劇情簡介
被稱作“學園都市”的東京西部的巨大都市中，進行着超能力的開發。在此接受特殊課程而或的能力的學生被分為“無能力（Level 0）”到“超能力（Level 5）”等六個階段，位于頂點的就是七名的“超能力（Level 5）”。其中禦坂美琴是能夠自由操縱電力的“電擊使”中最上位的能力者，擁有“超電磁炮”異名的她是在常盤台中學就讀的14歲女子中學生。作為後輩，同時是“風紀委員”的白井黑子，景仰大小姐的初春飾利，和她那喜歡都市傳說的朋友佐天淚子。這樣的同伴們一起過着和平但又有點奇妙的日常生活，但突然之間學園都市的“黑暗”逼近了……
被稱作“學園都市”的東京西部的巨大都市中，進行着超能力的開發。在此接受特殊課程而或的能力的學生被分為“無能力(Level 0)”到“超能力(Level 5)”等六個階段，位于頂點的就是七名的“超能力(Level 5)”。其中禦坂美琴是能夠自由操縱電力的“電擊使”中最上位的能力者，擁有“超電磁炮”異名的她是在常盤台中學就讀的14歲女子中學生。
作品簡介
電視動畫《科學超電磁炮S》是根據日本小說家鐮池和馬原作、漫畫家冬川基作畫的漫畫《科學超電磁炮》改編的動畫作品，亦是電視動畫《科學超電磁炮》的第2期動畫。原作漫畫是以輕小說《魔法禁書目錄》中的人物禦坂美琴為主人公而展開的故事，作為動畫第二期的《科學超電磁炮S》則以漫畫版“妹妹篇”劇情為主線，後半部則同第一期一樣為原創劇情。
2012年10月20日，在千葉暮張中心舉辦的“電擊文庫秋之祭典2012”活動中，制作方發布了電視動畫《科學超電磁炮》的第2期作品《科學超電磁炮S》的制作決定。電視動畫于2013年4月12日開始播放，全24話。OVA動畫《在公共浴室需要知道的重要事情（大事なことはぜんぶ銭湯に教わった）》随公式視覺書于2014年3月27日同捆推出。
幕後制作
原着：鐮池和馬、冬川基
監督：長井龍雪
系列構成：水上清資
人物設定：田中雄一
總作畫監督：富岡寛
動作作監：椛島洋介
副人物設計：冷水由紀絵
制作人：常木志伸、高瀬健一
美術監督：黒田友範
色彩設計：安藤智美
攝影監督：福世晉吾
編集：西山茂（REAL-T）
音響監督：明田川仁
音楽：I’ve sound/井内舞子
動畫制作：J.C.STAFF
制作：PROJECT-RAILGUN S
分集劇情
第1集超電磁炮
佐天淚子和初春飾利被不良少年騷擾，及時趕來的禦坂美琴和白井黑子為她們解了圍。作為學園都市裡僅有的七個level5的超能力者之一，美琴一直是大家仰慕的對象。這一天美琴和另一位level5的食蜂在圖書館發生了沖突，随後美琴等人在醫院探病時遇到了匪徒襲擊事件，春上被匪徒劫持作為人質，美琴和黑子趕在匪徒逃跑之前将其全部制伏。
第2集壽命中斷
美琴和黑子一同去購物，在去購物商場的路上黑子帶着美琴抄了近道。兩人卻在狹窄的小巷子裡遇到了許多尋找東西的行人，原來附近出現了在偏僻地方可以撿到現金卡的傳言。為了調查這一事件，當晚美琴跟随一夥不良少年進入了可疑現金卡的來源地大樓。不良少年在大樓内被神秘少女用詭異的能力全滅後，美琴出現在了神秘少女面前。
第3集超電磁炮量産計劃
學園都市裡又出現了多起目擊類似美琴的人出現的事件，類似的傳言逐漸的多了起來。美琴從神秘少女處得知了她發放現金卡的目的是為了破壞正在進行的神秘計劃，同時想起來了年幼時曾經在醫院捐獻過DNA的事情。當晚，換裝後美琴潛入了制藥公司調查，在這裡她發現了秘密的超電磁炮克隆計劃，就在她即将離開時她的克隆體也來到了這裡。
第4集妹妹們
