人物生平
笹井出生于日本兵庫縣，1986年自京都大學醫學系畢業，36歲成為了京都大學再生醫科學研究所教授。2003年他轉入理化學研究所，并從2013年起擔任副主任。笹井是英國科學家-2012年諾貝爾獎得主格登的再傳弟子。他從胚胎幹細胞（ES細胞）制作出的立體的大腦及眼部組織引起了巨大反響。
2013年，笹井被選為使用ES細胞、誘導多功能幹細胞（iPS細胞）治療眼部疾病的日本國家級項目負責人，積極推動研究成果的醫療應用。[笹井芳樹是神經系統初期發生遺傳基因及細胞研究者；世界上首次成功通過ES細胞分化誘導出網膜，生成立體網膜。之後笹井又通過ES細胞成功分化誘導出下丘腦前駆細胞、形成立體的腦下垂體，獲得井上學術獎、山崎貞一獎、武田醫學獎、上原獎等衆多殊榮。
自缢身亡
2014年8月5日上午，日本著名科學家笹井芳樹（YoshikiSasai）在研究所附近懸梁自盡，時年52歲。終年52歲。笹井是被稱作“日本居裡夫人”的小保方晴子的導師，也是後者被質疑造假的論文的共同通訊作者。他的死在日本掀起輿論風波。
笹井身為日本理化學研究所發生與再生科學綜合研究中心副主任的笹井芳樹是再生醫學領域的世界級學者。他是“日本居裡夫人”小保方晴子受學術造假質疑的STAP細胞(新型萬能細胞)論文的共同通訊作者。
