地理位置
波多黎各海溝位處兩個闆塊互相經過一個分離邊界而隻有少量部分隐沒。加勒比海闆塊（CaribbeanPlate）向東移動而北美洲闆塊則向西移動。北美洲闆塊令加勒比海闆塊向海溝的東南方隐沒。隐沒帶的存在解釋了為何在加勒比海的東南面會發現了活火山。火山活動在島弧東南方沿線由波多黎各至南美沿岸十分頻繁。波多黎各、美屬維爾京群島、英屬處女群島及多米尼加沒有活火山，但她們都受到地震及海嘯的威脅。
公衆關注
地震及海嘯的危機知識在鄰近波多黎各海溝的島嶼的普羅大衆間并不普及。當地政府因兩個原因并不主動教育當地市民。第一個原因是旅遊業是附近諸國的經濟命脈，把危機廣泛報道将會影響旅遊工業的收益。第二個原因是當地政府希望防止恐慌在當地人口中擴散。波多黎各地震學會自從1988年便嘗試利用波多黎各的媒體告知人民關于将來的地震可以引緻災難性的悲劇。自從波及印度洋四十多個國家的2004年印度洋大地震發生後，更多人關心類似事件在加勒比海發生的後果。當地政府已經始應急計劃。在波多黎各及美屬維爾京群島的個案中，美國政府已經研究此問題多年而亦加強其地震調查及開發海嘯預警系統。
地震曆史
在1918年10月11日，島嶼西岸受到地震侵襲，并産生海嘯。聖多明各在1953年受地震侵襲。專家認為兩次災難性的地震起源于波多黎各海溝的斷層。
除了1918年的地震外，在波多黎各及其附近也有頻密的震動案例，波多黎各因此特别受到地震專家的關注。在1981年，全島均感到震動。在1985年，另一個震動在波多黎各的卡耶伊和薩萊納均感到震動。
生命探索
在這個海溝裡擁有很多罕見的海底動物，有些甚至還未被命名。透過12次的深海探索行動，總共發現了100種魚類、50種深海珊瑚和百多種軟骨生物。
