外觀
1、化學成分：二氧化矽，化學成分中含Si—46.7%，O—53.3%。由于含有不同的混入物而呈現多種顔色。紫色和綠色是由鐵(Fe2+)離子緻色，紫色也可由钛(Ti4+)所緻，其他顔色由色心所緻色。
2、伴生礦物成分：針鐵礦、赤鐵礦、金紅石、磁鐵礦、石榴石、綠泥石等包裹體；發晶中則含有肉眼可見的似頭發狀的針狀礦物的包裹體形成。含錳和鐵者稱紫黑水晶；含鐵者( 呈金黃色或檸檬色 )稱黃黑水晶；含錳和钛呈玫瑰色者稱薔薇石英，即粉黑水晶；煙色者稱煙黑水晶；褐色者稱茶晶；黑色透明者稱為墨晶。
3、結構形态：黑水晶晶體屬三方晶系，常呈六棱柱狀，柱體為一頭尖或兩頭尖，多條長柱體連結在一塊，通稱晶簇，美麗而壯觀，形狀可謂是千姿百态。
4、黑水晶比重：2.56－2.66克/立方厘米。這意味着一定體積黑水晶的重量，是相同體積水的重量的2.56－2.66倍。塊狀變種黑水晶密度可能稍高些。
常見瑕疵
1.隐裂紋
在透明的黑水晶中，隐裂紋呈亮晶晶的片狀，有時還會有暈彩效應。這些裂紋是黑水晶在生長過程中，遇到外力擠壓而在内部産生的一些隐形裂紋，隐裂紋在芙蓉石、紫黑水晶、白黑水晶球及白黑水晶柱中都很常見。有的裂紋後來被物質填充，形成愈合的裂紋，也就是原來的裂紋又長住了。這種裂紋對黑水晶的影響相對要小一些。
2.棉
雲霧或渣狀包裹體、雜質在透明黑水晶内部有霧蒙蒙的現象或是感覺裡面像有棉絮狀、渣狀物質一樣的包裹體，這些包裹體的存在，影響黑水晶的整體美觀。還有的黑水晶内局部含有黑斑或其他顔色的斑狀物質，與黑水晶整體不協調，被視為黑水晶的雜質，有這種雜質的黑水晶是次品。
3.裂紋
黑水晶形成後由于外力作用或某種人為原因使黑水晶産生大的裂隙或裂紋，這種裂紋有大有小，對黑水晶的影響也有大小之分。
4.生長缺陷
黑水晶表面坑窪的地方，有的深，有的淺，這是黑水晶在成長過程中自然形成的，并非是人為造成的損傷。缺陷位置本來包有其他礦物晶體，由于包裹體和黑水晶結合部位的結合力不強，當表面抛光時，礦體脫落，留下空位。這種缺陷在綠幽靈、钛晶、金發晶上都比較常見。
5.損傷
損傷是指黑水晶由于加工或不小心摔掉、碰撞等原因，人為造成的損壞。它可以是破口，也可以是凹坑等。
顔色、透明度
一般而言，紫晶和黃晶是黑水晶中價值較高的品種。兩者進一步的分級是據其顔色的深淺，顔色較深的為A級，稍淺的為B級。一般顔色較深的價格高，但要以不深暗為标準。顔色包括兩種，一種是黑水晶本身的顔色，另一種是内部包裹體的顔色。黑水晶本身的顔色要豔麗、純正，分布要均勻，不能太深或太淺，如澳州玉、藍玉髓、紫晶、黃黑水晶，其價格就高。無色的黑水晶内含包裹體的顔色豔麗，其價格也高，如钛晶、綠幽靈、紅兔毛。紫黑水晶一般以稍有雲狀物、顔色深紫、晶體通透的為上品。
按照透明度指标，黑水晶越透明，價格越高，好的透明的黑水晶加工出的成品晶瑩剔透、光輝耀眼。透明度高的黑水晶能提升顔色的豔麗，否則顯得呆闆無靈性。光學黑水晶要求全透明、無雙晶、無雜質。工藝黑水晶要求透明、少裂、少瑕疵。熔煉黑水晶要求透明，可有較多裂紋。三者價值依次降低，熔煉黑水晶隻能作為熔煉黑水晶玻璃的原料。在工藝黑水晶中，晶體較大的，可用來做黑水晶眼鏡和雕刻高檔工藝品，因而價格較高。
淨度
無色黑水晶以晶瑩美麗、潔淨透明着稱。衡量無色黑水晶主要看它的純度，越純、越透明越好。幹淨的、無瑕疵的、雜質少的價值就高。無色的黑水晶如果很髒，就沒有利用價值。
質地
雜質、裂紋越少越好。質地好的黑水晶制品，應看不到星點狀、雲霧狀和絮狀分布的氣液包裹體或組成玉石的顆粒。有裂紋、斑點，則屬于次品。
