21世紀，神豬活動于台灣民間信仰仍十分普遍，相互競賽風氣頗盛。通常90公斤至100公斤就可屠宰的大骨架脂肪型家豬，被參與神豬競賽的農民飼養到超過600公斤（1000台斤）以上。2001年宜蘭出現960公斤（1600台斤）以上的神豬。2012年三峽祖師廟祭典，甚有1061公斤（1769台斤）的神豬。
飼養神豬需定期強迫灌食，肥胖至無法站立、最終甚至無法自行翻身。由于死亡率極高，加上相當不人道，近年來遭受動物學學者與民衆廣為批評，亦有零星廟宇響應改采替代方案。政府部門也開始以虐待動物為由，對于強迫灌食究責。不過也有用蔬果、苜蓿芽等素食材料做成的神豬來代替。
有宗教團體認為神豬其實是稱呼謬誤，他們認為凡是有殺生皆是“血祭”，“血祭”是巫觋之術，非道教之“齋醮科儀”。2011年8月10日，一百名多位台灣客家大老發起連署，包括前總統府資政鐘肇政、前國策顧問李喬等人，以人道主義與善待動物的觀點，呼籲停止為祭典所特别飼養神豬。
道教祭祀陽神（正神，有别于陰神）、酬願祈福者稱為醮。事實上，建醮慶典包涵封山禁水（不進行漁獵、意指吃素）、禁屠（禁殺）、禁曝（禁止陳設動物屠體）等為其重要必要的環節，不人道喂食與屠曝祭神與道教精神，顯然有違。定然不合道教祭祀精神。
另外，清水祖師廟所舉行的神豬祭典頗受佛教人士物議，敬考清水祖師一生，為漢傳佛教禅宗得道高僧，且其在世時未見有食肉之舉，故以祭祀素果糕餅為宜，不适合以肉類、葷菜奉敬。三峽祖師廟廟方表示：神豬祭典原本不是祭祀清水祖師，原是因為三峽地區的福建安溪移民開墾之際，常遭野獸及當地原住民出草攻擊，因此産生除夕殺神豬拜山靈（或山神）以求平安的習俗，後來因大年初六是祖師誕辰，便将二者合并祭祀。三峽祖師廟總務組長劉金達則說：“祖師公吃素，不吃豬肉。”此習俗實際上與祖師無關。
