早期經曆
1952年12月15日，黃禹錫出生于忠清南道扶餘郡，5歲喪父，母親為養活6個孩子，讓其放牛養家。黃禹錫孩提時代幫母親照顧生病的牛，從而立下做獸醫的志向，并埋頭苦讀，誓要做個成功人士。
1972年，黃禹錫考入漢城大學（現稱首爾大學）獸醫藥學院，至1982年，他在該院取得了學士、碩士和博士學位。
畢業後，黃禹錫留校任教。在學校這段時間内，他的研究之路并不平坦，由于導師在他博士畢業前去世，他被提升的希望破滅了，他的實驗室被關閉，他也因此失去了工作，隻好到其他學校去當客座講師。在這期間他沒有放棄自己的理想，賣掉了自己唯一的住房，到地方建了一個試驗農場，進行有關人工授精培育牛方面的研究。
克隆研究
1985年，黃禹錫前往日本北海道大學進修，接觸到了當時國際科學界克隆領域知名的科學家和一些年輕有為的學者。這成為黃禹錫科研的轉折點，他開始把科研精力和方向放在克隆研究上。
1987年，黃禹錫進修結束後回到首爾大學任教授，正式開始其克隆方面的研究。黃禹錫帶領他的科研小組在其後的十幾年間創造了多項第一：
1999年在世界上首次培育成體細胞克隆牛；
2002年克隆出了豬；
2003年又首次在世界上培育出“抗瘋牛病牛”；
2005年他的科研小組成功培育出世界首條克隆狗“斯納皮”。這些成果，令他成為國際生命科學領域的權威人物，也成為當時韓國的民族英雄。
人類胚胎幹細胞研究
從2001年起，黃禹錫的研究重點從動物轉向了人類胚胎幹細胞方面的研究。
2004年2月，黃禹錫在美國《科學》雜志上發表論文，宣布在世界上率先用卵子成功培育出人類胚胎幹細胞。
2005年5月，黃禹錫又在《科學》雜志上發表論文，宣布攻克了利用患者體細胞克隆胚胎幹細胞的科學難題，為全世界癌症患者帶來了希望，其研究成果轟動了世界。當時韓國人民希望他有一天奪得諾貝爾獎。黃禹錫曾經說：“我是靠個人奮鬥取得成功，這是所有普通韓國人的夢想。”
2005年，首爾大學國際幹細胞研究中心成立，黃禹錫擔任主任；韓國政府授予其“韓國最高科學家”榮譽；韓國政府向其研究小組提供數百億韓元資金用于研究；黃禹錫不斷出現在國内外各種學術會議和公開場合，成了一位韓國“國寶”級人物，甚至享受政府提供的保镖服務。
學術造假事件
醜聞曝光
“黃禹錫神話”破滅始于2005年年底，韓國文化廣播公司新聞節目《PD手冊》報道黃禹錫在研究過程中“取用研究員的卵子”的醜聞。其後，該台被揭發編采人員在采訪期間以威吓方式向研究員逼供。随後，他的研究小組成員指出2005年論文中有造假成分。首爾大學随後的調查證實，黃禹錫發表在《科學》雜志上的幹細胞研究成果均屬子虛烏有。
黃禹錫“學術造假”醜聞令科學界震驚，他本人也名譽掃地。首爾大學解除了他的教授職務，韓國政府也取消了授予他的“最高科學家”稱号。韓國也為之蒙羞，但惟一讓韓國人稍感欣慰的是，調查委員會确認，黃禹錫的主要“成果”之一、全球首隻克隆狗“斯納皮”并無造假成分。
起訴
韓國檢察部門在2006年5月對黃禹錫提起訴訟，并于2009年8月份對黃禹錫提出詐騙、侵吞研究經費和非法買賣人體卵子違反《生命倫理法》等指控，要求法院判處其有期徒刑4年。
一審判決
2009年10月26日，韓國法院進行了長達100分鐘的宣判。判決稱，黃禹錫不僅非法利用人體卵子，還以做假賬等手段騙取、冒領經費達8.3億韓元（1美元約合1180韓元），犯罪性質嚴重。法院同時認定，黃禹錫此前在美國《科學》雜志上發表的有關人體幹細胞的研究論文部分造假事實成立。但法院考慮到黃禹錫本人在科研領域的貢獻等幾方面因素，決定對其處以緩刑。
針對檢察部門對黃禹錫提出的詐騙指控，法院認定，黃禹錫從韓國SK财團和金融機構領取的20億韓元研究經費并未違反《特定經濟犯罪加重處罰法》，詐騙罪名不成立。法院當天還對黃禹錫科研小組的數名成員判處緩刑或處以罰金。
最終韓國首爾中央地方法院對曆時3年多的黃禹錫案作出一審判決，以侵吞政府研究經費和非法買賣卵子罪，判處黃禹錫有期徒刑2年，緩期3年執行。
二審維持原判獲緩刑
韓國首爾高等法院2010年12月16日對“學術造假”科學家黃禹錫涉嫌侵吞研究經費上訴案作出判決，黃禹錫因侵吞部分研究經費而被判處有期徒刑18個月、緩期兩年執行。
異種克隆研究
2008年8月，京畿道政府與官司纏身的黃禹錫進行合作，支助他繼續從事克隆研究。
2011年10月17日，韓國京畿道政府向媒體宣布：黃禹錫的研究團隊不久前利用狗的卵子，成功異種克隆了8隻郊狼.黃禹錫團隊當天将8隻克隆郊狼贈送給京畿道政府.京畿道政府說，這批郊狼中，包括黃禹錫團隊今年6月首次克隆存活的3隻母狼，以及後續研究中克隆的5隻公狼.（郊狼又稱草原狼或叢林狼，是北美獨有的一種犬科食肉動物，體形與家養的牧羊犬差不多。200多年前，它們的活動區域還僅限于美國西北部地區，但如今已擴展到幾乎整個北美。郊狼被世界自然保護聯盟（IUCN）列在瀕危物種“紅名單”中。）
京畿道政府表示，黃禹錫團隊将郊狼的細胞去除核後移植于狗的卵子裡，完成了郊狼的克隆。同種克隆已多次獲得成功，但異種克隆尚屬首次。
黃禹錫表示，2004年培育世界上首隻克隆狗“斯納皮”時嘗試了數千次才獲成功，但現在的成功率達到了50%。他說，韓國最權威的遺傳因子分析中心已經認可，克隆郊狼與細胞源郊狼的基因完全匹配。他表示，團隊接下來将挑戰非洲野狗等瀕危動物的克隆。
韓國和俄羅斯研究人員2012年3月13日簽署合作協議，打算利用克隆技術複活大約1萬年前滅絕的史前生物猛犸象。韓方“領隊”是黃禹錫。
2015年3月，俄方與秀岩共同設立了移動實驗室。
2015年8月，黃禹錫要再赴俄羅斯西伯利亞進行一次“探險”，以提取含完整基因的猛犸象未受損組織。
與中國合作
近年來，黃禹錫團隊在國際合作方面，規模最大的正是與中國的合作。2014年9月，黃禹錫團隊與北大博雅合作的“北大博雅·中韓國際生命健康中心”成立。
博雅方面将主要負責資金和市場開發，而黃禹錫團隊負責技術，克隆寵物狗和特殊用途的狗或将成為首選項目。未來，為解決中國牛肉品種質量偏低而消費量逐年增長的問題，克隆牛項目也将提上日程。