認為自己調查清楚真相後的美琴心情很好，和初春、黑子、佐天等人一同外出購物，幾個人聊天時又談論到了克隆level5的傳言。與此同時，秘密實驗室中的禦坂妹妹們仍然在被批量生産着。次日美琴在公園陪小朋友們玩了一天之後，她卻突然感覺到了與自己類似的力量，順着感應一路追尋而來的她終于見到了自己的克隆體。
第5集絕對能力進化計劃
美琴見到克隆體後和克隆體一同救下了樹上的小貓。為了套出克隆體知道的秘密計劃，美琴一路跟蹤着她。當晚克隆體去做實驗時美琴離開了，美琴通過初春翻譯出了從克隆體處得到的密碼。另外一邊禦坂妹妹和一方通行開始了戰鬥，美琴得知了真相後趕到了戰鬥結束的場地，目睹了一方通行殺死禦坂妹妹後，她憤怒的向一方通行發動了攻擊。
第6集我…看得見大家
美琴對一方通行發動了攻擊，充滿憤怒的她利用磁力召喚了地底的鐵砂對對方進行攻擊，但是一方通行利用自己的能力毫發無傷。禦坂妹妹們随後到來阻止了兩人的戰鬥，失望的美琴之後從布束口中得到了更多關于秘密計劃的情報。随後美琴決定繼續進行調查并找出真正的幕後主使人，為了不牽連别人，她決定獨自一人開始行動。
第7集想成為姐姐大人的助力
在美琴的調查下，DNA樹圖的數座研究機構同時遭到了襲擊。消滅掉七成的目标後終于引起了敵人的警覺，美琴決定獨自潛入研究機構，為了阻止禦坂妹妹的實驗美琴給自己了很大壓力。黑子因為美琴不願意告訴她原因而感到失望，也決定開始調查。此時，研究所的敵人已經知道了美琴的入侵計劃，并準備針對她展開行動。
第8集ITEM
遭受了慘重的損失之後，制藥公司雇傭了麥野沉利和她的團隊“道具”防禦美琴的攻擊。“道具”兵分兩路進行防禦，當晚美琴在入侵研究所的時候果然遇到了炸彈少女的襲擊。與此同時布束也來到了另一處研究所内進行交涉進行自己的計劃，一番戰鬥之後美琴将對方逼入了絕境，但卻被對方使用詭計擊傷，最終美琴俘虜了敵人但卻被對方的援軍攔截住。
第9集能力追蹤
美琴将芙蘭達制服後被随後趕來的麥野沉利攔截住，此時布束正在進行着自己的秘密計劃。美琴與麥野開始對戰，因為對方人多勢衆，美琴先一步離開了戰場，但卻被泷壺捕捉住了自己的位置。同時布束将人類感情程序輸入到了禦坂妹妹的信息中，希望能夠改變着一切，她自己也因此被捉住，麥野随後獨自前往設施内部對戰美琴。
第10集原子崩壞
美琴沿着設施内芙蘭達布置的炸彈膠帶撿到了很多娃娃炸彈。随後兩人在設施中心見了面，美琴利用炸彈和麥野周旋，利用炸彈美琴暫時擺脫了麥野。來到了數據庫的房間進行破壞，回到設施中心的美琴被麥野偷襲。之後的逃跑中美琴被麥野一路追殺，最終在天井房成功的将麥野擊落。次日美琴簽入了最後一處研究中心卻發現這裡已經人去樓空，美琴以為這一切都已經結束了。
第11集自動販賣機
美琴在公園見到了曾經有一面之緣的當麻。兩個人圍繞着自動販賣機開始了讨論，美琴對于當麻不怕她的電能力而憤憤不平。另外一邊黑子還在等待着美琴的歸來，就看到了兩人在長椅上，誤以為兩人正在約會。此時一名禦坂妹妹來到了公園，美琴将禦坂妹妹帶走後得知秘密計劃仍然在進行中。為了徹底解救禦坂妹妹并破壞這個計劃，美琴逐漸的有了犧牲自己的覺悟。
第12集樹狀圖設計者
就在美琴決定了解這一切的這天，她在山上見到了當麻并得知了一名禦坂妹妹的消息。之後當麻又見到了禦坂妹妹，美琴乘坐巴士來到了學園都市的宇宙中心，準備給樹形圖設計者輸入錯誤的信息。當麻仍然和禦坂妹妹在街上閑逛着，美琴潛入了通訊中心卻發現這裡空無一人，随後她發現樹形圖設計者原來早已被破壞掉了。
第13集一方通行
當晚禦坂妹妹10031号和一方通行開始了對戰，當麻從便利店出來卻發現不見了禦坂妹妹的蹤影。與此同時，美琴因為沒能破壞樹形圖設計者而十分沮喪，随後潛入了宇宙中心的研究大樓并開始大肆破壞。當麻一路追尋在小巷子裡發現了禦坂妹妹丢下的鞋，随後一路追蹤而去，可惜沒有及時趕上救下禦坂妹妹，但同時當麻也發現了禦坂妹妹的事實。
