要專業課程有汽車構造、汽車理論、汽車設計、汽車電子學、汽車運用工程基礎、汽車診斷與檢測技術、汽車運輸與維修企業管理、汽車交易與管理、現代設計理論與方法等。
機械工程系
主要課程有機械制圖與計算機繪圖、電工電子基礎、工程力學、機械設計基礎、液壓與氣動技術、液力傳動技術、控制工程基礎、工程機械控制技術、工程測試技術、工程設備、工程機械維修。主要實踐訓練：鉗工、機械加工實習，電工、電子實訓、計算機繪圖實訓、液壓與氣動實訓、工程設備實訓、工程機械控制技術實訓、工程機械修理實訓、機電技術綜合實訓。
