事件過程
2008年9月5日，日本米粉加工銷售企業“三笠食品”公司，被發現非法倒賣殘留農藥超标和黴變的“非食用”大米。農林水産省随之公布對“問題大米”的調查情況：這些大米中含有超标的黃曲黴毒素及殺蟲劑甲胺磷，是作為工業原料從國外購入的。當初，農水省曾與該公司簽訂合同，規定這些大米僅限于工業用途。現在發現，大阪、京都等地的糧食店及西酒造等釀酒企業購買了該大米。至此，“問題大米”事件曝光。
2008年9月6日，迫于社會壓力，“三笠食品”公司社長冬木三男召開了記者說明會坦言承認，是他親自下達倒賣“非食用大米”的指示。他稱，此舉是為了打破嚴峻的經營狀況，以賺取差額利潤。據查，該公司在五六年前就開始從事這一非法買賣，甚至采用真假賬本以掩蓋事實。
該公司極有可能通過關聯公司将進價為每公斤3～12日元的非食用大米，以70日元的價格出售給一些酒廠。據悉，該公司還曾數次以同樣手法将從農水省低價購買的“非食用米”僞裝成“食用米”，販賣給其他業主，以牟取暴利。
2008年9月8日，農水省查明，“問題大米”已流入茨城、千葉、靜岡、岐阜、京都等13府縣的86家公司。部分燒酒廠家已主動召回或停止銷售相關産品。農水省這才真正意識到問題的嚴重性，決定同步檢查涉案的其他18家公司，并對從該省購買問題米的業者進行突擊檢查。
2008年9月9日，在當日召開内閣會議後，農林水産大臣太田誠一随即舉行記者說明會。他稱，當初出售問題大米時，農水省曾與“三笠食品”公司簽訂過合同，規定僅限于工業用途，現被挪為食用明顯屬于違反合同。他将因此勒令該公司支付千萬日元違約金，然後再處以罰款。
2008年9月11日，有消息稱，大約有704公斤“問題大米”經由東京“日清醫療食品公司”，流向近畿地區2府4縣的醫院、老年人福利院等119家單位，其中大部分已被食用。
2008年9月12日，朝日啤酒公司查明，在其出售的燒酒中，曾使用過“三笠食品”倒賣來的“問題大米”，該公司于前一日停止銷售并将以15億日元的代價召回相關産品。
2008年9月15日，農水省近畿農政局大阪農政事務所前消費流通科科長接受調查時承認，曾在小酒館接受“三笠食品”社長冬木三男等人的兩次款待。“因為沒有看相關收據，所以不知道花了多少錢，但我點了一道菜、隻動了一下筷子，我覺得大概幾千日元吧。他們經常邀請我，因此覺得拒絕的話會很沒禮貌，但沒有為他們提供過什麼好處。”這位科長說。
2008年9月16日，農水省中期報告顯示，自2003年後，“三笠食品”公司将從政府買入的非食用米中的44％作為食用米流向市場，共約622噸，流通對象現階段已擴大至約370家單位。其中大部分已被消費。除學校食堂以外，問題大米還出售給了餐飲業。農水省還發現，除“三笠食品”以外，從政府購買問題大米的“島田化學工業”也存在非法倒賣行為。
2008年9月16日晚上，“三笠食品”問題大米的代理商、奈良縣一米谷銷售公司社長，在寓所被兒子發現用吸塵器的電線上吊身亡，死者54歲。
2008年9月18日，繼“三笠食品”公司、“島田化學工業”公司後，又一家非法倒賣問題大米的企業被曝光。據京都市教育委員會發布消息稱，在今年4月份，為該市47所市立初中提供的5254份紅豆飯中混有“問題大米”，該“大米”來自名古屋市淺井粘合劑公司。