第14集約定
當麻來到了女生宿舍找美琴，為了套當麻的話，黑子把他放進了宿舍。在宿舍裡他向黑子詢問了美琴的事，并發現了禦坂妹妹們的神秘計劃書。為了拯救禦坂妹妹10032号，他照着計劃書來到了對應的地點。在大橋上他遇到了美琴，因為擔心美琴的安危，并試圖阻止美琴的危險行為，最後當麻說服了美琴讓他自己去解救禦坂妹妹們。
第15集最弱
當麻為了解救禦坂妹妹，争分奪秒的趕往實驗地點。此時禦坂妹妹已經被一方通行打敗，千鈞一發之際當麻趕到了現場。看到了受傷的禦坂妹妹後憤怒的當麻向一方通行發起了攻擊，與此同時美琴也在向着戰場趕來。當麻一開始被一方通行壓制而無還手之力，但是當麻神奇的無效化能力特性卻正好克制了他。最終美琴在禦坂妹妹們和當麻的幫助下終于能夠和一方通行正面交戰。
第16集姐妹
禦坂妹妹們合力破壞了一方通行的絕招，美琴為了保護預禦坂妹妹們和一方通行開始了戰鬥，倒下的當麻也在此時也站了起來。在當麻的特殊能力之下一方通行終于被打倒了。第二天，美琴和禦坂妹妹在醫院探訪了受重傷的當麻。禦坂妹妹們的去向仍然是個問題，美琴向當麻道了謝，随後美琴便跟随黑子回到了宿舍。
第17集學習會
美琴和黑子為了參加課外學習會向宿管申請了外出時間，之後兩人在佐天家的廚房裡準備了食物。白天，美琴從冥土追魂處了解到了禦坂妹妹們的身體狀況信息，得知禦坂妹妹們将被送往學園都市外進行治療。當晚，美琴和黑子等人在居所舉行了熱鬧的火鍋派對和學習交流會，大家一起度過了一個美好的夜晚。
第18集搬家
暗部組織“道具”受命阻止軍火買賣，卻之遭受到神秘的襲擊......另一方面，枝先重于趕在開學前出院，衆人一起到蛋糕店慶祝，春上也表明将會搬離初春的住處，成為枝先的室友陪伴她。聚會結束後，佐天帶着衆人走捷徑回家，卻在暗巷發現一個昏迷的小女孩......
第19集學園都市研究發表會
名為菲布理的小女孩，暫時收容在淚子家。初春查詢的資料庫，發現她并非名錄或走失的兒童，因此衆人認為她是“棄童”，并且在安排送進托育所之前繼續幫忙照顧。黑子與初春來到學究會會場開會，淚子也帶着菲布理閑逛，菲布理卻在一個不注意的時候失蹤......
第20集菲布理
場勘結束，固法邀大家一起上澡堂，美琴和菲布理也重于相處融洽。回城時，衆人遇到施工告示，被迫繞路的途中進入一座廢棄工廠，卻遭受驅動铠襲擊。美琴成功打倒驅動铠，菲布理卻不知為何身體不适倒下......
第21集黑暗
菲布理是人造物體。美琴從青蛙臉醫生口中得知驚人的事實。菲布理出院時，美琴遇見在同一間醫院療養的禦坂妹，得知菲布理可能和布束有關。美琴原本打算和之前一樣單獨調查，但聽過婚後的一席話，決定向朋友們說出事實，同心協力拯救菲布理。
第22集STUDY
美琴和昔日對手泰列絲缇娜見面了！在美琴的堅持之下，泰列絲缇娜終于透露些許情報，衆人也同心協力查出STUDY corporation這間公司很可疑。為了找出相關人員直接問情報，美琴甚至冒險潛入該公司的相關工廠，而且在那裡遇見意料之外的人…？
第23集革命未明
被捕的美琴，從當事人有富口中得知“chemicaloid計劃”，并且在朋友的協助之下脫離困境。依照各方收集的情報，确定對方将在學究會當天，由菲布理的姐姐珍妮操縱兩萬具驅動铠甲，發動一場恐怖攻擊…。
第24集Etenal Party
風紀委員吸引兩萬具驅動铠的注意力，美琴和菲布理深入敵陣核心。菲布理剩下最後一顆糖了，而會使用“原子崩壞”的機器人就擋在面前，讓整座學園都市也頓時陷入毀滅之境，所有危機，一觸即發，衆人将如何克服最後的難關？
