紀年
庚申年（猴年）
東漢永平三年
大事
春，二月，甲寅，太尉趙熹、司徒李免。丙辰，以左馮郭丹為司徒。己未，以南陽太守虞延為太尉。
春季，二月甲寅（初九），将太尉趙熹、司徒李免職。二月丙辰（十一日），任命左馮翊郭丹為司徒。二月己未（十四日），任命南陽太守虞延為太尉。
甲子，立貴人馬氏為皇後，皇子為太子。
二月甲子（十九日），将貴人馬氏立為皇後，皇子劉立為太子。
後，援之女也，光武時，以選入太子宮，能奉承陰後，傍接同列，禮則修備，上下安之，遂見寵異；及帝即位，為貴人。時後前母姊女賈氏亦以選入，生皇子；帝以後無子，命養之，謂曰：“人未必當自生子，但患愛養不至耳！”後于是盡心撫育，勞悴過于所生。太子亦孝性淳笃，母子慈愛，始終無纖介之間。後常以皇嗣未廣，薦達左右，若恐不及。後宮有進見者，每加慰納；若數所寵引，辄加隆遇。
馬皇後是馬援的女兒，光武帝時被選入太子宮。她能夠侍奉順承陰皇後，和同輩友好相處，禮數周全，上下和睦，于是特别受到寵幸。及至明帝即位，便将她立為貴人。當初，她的異母姐姐的女兒賈氏也被選入太子宮，生下兒子劉。明帝因馬氏沒有兒子，便命她抱養劉，對她說：“人不一定非得親自生兒子，隻擔心愛心不夠、養護不周罷了。”于是馬氏全心全意地撫育劉，操勞辛苦勝過親母對待親子。劉也天性孝順，于是母慈子愛，兩人始終親密無間。馬氏常因明帝子嗣不多，向明帝推薦左右的美女，唯恐做的不周全。每當後宮有人陪伴了明帝，她總是加以慰存和接見；若是有人被多次召幸，便給予崇厚的待遇。
及有司奏立長秋宮，帝未有所言，皇太後曰：“馬貴人德冠後宮，即其人也。”後既正位宮闱，愈自謙肅，好讀書。常衣大煉，裙不加緣；朔望諸姬主朝請，望見後袍衣疏粗，以為绮，就視，乃笑。後曰：“此缯特宜染色，故用之耳。”群臣奏事有難平者，帝數以試後，後辄分解趣理，各得其情，然未嘗以家私幹政事。帝由是寵敬，始終無衰焉。
及至有關官員上書建議選立皇後，明帝還沒有開口，陰太後便說：“馬貴人在後宮中品德最佳，就選這個人吧。”馬氏登上皇後之位以後，越發自謙莊重，愛好讀書。她常穿粗絲之服，裙腳不加邊緣。每月初一、十五，嫔妃和公主們入宮請安，遠遠看見皇後衣着簡單粗糙，還以為是特制的絲綢，走近一看，才笑了起來。皇後道：“這種綢料特别适于染色，所以用它。”百官上書中有難以決定的事項，明帝曾多次用來試驗皇後的才識。皇後便分析推理，一一得到了真實情況。然而她從不為家人私情幹預政事。明帝因此對她既寵愛，又敬重，始終不衰。
帝思中興功臣，乃圖畫二十八将于南宮雲台，以鄧禹為首，次馬成、呈漢、王梁、賈複、陳俊、耿、杜茂、寇恂、傅俊、岑彭、堅镡、馮異、王霸、朱祜、任光、祭遵、李忠、景丹、萬、蓋延、邳肜、铫期、劉植、耿純、臧宮、馬武、劉隆；又益以王常、李通、窦融、卓茂，合三十二人。馬援以椒房之親，獨不與焉。