2008年9月19日，自從日本毒大米事件9月5日被曝光以來，事件愈演愈烈，當地時間19日，日本農林水産省大臣太田誠一就未能阻止受污染大米銷售進行道歉，并提交辭呈。由于福田内閣隻剩下最後幾天，日本當局宣布由内閣秘書長町村信孝兼管農林水産省。
2008年9月20日《朝日新聞》報道，太田誠一是最近5年間繼大島理森、島村宜伸、松岡利勝、赤城德彥、遠藤武彥之後，第六位于任期中途辭職的農林水産大臣。
在太田誠一辭職當天，日本電視媒體集中報道了民衆的反應。很多受訪者認為，太田誠一應該早點辭職。還有市民尖銳地說：“事件曝光後，農林水産大臣曾在一電視節目中表示：‘(問題大米)并不是什麼值得驚慌的大問題’。真不像話，難道要等死了人才算大問題嗎？”
徹查
日本時事通訊社2008年9月24日報道，因為有害大米事件影響擴大，日本大阪、福岡、熊本三地警方組成聯合搜查小組，對三笠食品總部及相關的28個公司企業進行徹底搜查，這些企業涉嫌違反了日本《食品衛生法》和《不正當當競争防止法》。
2008年9月24日上午，日本警方進入三笠食品總部搜查，因為有害大米事件影響擴大，日本大阪、福岡、熊本三地警方組成聯合搜查小組，對三笠食品總部及相關的28個公司企業進行徹底搜查，這些企業涉嫌違反了日本《食品衛生法》和《不正當當競争防止法》。
約50名警察參加了搜查任務，三笠食品載日本福岡縣的工場遭到了徹底搜查。同時，三地警方組成了聯合調查總部。警方稱，因為有毒大米事件從根本上對食品安全造成的惡劣影響，三笠食品事件可能超出一般民事案件的範疇，會上升至刑事案件。
根據調查，從2007年11月到今年1月，三笠食品和集團下屬公司“辰之巳”進口了110噸工業大米，再包裝成食用米轉賣給零售企業，經大阪府警方檢測，這些大米含有高度緻癌性曲黴菌和高于基準值量杯的甲胺磷農藥。
三笠食品還從越南進口了5.4噸大米，标注成國産米進行倒賣。2003年至今，三笠食品共從日本政府買進了800噸工業大米，分包成食用米出售。2008年9月初，有毒大米事件曝光，流通範圍涉及近400家企業，其中部分是學校、養老院和醫院，2008年9月19日日本農林水産省大臣引咎辭職。
大臣辭職
日本毒大米事件愈演愈烈，2008年9月19日農林水産省大臣太田誠一引咎辭職。同日，事務次官白須敏郎也辭職。媒體分析稱，更換農林水産大臣，自民黨将改變毒大米事件給民衆的惡劣印象，避免被在野黨在臨時國會上追究。
日本《讀賣新聞》2008年9月19日報道，日本毒大米事件愈演愈烈，農林水産省大臣太田誠一已辭職，官房長官町村信孝将兼任農林水産大臣職位。同日，事務次官（相當于副大臣）白須敏郎也已辭職。日本媒體分析稱，通過農林水産大臣的更換，自民黨将改變毒大米事件給民衆的惡劣印象，避免被在野黨在臨時國會上追究。太田誠一是福田康夫兩屆内閣中，唯一一位任期未滿辭職的大臣。
2008年9月7日，震驚日本的毒大米事件曝光。日本農林水産省當日發表聲明稱，大阪米粉加工企業三笠食品公司
将制造工業膠水的有害米用作食用米出售，這些工業用米中含有高緻癌性黃曲黴毒素、殺蟲劑甲胺磷等有害物質。截至2008年9月18日，已查明的有毒大米的使用商達到382家，其中有部分是學校。
此前，日本農林水産省曾經對這些大米進行過現場監測，但是沒有發現工業米已經被當作使用米出售。事件曝光後，太田誠一在接受記者采訪時說“這種大米對人體無害，不用大驚小怪。”2008年9月11日，事務次官白須敏郎也稱，“事故的責任在那些貪心的企業，農林省并沒有責任。”兩人的發言遭到了日本朝野兩黨的強烈批判，随後都發表道歉聲明，宣布收回問題發言。2008年9月18日，太田誠一在國會接受了在野黨的問訊。
