早年經曆
耿長軍雖然出生成長在長崎，但父親從小就教他學習中文。2000年，20歲的他離家外闖來到北京，在接受短暫的語言訓練後，意外地考取了上海戲劇學院表演系，畢業後開始進入演藝圈發展。
演藝經曆
2002年，耿長軍因參演由楊陽執導的曆史劇《記憶的證明》而開始踏入演藝圈。
2006年，耿長軍參與拍攝由張黎執導的曆史題材電視劇《大明王朝1566嘉靖與海瑞》，在劇中飾演井上十四郎，該劇獲得第26屆中國電視劇飛天獎三等獎。
2007年6月，耿長軍再次參演由張黎執導的人文年代劇《中國往事》，并在劇中飾演家丁常泰；同年10月，耿長軍憑着由陸川執導的曆史題材電影《南京！南京！》中飾演的一個小角色日本兵東口突圍而出。
2008年，耿長軍與王寶強、張國強聯袂主演抗戰劇《我的兄弟叫順溜》，并在劇中飾演日軍少佐阪田。
2009年，耿長軍出演了喜劇電影《雲下的日子》；之後，耿長軍做客由李詠主持的央視綜藝頻道訪談節目《詠樂彙》；同年，耿長軍與文章合作主演了抗戰劇《雪豹》，他在劇中飾演重視友情高于生命的日本留學生兼軍人竹下俊。
2010年，耿長軍在以洛陽牡丹和牡丹文化為背景的電影《甲天下》（原名《牡丹花兒開》）中飾演日本商人山田英男；之後，耿長軍還出演了由成龍自編自導自演的動作冒險類電影《十二生肖》，在片中飾演反派角色海盜王；同年，耿長軍除了出演抗戰片《虎頭要塞之最後決戰》之外，又出演了兩部抗戰劇《遠去的飛鷹》和《黑狐》，同樣都扮演日本軍官這一角色。
2011年，耿長軍與黃渤、高虎搭檔主演了抗戰劇《民兵葛二蛋》，在劇中飾演日本軍官吉田；同年，耿長軍在抗戰劇《上陣父子兵》中飾演日本軍官岩谷川。
2012年，耿長軍作為嘉賓亮相香港粵語訪談節目《娛樂審死官》，在節目中吐露心扉表示希望減少飾演日本角色；同年，耿長軍出演了抗戰曆史劇《獨狼》。
2013年，耿長軍參演由郭寶昌執導的中醫題材年代劇《翻手為雲覆手雨》。
2014年，耿長軍主演的民族勵志傳奇抗戰劇《冒牌英雄》上星播出，他在劇中出演一個外表儒雅，内心卻十分狂熱的戰争狂人日軍安南縣最高軍事指揮官武田弘毅。
2015年，耿長軍參演的懸疑諜戰劇《猜拳》在央視八套播出，他脫離了日本軍人的角色，在劇中飾演國軍司令部派駐103師代表。
2016年7月，耿長軍參演的戰争片《終極勝利》上映，他在片中飾演集中營司令官倉田健二；同時，耿長軍參演的喜劇動作片《快手槍手快槍手》上映；12月，耿長軍參演的動作喜劇電影《鐵道飛虎》上映，他在片中飾演日軍業餘翻譯官坂本。
2017年2月，耿長軍與吳啟華、徐冬冬等聯袂主演懸疑驚悚片《魂歸何處》；7月，耿長軍參演的曆史題材影片《明月幾時有》上映。
人物評價
不論是電視劇《雪豹》中的竹下俊，還是《我的兄弟叫順溜》劇中的坂田，耿長軍在多部影視作品中用精湛的演技将并不讨巧的日本軍官形象賦予人性的诠釋，體現出了作為一個人的多樣性，避免了以往同類角色的臉譜化。（網易娛樂評）
耿長軍在《冒牌英雄》中傾情出演日軍軍事指揮官武田弘毅，這個人物外表雖看似十分儒雅、内斂，實則内心卻充滿了狂熱與躁動。他通過對人物性格、特征、本質的理解以及對情感及精神層面的精準分析，精彩地塑造了這個内心糾結、性格多元化的戰争狂人，以及入木三分的表現更是讓這個人物充滿了無窮的生命力，他以精湛的演技獲得了社會各界的贊譽和追捧。（新華娛樂評）