明帝懷念創立東漢中興大業的功臣，于是在南宮雲台畫上二十八位将領的肖像。鄧禹居第一位，以下是馬成、吳漢、王梁、賈複、陳俊、耿、杜茂、寇恂、傅俊、岑彭、堅镡、馮異、王霸、朱祜、任光、祭遵、李忠、景丹、萬、蓋延、邳肜、铫期、劉植、耿純、臧宮、馬武、劉隆。又增補王常、李通、窦融、卓茂，共計三十二人。因為馬援是皇後之父，所以唯獨他不在其内。
夏，四月，辛酉，封皇子建為千乘王，羨為廣平王。
夏季，四月辛酉（十七日），将皇子劉建封為千乘王，劉羨封為廣平王。
六月，丁卯，有星孛于天船北。
六月丁卯（二十四日），天船星座北方出現異星。
帝大起北宮。時天旱，尚書仆射會稽鐘離意詣阙、免冠、上疏曰：“昔成湯遭旱，以六事自責曰：‘政不節邪？使民疾邪？宮室營邪？女谒盛邪？苞苴行邪？讒夫昌邪？’竊見北宮大作，民失農時；自古非苦宮室小狹，但患民不安甯，宜且罷止，以應天心”帝策诏報曰：“湯引六事，咎在一人，其冠、履，勿謝！”又敕大匠止作諸宮，減省不急。诏因謝公卿百僚，遂應時澍雨。
明帝大興土木，興建北宮。當時正逢天旱，尚書仆射會稽人種離意來到皇宮門前，摘去官帽，上書道：“人前商湯遇到旱災，曾用六件事責問自己：‘是執政用權不節制嗎？是使用民力過度嗎？是修建宮殿建築太多嗎？是女人、宦官掌權嗎？是賄賂貪污盛行嗎？是進讒言的小人得勢嗎？’如今，我看到正在大修北宮，農民不能适時耕作。自古以來，憂患之事不是宮室狹小，隻是擔心人民不安。應當暫且停止修建北宮，以順應天心。”明帝下诏答複道：“商湯提到的六件事，錯誤隻在一人身上。鐘離意可以戴上官帽，穿上鞋，不要請罪！”并命令大匠停止營建一切宮室，減少不急的開支。他還因此下诏向公卿和百官謝罪，承認過失。于是上天應時降雨。
意薦全椒長劉平，诏征拜議郎。平在全椒，政有恩惠，民或增赀就賦，或減年從役，刺史、太守行部，獄無系囚，人自以得所，不知所問，唯班诏書而去。
鐘離意向朝廷舉薦全椒縣長劉平，明帝下诏将劉平征召入京，任命為議郎。劉平在全椒主持政務時施惠于民，當地百姓中，有人增報資産以多納賦稅，有人自減年齡來主動服役。刺史、太守等州郡官員到縣視察，發現監獄中沒有羁押的囚犯，百姓認為各得其所。因找不出有何問題應當查問，隻得宣布诏書，然後離去。
帝性褊察，好以耳目隐發為明，公卿大臣數被诋毀，近臣尚書以下至見提曳。常以事怒郎藥崧，以杖撞之，崧走入床下，帝怒甚，疾言曰：“郎出！”崧乃曰：“天子穆穆，諸侯皇皇，未聞人君，自起撞郎。”帝乃赦之。
明帝性情狹隘而苛察，好用耳目窺探群臣的隐私，認為這就是英明。公卿等高級官員屢屢被辱罵，陪伴近側的尚書以下官員甚至遭到毆打。明帝曾因事對郎官藥崧發火，用手杖責打藥菘。藥崧逃跑，躲到床下。明帝十分憤怒，厲聲喊道：“郎官出來！”藥崧便說：“‘天子穆穆，諸侯皇皇’，哪有皇上，動手打郎！”明帝這才将他放過。
是時朝廷莫不悚栗，争為嚴切以避誅責，唯鐘離意獨敢谏争，數封還诏書，臣下過失，辄救解之。會連有變異，上疏曰：“陛下敬畏鬼神，憂恤黎元，而天氣未和，寒暑違節者，咎在群臣不能宣化治職，而以苛刻為俗，百官無相親之心，吏民無雍雍之志，至于感逆和氣，以緻天災。百姓可以德勝，難以力服，《鹿鳴》之詩必言宴樂者，以人神之心洽，然後天氣和也，願陛下垂聖德，緩刑罰，順時氣以調陰陽。”帝雖不能時用，然知其至誠，終愛厚之。
