目的任務
加強上海合作組織成員國間的互信和睦鄰友好關系；
推動在教育、科研和技術領域裡的一體化進程；
為拓展教育、科研、文化合作增添新的動力；
為青年人接受高質量的現代化高等教育，為教師和科研人員開展學術交流提供更多的機會；
促進上海合作組織成員國間在政治、經濟貿易、科學技術和文化領域裡的合作，使其更加富有成效。
基本原則
上合大學是由上海合作組織成員國各方的部分高校（以下簡稱：項目院校）組成的項目院校網絡。項目院校依據所簽署的協議開展以下工作：開展學生、教師和科研人員的交流工作；擴大教學和科研合作；采用現代先進的教學方法和技術；建立上海合作組織成員國間及與其他國家間對等承認上合大學文憑的機制。
上合大學項目院校應秉承以下原則：所有上合大學項目院校享有平等權利，在相互理解、相互尊重各方意見的基礎上開展合作；在各方均感興趣的領域分階段采取共同行動；認真負責地完成本章程及在上合組織框架内簽署的其他相關文件規定的責任和義務。
合作方向
上合大學項目院校的主要合作方向為：按照商定的聯合培養方案培養高水平人才，其中包括：
本科學士；
碩士研究生；
雙方協議中規定的副博士研究生/博士研究生/哲學博士研究生；
進修班、培訓班；
制定和實施聯合培養方案；
開展本科生、碩士研究生、副博士研究生、博士研究生、教師、科研和行政管理人員的交流活動；
聯合組織和開展科學研究和科研項目；
聯合舉辦國際研讨會、學術研讨會等活動。
人才培養
根據上合組織成員國的需求，确定以下聯合培養方向：區域學；生态學；能源學；IT技術；納米技術；經濟學；教育學。
經上合組織成員國教育部門協商後，可增加其他培養方向，并商定專業數量。每個培養方向各設一個上海合作組織大學項目院校專家工作組，負責協調教學模塊和培養方案。
教學語言
上合大學框架内的主要教學語言為上合組織的官方語言：漢語和俄語，亦可是學校所在國的官方語言。
經商定在教學中亦可使用英語。
專業設置
上合大學框架内的專業設置為項目院校根據聯合培養計劃開展培養高水平人才的教學提供了可行性。
聯合培養方案規定招生、教學、階段考試和畢業考試、教學大綱和教學計劃的協調和同步實施的方法、學習期限等。
學曆證書
在上合大學框架内接受教育的學生，結束學業并通過相關考試後，可獲得所在上合大學項目院校頒發的證書和上合大學頒發的學曆證書。
上合組織成員國教育部長會議，上合大學校長委員會會議審議通過，并在紀要中确認了上合大學學曆證書的樣本。
機構設置
協調委員會：上合大學成員國可各派一名教育機構主管教育合作的領導（可以是副部長，可以是上合成員國教育專家組組長），亦可派各國上合大學項目院校校長委員會主席組成協調委員會。協調委員會實行輪值主席制。協調委員會委員負責協調上合大學與各教育部、上海合作組織相關機構的聯絡工作，負責為上合大學提供法律保障等方面的建議。協調委員會成員不少于15人。協調委員會可根據需要舉行會議（一年至少一次）。
監察委員會：監察委員會根據上合大學項目院校的建議成立，由上海合作組織成員國的社會各界代表組成。監察委員會的人員構成由上合組織成員國教育部長會議協商并簽署協定确認。監察委員會的職責：樹立上合大學在上海合作組織成員國和世界各國教育界的良好形象；吸引商業機構參與共同培養人才，協助畢業生就業；吸納用于上合大學發展的資金；保障上合大學在各國有和非國有機構、基金會和組織中的利益。
上合大學校辦：上合大學校辦是保障教學、科研和日常管理工作的常設機構。每年經全體上合大學項目院校共同商定，上合大學校辦的職能移交給下一個上合大學項目院校行使。校辦的人員構成由上合大學相關項目院校确定。上合大學校辦負責上合大學的日常管理工作，包括：信息收集分析工作、法律保障和财務管理工作、日常管理和起草文件。上合大學校辦由上海合作組織各成員國負責教育的專家構成。
各培養方向的上海合作組織大學項目院校專家委員會：簽署聯合培養方案的各項目院校派一名代表加入各培養方向專家工作組工作。專家組成員和專家組組織工作規範需由上合大學項目院校各方全權代表審議決定，并簽署協議确認。專家工作組應協助搞好各培養方向的教學和科研工作。
發展策略