日本農林水産省被稱為“鬼門”，因為官員受賄、食品安全問題頻發，2007年5月，大臣松岡利勝自殺至今，已有三任大臣被迫辭職。
日本自新首相将于2008年9月25日正式産生，2008年9月24日，福田康夫内閣必須全體辭職。距離太田誠一任期結束還有4天，他在記者會上說“我已經決定辭去大臣職務。（我的）任期還有4天。這不是時間的問題，必須通過辭職明确農林水産省在事件中的責任。”
問題大米
日本農林水産省2008年9月5日宣布稱，大阪市米谷加工企業三笠食品公司将限用于工業用途的發黴或殘留農藥超标的非食用“問題大米”僞裝成食用大米進行轉賣赢利。
據悉，該省于2008年9月8月末收到了指稱該公司違法僞裝倒賣工業用大米的匿名舉報。經過調查，三笠公司社長冬木三男承認自己是指使責任人。
所謂“問題大米”，是根據WTO烏拉圭回合談判的“最低進口義務”，日本每年必須從美國、中國、越南等國進口77萬噸大米，而每年進口的大米中有約2000噸是經過檢測不能食用的發黴或農藥超标米，隻能用于生産黏合劑等工業用途——這些米即被稱為“問題大米”。日本政府每年将這些“問題大米”廉價賣給國内的17家企業，條件是隻限于工業用途。
據農林水産省透露，三笠公司從2003年至2008年間從政府購入“問題大米”1779噸，其中測出有高度緻癌性曲黴菌的9噸大米中的3噸被倒賣到鹿兒島和熊本兩縣的4家燒酒公司。另外，測出含甲胺磷農藥的800噸中國産糯米中的295噸被作為食用大米轉賣，成為點心、面包等的生産原料。除直接從政府購買途徑外，三笠公司2005年和2006年還從其他商社買入了743噸“問題大米”。
目前已發現采取類似做法的，除三笠食品公司外，還有黏合劑制造公司淺井、太田産業及島田化學工業等共4家企業。
暴利
黑心商販收購“問題大米”後再當作食用大米賣，不為别的，就是因為暴利驚人。
從2006年11月到去年5月，三笠食品收購含有甲胺磷的中國産糯米800噸，花費711.9萬日元，每公斤單價為8.9日元。而該公司轉手以每公斤40日元的價格賣給佐賀縣的中間商。其後，中間商再将這些“問題大米”經其他幾家業者倒手最後賣給京都市内的配餐公司“日清醫療食品”，那時單價已漲到了每公斤370日元。從8.9日元到370日元，漲幅超過了40倍。
為了擡高米價，有些中間商還将包裝袋上的産地從“中國制”變成了“美國制”。
危害廣泛
此次“問題大米”事件的涉及範圍相當廣泛。
據日本政府2008年9月22日公布的調查結果，現階段查明三笠食品公司“問題大米”流入的單位，已從此前公布的375家擴大到390家，覆蓋東京、大阪、京都等共26個都府縣，危害波及整個日本。淺井公司倒賣的“問題大米”則涉及14家業者。島田化學工業公司利用工業用米加工的澱粉被廣泛利用于制成各類食品，其中一些被東京、岩手、福島、山梨等11個都縣的學校、保育園作為配餐提供給學生和幼兒食用，總計超過100萬份。
“問題大米”的流通渠道覆蓋面極廣，有燒酒、冷凍食品、點心等食品飲料制造公司，還有保育園、學校、養老院以及醫院的配餐等。雖然農林水産省要求相關企業公司盡快回收問題産品，但絕大多數的有問題食品已被國民消費掉了。
已到海外
“問題大米”風波還延伸到了海外。