當時朝中群臣無不膽戰心驚，争着表現出嚴厲苛刻的态度，以逃避誅殺或斥責。唯獨鐘離意敢于同明帝争辯，直言勸谏，屢次将他認為不妥的诏書封起來奉還。官員有了過錯，他便設法解救。适逢天象接連出現怪異，鐘離意上書道：“陛下尊敬畏懼鬼神，憐憫體恤百姓，然而卻出現氣候失調，寒暑不合時令的現象，其過錯在于百官不能推廣皇恩和盡到職守，而以苛刻作為時尚。群臣之間沒有相親的心願，官民之間沒有諧調的感情，以至影響違逆了祥和之氣，招緻天災。百姓可以用恩德來感化，卻難以用強力來壓服。《詩經·鹿鳴》之詩一定要提到歡宴的緣故，是由于人神之心相通，然後氣候才能調和。希望陛下賜恩德，寬刑罰，使天時之氣和順，以諧調陰陽。”明帝雖未采納鐘離意的建議，但知道他是出于至誠之心，因而始終愛護和厚待他。
秋，八月，戊辰，诏改太樂官曰太予，用谶文也。
秋季，八月戊辰（二十五日），明帝下诏：依照谶文，将太樂官改稱為太予。
壬申晦，日有食之。诏曰：“昔楚莊無災，以緻戒懼，魯哀禍大，天不降譴。今之動變，傥尚可救，有司勉思厥職，以匡無德！”
壬申晦（疑誤），出現日食，明帝下诏：“從前楚莊王因本國無災而生怕上天遺忘了自己，以至生出警戒恐懼之心；魯哀公昏庸亂政，但因無可挽救，上天也沒有降下災異進行譴責。如今出現了日食，表示我們或許還可以救藥。各部門主管官員要努力盡心于職責，以助我完成天子的重任！”
冬，十月，甲子，車駕從皇太後幸章陵。荊州刺史郭賀，官有殊政，上賜以三公之服，黼黻、冕旒；敕行部去帷，使百姓見其容服，以章有德。戊辰，還自章陵。
冬季，十月甲子（二十二日），明帝随同皇太後臨幸章陵縣。荊州刺史郭賀政績優異，明帝賜給他三公穿用的禮服，上面繡有黑白相間的斧形花紋和黑青相間的雙“己”形花紋，并賜給他懸有七條玉串的禮冠。命郭賀在巡行所部時除去車前的簾帳，讓百姓觀瞻儀容服飾，以表彰他的德行。十月戊辰，明帝一行從章陵返回京城。
是歲，京師及郡國七大水。
本年，京城洛陽及七個郡和封國發生水災。
莎車王賢以兵威逼奪于、大宛、妫塞王國，使其将守之。于人殺其将君德，立大人休莫霸為王，賢率諸國兵數萬擊之，大為休莫霸所敗，脫身走還。休莫霸進圍莎車，中流矢死，于人複立其兄子廣德為王，廣德使其弟仁攻賢。廣德父先拘在莎車，賢乃歸其父，以女妻之，與之和親。
莎車國王賢用武力強占了于阗、大宛、妫塞等三王國，派莎車将領鎮守。于阗人殺死了莎車守将君德，擁立本族首領休莫霸為王。于是賢率領西域各國數萬兵衆攻打于阗，卻被休莫霸大敗，賢脫身逃回到本國。休莫霸進軍包圍莎車，身中流箭而死。于是于阗人又推立休莫霸哥哥的兒子廣德為王。廣德便派弟弟仁去攻打賢。廣德的父親先前被扣在莎車，至此，賢便送還廣德之父，并将自己的女兒嫁給他做妻子，同于阗建立了和親關系。