進一步提升上合大學的知名度和吸引力。上合組織在當前的國際舞台上的作用和地位得到不斷的提升和凸顯。上合組織成員國之間的合作正在從單一的經濟合作走向政治、經濟、文化教育等領域的全方位合作。作為一所區域性的國際大學聯盟，上合大學作為上合組織成員國教育領域合作的一個重要平台，所複蓋的面積與人口都是無可比拟的，具有廣闊的發展前景和發展空間。因此，進一步擴大其知名度，充分顯現出上合大學的優勢和前景，有助于上合大學的未來發展，吸引更多更優秀的學生參與到上合大學的人才培養計劃中。
求同存異，共謀發展。由于中國教育體系與上合組織成員國其他國家的教育體系比較而言，依然存在一定的差異性，這也是當前部分院校間合作運行機制不暢的重要原因。大凡合作就有共同利益也必然存在差異，任何成功的合作都是建立在求同存異的基礎上。在上合大學發展過程中，如何求同存異，探求合理有效合作途徑是推進上合大學穩步發展的重要保障。
積極調動項目院校的主動性，充分利用項目院校間原有的優質合作，拓展上合組織大學項目院校間合作的方向。例如，中國長春理工大學作為上合組織大學中方項目院校與俄羅斯聖彼得堡國立信息技術機械與光學大學在IT技術和納米技術開展合作。同時，兩校在在光子學與生物技術方向有近半個世紀的良好合作基礎，雙方一緻同意向各自國家教育部申請在上合組織大學增設光子學與生物技術方向。中方支持項目院校的這種合作嘗試。
各國政府的政策導向是上合大學穩步推進的重要推動力。中國政府給予的獎學金政策有力地推動了上合大學初始階段的發展，但要保障上合大學健康、有序、可持續發展，需要上合組織成員國政府在資金以及招生、培養等政策上予以更多的支持和扶持。
支持上合組織大學間的全方位合作，特别是導師間的科研合作。在上合大學創建的初期階段，導師之間的合作可以有效帶動學生的聯合培養工作的開展，尤其是高層次人才的聯合培養工作可以在導師之間的科研合作之中得以深化。
啟動本科生招生試點工作。本科人才聯合培養機制的形成是構建上合大學人才培養體系的基礎，啟動本科生招生試點工作，有利于提升上合大學的影響力，有利于促進各國項目院校間合作機制的形成，有利于碩士、博士層面聯合培養項目人才的選拔，有利于提高上合大學人才培養的質量。建議在區域學等部分專業方向現行進行試點招生工作，待條件成熟之後全面鋪開。
嘗試在中國建設上合實體大學。為了保持上合大學的可持續性發展，中方目前正在論證拟在大連旅順地區建設上合大學（中國）的實體大學。未來上合大學的中外方學生将在這裡進行語言培訓，專業選擇，根據不同專業及各項目院校的不同學科專業優勢，将學生分流至不同項目學校進行相關專業學習。碩士階段完全進入上合大學碩士層面人才培養計劃，可以繼續完成博士層面的上合大學人才培養計劃。上合實體大學的建立，将極大地保證上合大學的可持續發展，形成完備的人才培養體系以及多元化的人才培養模式。
積極推動上合大學校長辦公室實體化進程。随着上海合作組織的不斷發展和壯大，為了更好地發揮上海合作組織的平台作用，中國政府在北京為上合組織秘書處批建了一棟秘書處大樓。建議在上海合作組織秘書處大樓為上合大學設置辦公室，由上合大學各成員國校長辦公室派出工作人員組成上合組織大學國際校辦，在秘書處集中辦公。形成實體化的上合大學校長辦公室，以起到以下的作用：1）可有效宣傳上合大學。除網上宣傳外，開展有實體的各種展覽，比如：上合大學發展曆程的圖片展、上合大學辦學成就展、上合大學人才培養成就展等。2）進一步密切各成員國項目院校之間的聯系與合作。各國分别派代表在秘書處上合大學辦公室常駐，各國之間的交流可以實現面對面的交流，有效解決上合大學發展過程中遇到的系列問題，對提高上合大學的工作效率，完善其工作機制有着不可估量的作用。3）進一步凸顯上合大學的重要作用。上合大學是上合組織教育領域合作的重要組成部分，在培養上合組織急需的人才方面起着其他教育領域合作項目無法替代的作用。沒有任何實體性質的網絡化大學在某種程度上會削減其在人們心目中的地位和作用，也會直接影響到其實際所發揮的作用。将上合大學辦公室置于上合組織秘書處本身就提升了上合大學的國際地位，更加符合上合大學的發展需求和發展前景。
