基本概況
在寶可夢聯盟最後的戰鬥中，内木博士首次被大木博士提到。内木博士發現了一個神秘的精靈球，但是她和助手百般嘗試都無法捉摸清楚它，所以她想請教知識比自己淵博的大木博士，于是，大木博士便派小智一行人前往帶感到岱柑島來取這個精靈球。
在南國寶可夢與GS球中，小智一行人來到内木博士的研究所時，内木博士正在研究所後面的海灣照顧寶可夢。内木博士得知大木博士派來的小智等人到了，立刻從海裡面跳出來披上助手給的外套然後帶小智等人去看那個精靈球。内木博士表示她是偶然間得到的GS球，因為家裡球上的兩個英文字母很像GS，因此得名。介紹完情況後，内木博士将GS球交給了小智等人，接着在電話中，大木博士稱贊了内木博士上個月在《寶可夢研究月刊》中發表的寶可夢之地域差異與适應性的中間報告寫得十分精彩，而内木博士也誇獎大木博士寫的寶可夢與人探讨系列也很不錯。通完電話後，内木博士帶大家到後院參觀，并跟小智等人介紹因為這邊離城市很遠氣候環境不同，所以寶可夢也有一些差異，她就是在飼養這些寶可夢時，記錄它們的資料。小剛十分佩服内木博士一個人飼養了那麼多寶可夢。接着，内木博士和助手為一隻不吃飯的巴大蝶苦惱，而小剛想出了辦法往食物裡添加了些甜味樹果，成功讓巴大蝶吃了東西。内木博士和大家一起吃了晚餐。
深夜，内木博士和助手一起觀察夜行性的霸王花，小剛來給内木博士送宵夜。緊接着，内木博士為了保護一隻被霸王花的麻痹粉所麻痹的拉達，而自己也中了麻痹粉。喬伊小姐批評了内木博士，但是也多虧了内木博士，拉達很快就脫險了。第二天，内木博士和大家告别。和其他的大姐姐一樣，小剛一眼看中了内木博士。由于小剛勤勞能幹，内木博士便将其留在研究所内當幫手。小智在橘子聯盟結束旅行後，小剛也回到真新鎮，每當提起内木博士這個名字時，小剛都會莫名其妙地受到打擊，躺在地上。
在幻之寶可夢 洛奇亞爆誕中她先是和小剛出現在電子屏幕上，接着又和大木博士一起在直升飛機上接受記者的采訪。
在真新鎮，我回來了和宿敵大對決，小茂對抗小智中，在讨論小剛時，内木博士也被小霞提到。
