曆史沿革
2001年，中華人民共和國政府決定在福建省決定建設一條城際間快速鐵路通道——福廈鐵路，途經莆田市設站。
2004年7月，經中華人民共和國國務院批準，福廈鐵路正式立項。
2005年7月，中華人民共和國國家發展和改革委員會批準《福廈鐵路可行性研究報告》，在莆田市秀嶼區笏石鎮設置莆田站。
2007年，原中華人民共和國鐵道部規劃鐵路地級市全覆蓋，新建西起江西省南昌市至福建省莆田市鐵路終于莆田站，為國家一級快速鐵路幹線，工程名字為向莆鐵路；同年11月24日，江西向塘至福建莆田鐵路開工建設。
2008年11月23日，莆田站站房建築設計方案經原中華人民共和國鐵道部審查通過。
2009年5月22日，莆田站站房工程舉行開工典禮；同年12月31日，莆田站投入貨運運營。
2010年4月26日，莆田站投入客運運營。
2013年1月，新建的江西向塘和福建莆田之間的向莆鐵路被原中華人民共和國鐵道部正式命名為昌福線和永莆線，永莆鐵路終于莆田站；同年9月30日，昌福鐵路、永莆鐵路竣工通車；同年12月17日，杭甬鐵路、甬溫鐵路、溫福鐵路、福廈鐵路、廈深鐵路整體合并為杭深鐵路，莆田站成為杭深鐵路與永莆鐵路的交彙站。
2015年10月22日，根據新建福州站（含）至漳州站（含）客運專線大緻确定的走向和沿途設站規劃，莆田站為其途經站。
2019年12月30日起，莆田站開始推行電子客票，旅客無需取票，刷證即可乘車。
建築規模
建築設計
莆田站設計借用莆田濱海特色、媽祖文化特色、對台特色以及莆田民俗風格，外立面為玻璃幕牆，内裝飾以福建花崗岩及鋁闆為主要材料，總體造型有“媽祖文化”、“閩南文化”、“海濱文化”等元素。
截至2010年4月，莆田站總建築面積3.0522萬平方米，售票大廳約500多平方米，雨棚面積3.47萬平方米，建築總高度31米；設計最高聚集旅客數5000人。
整體布局
截至2010年4月，莆田站站房采取線側平式，豎向分為出站層、站台層和進站層三個層面，其中出站層為一層地下室。莆田站左側售票大廳共設置了13個人工售票窗口。莆田站的檢票口設在候車大廳靠站台的一邊，其中一樓有5個檢票口，二樓有5個。
截至2017年1月，莆田站出站設有綜合交通樞紐，地下一層設有商業設施，地上一層為候車大廳，二層為辦公區。地上三層、四層暫未投用。一層候車廳設10個檢票口。
站台線路
截至2010年4月，莆田站擁有3台10線，設到發線10條，基本站台一座和中間站台2座，途經莆田站的線路有杭深鐵路福廈段和永莆鐵路。
價值意義
莆田站使莆田融入海峽西岸經濟區的一條重要生命線，承載着莆田人民騰飛夢想的沿海大動脈，猶如一條氣勢如虹的鋼鐵巨龍，讓莆田人民的百年夙願成為現實。莆田站有力地推動湄洲灣港口城市持續提升、蓬勃發展，有力地推動海峽西岸經濟區趁勢而上、加快發展，有力地推動海峽兩岸交流合作、繁榮發展，為促進祖國和平統一大業作出更大的貢獻。（《湄洲日報》評）
莆田站使媽祖故裡莆田從此将徹底告别“手無寸鐵”、沒有鐵路的曆史，駛上加快發展的快車道。（東南網評）市
