濕地結構
鄱陽湖國家濕地公園濕地面積計算是按照鄱陽湖在常水位下的現狀進行的。地總面積為35116.1公頃，占土地總面積的96.8%。其中，天然濕地面積為34126.0公頃，占濕地總面積和土地總面積的97.2%和94.0%，人工濕地面積為990.1公頃，占濕地總面積和土地總面積的2.8%和2.8%。在天然濕地中，湖泊、河流、草洲、泥灘、島嶼和泛濫地面積分别為12920.9公頃、1125.8公頃、4312.2公頃、13624.5公頃、276.0公頃和1866.6公頃，占濕地總面積的比例分别為36.8%、3.2%、12.3%、38.8%、0.8%和5.3%。在人工濕地中，池塘濕地、灌溉地面積分别為275.9公頃、714.2公頃，占濕地總面積的比例分别為0.8%和2.0%。
地質地貌
濕地公園位于東南地窪區贛桂地窪系東北端。元古代起進入地槽階段。震旦紀後期地槽封閉為陸台。志留紀至下泥盆紀，形成了北北東——南南西向褶皺狀山脈。
石炭紀至二疊紀，地殼下降。二疊紀末、三疊紀初，海西運動發生。三疊紀中，南部、中部下沉，形成砂頁岩含煤建造。侏羅紀末，發生燕山運動，伴随激烈的火成岩活動。白垩紀開始，地殼活動更加強烈，西南部急速下降，末期燕山運動結束，地殼又急速上升，至第四紀，地殼活動以升降為主，湖濱及各支流堆積不等的沖積、淤積層。各期地層，除古代部分缺失外，均有出露。
濕地公園主要由低山、丘陵和平原組成。西南角最低，為鄱陽湖盆地。以高程和成因為主要依據，濕地公園地貌具體分為三類：構造剝蝕低山丘陵區高程在100～200米之間，最高峰為尖頂峰，海拔124.8米；侵蝕剝蝕壟崗區高程在50～100米之間，岩底有變質岩、沉積岩、紅色砂岩三種；堆積平原高程在50米以下，包括河谷沖積平原、三角洲平原、淤積平原三種。
土壤質地
濕地公園屬于鄱陽湖盆地，是江西第四系沉積中心，以河流、湖泊相沉積為主，沉積物粒度總的趨勢是自下而上由粗變細。一般厚度變化規律是河谷向湖區增大，厚度約為30～40米，在三角洲前緣可達76米。區内基本為三角洲平原，主要分布比較均一的壤土質地。
土壤類型與分布
濕地公園内主要發育有5種土壤類型：紅壤（棕紅壤）、水稻土、黃褐土、沖積土和潮土(濕潮土)，其分布與高程和微地形有關，由湖岸向湖心成帶狀分異基礎上的鑲嵌分布。
水文水系
濕地公園内水系發達，較大的河流和湖泊有：
饒河：樂安河、昌江總稱，江西五大河流之一。流域面積15428平方公裡。
昌江：饒河主要支流，位于濕地公園南部。流域面積6220平方公裡。主河道全長276公裡。其中鄱陽縣縣境内流域面積963平方公裡，河道長52公裡。
鄱陽湖：是贛江、撫河、信江、饒河、鄱陽湖五大河流的入長江總彙，江西省向心水系中心。鄱陽縣處于鄱陽湖濱，湖岸線長100多公裡，湖東北約313平方公裡的水域在縣境範圍之内。
珠湖：位于鄱陽中部，鄱陽湖東緣。湖内港汊衆多，有所謂“四十八大汊”、“八十四小汊”。湖面面積62000畝，一般水深4米，最大深度10米以上。
各河流上、中遊年最高水位多出現在5至6月，下遊受鄱陽湖頂托影響，年最高水位多出現在7至8月。年最低水位出現在12月或次年1月。水位年變幅，一般為6～8米。
氣候特征
地處亞熱帶地區，氣候溫和，雨量充沛，四季分明，日照充足，無霜期長。
氣溫：年均氣溫16.9℃～17.7℃之間。七月份氣溫最高，平均氣溫29.6℃，極端最高氣溫39.7℃；一月份氣溫最低，平均氣溫5.0℃，極端最低氣溫為-13.3℃。
日照：濕地公園屬光資源豐富的地區。年平均日照時數達2000小時以上，日照百分率平均為40%以上。日照最多月份為7～8月，日照最少月份為2～3月，太陽輻射量年平均115.6千卡/平方厘米。
風：冬季受大陸高壓影響，地面多為偏北風。夏季受副熱帶高壓控制，偶有台風影響，地面多偏南風。春秋為過渡性季節，偏北風和偏南風可以互見，但以東北風為主，西北風也時有可見。平均風速3.0米/秒，最大風速為30米/秒，各月風速2.5～3.7米/秒。年平均大風日數9.7日。
降雨：降雨受季風氣候的影響，夏季明顯多于冬季。年平均降雨量1600毫米。降水量年際變化大，降水季節也差異很大。年平均降水日為140.9天。
霜凍：霜凍有早霜凍、晚霜凍，10月到11月出現的霜凍為早霜凍，3、4月出現的霜凍為晚霜凍。平均無霜期為274.5天。
