人物經曆
2019-至今:中國科學院-馬普學會計算生物學夥伴研究所,研究員
2016-2018年:美國斯坦福大學,研究員
2012-2016年:美國斯坦福大學,博士後
2010-2011年:美國凱斯西儲大學,博士後
2005-2010年:美國凱斯西儲大學,計算機科學博士
2001-2005年:清華大學,計算機科學學士
主要成就
科研成就
代表性論文(*通訊作者)
Xin Li#, Yungil Kim#, Emily K. Tsang#, Joe R. Davis#, Farhan N. Damani, Colby Chiang, Zachary Zappala, Benjamin J. Strober, Alexandra J. Scott, Andrea Ganna, Jason Merker, Daniel MacArthur, GTEx Consortium, Ira M. Hall, Alexis Battle*, Stephen B. Montgomery*. The impact of rare variation on gene expression across tissues. Nature 550(7675):239-243, 2017
Xin Li*, Alexis Battle, Konrad J. Karczewski, Zach Zappala, David A. Knowles, Kevin S. Smith, Kim R. Kukurba, Eric Wu, Noah Simon, Stephen B. Montgomery*. Transcriptome sequencing of a large human family identifies the impact of rare non-coding variants. Am J Hum Genet 95(3):245-256, 2014
Xin Li, Jing Li*. Haplotype reconstruction in large pedigrees with untyped individuals through IBD Inference. J Comput Biol 18(11):1411-1421, 2011
Xin Li, Xiaolin Yin, Jing Li*. Efficient identification of identical-by-descent status in pedigrees with many untyped individuals. Bioinformatics 26(12):i191-i198, 2010
人才培養
本課題組聚焦于人類基因組研究下一步的關鍵目标即人類遺傳變異功能圖譜的解析。
(1)人類個體罕見遺傳變異的負荷及對個體健康的影響。
(2)人類基因組非編碼區的功能解析。
(3)轉錄組測序在治療診斷疑難疾病中的應用。
(4)現代人工智能和機器學習方法對于人類基因組功能解析和精準醫療的應用。
榮譽表彰
C. W. Cotterman Award, American Society of Human Genetics, 2015.