日本朝日啤酒公司日前決定，停止銷售并召回65萬瓶問題燒酒，包括8種白薯燒酒和1種芋麥燒酒。
朝日啤酒公司查明，其所出售的這些燒酒原料中曾使用過三笠食品公司的“問題大米”。此次召回的産品波及中國市場。據稱有問題的燒酒已在中國銷售了42箱共504瓶。該産品目前隻在上海的餐飲店出售。
商家自殺
随着調查的深入，三笠食品公司出售“問題大米”的涉案途徑越來越明晰。衆多相關企業和中間商接連被媒體曝光。
2008年9月16日晚，作為“問題大米”中間商而被曝光的奈良縣廣陵町米谷銷售公司的社長不堪重負，在家中二樓卧室利用吸塵器電線上吊自殺身亡，但沒有留下遺書。該社長曾将從三笠公司購買的中國産“問題大米”僞裝成奈良國産，然後販賣給當地的點心生産廠家。
民衆不安
農林水産省成衆矢之的，雖然日本政府表示目前尚未收到以“問題大米”為原料的食品損害人體健康的報告，但向來以注重食品安全著稱的日本發生如此食品安全大案，着實令日本國民惶惶不安，每天都有幾百個電話打至農林水産省發牢騷，或咨詢産品的安全性。
此事件曝光在福田宣布辭職之後，但對于始終強調重視消費者的福田内閣還是打擊巨大。福田督促農林水産省盡快查明真相并妥善處理。
推卸責任
但農林水産省事務次官白須敏朗2008年9月11日在會見記者時竟強調，所有責任全在轉賣“問題大米”的企業身上，農林水産省沒有過失。
這個推卸行政責任的官方表态，令内閣官房長官町村信孝大為不滿，将其召至首相官邸一頓訓斥。
有資料顯示，農林水産省過去5年曾對三笠食品公司的加工作業進行了96次臨場檢查，卻未能發現其存在非法行為。
時隔一天，曾經失言說日本消費者對于食品安全太過啰嗦的農林水産大臣太田誠一又犯老毛病。他在2008年9月12日的一個電視節目中說，“我相信‘問題大米’對人體沒什麼影響。根本用不着過度驚慌、手足無措”。
太田的言論立刻招緻國民、在野黨以及執政黨的猛烈抨擊。
2008年9月19日，太田遞交辭呈，福田首相很快受理并批準。在當天上午的内閣會議上，政府還同意了事務次官白須敏朗的辭職。
本來福田内閣目前處于過渡階段，隻等新首相上台接班，因此多數意見認為沒有必要此時再處理太田。但福田一貫提出“向重視消費者的行政邁進”，又考慮到即将進行衆院選舉，隻有明确責任才可能降低事件對自民黨政權的負面影響。
對策措施
2008年9月22日，日本政府就“問題大米”事件發布救助支援措施和今後的預防對策。
首先，為補償救濟那些在不知是“問題大米”情況下購入的單位，日本政府除了将負擔部分商品回收和廢棄費用之外，還決定将對因營業額下降而影響經營的受害單位實施支援。現階段對策除了負擔部分回收費用外，還将對買賣“問題大米”的企業産品的安全展開免費檢驗。目前政府庫存的200噸“問題大米”将全部焚燒廢棄。
其次，作為今後的預防措施，規定如果進口大米在入關檢疫時發現有問題，将立即返還給出口國。如果進口後大米在日本國内出現黴變等問題，将由政府負責焚燒廢棄處理，不再出售給民間企業。
媒體不滿
對于這個政府對策，此間媒體并不買賬，認為“對策小組剛成立4天就推出政策，未免操之過急”，而且在“誰來負擔問題大米退還出口國的費用”以及“救助不明真相的企業并負擔回收費用額度”等問題上不夠具體且缺乏操作性。
日本國内關于“問題大米”的新聞仍在一樁接一樁地抖出，事态還沒有進入尾聲的迹象。日本政府最終如何善後，無論如何也要等到麻生組閣之後甚至衆院大選之後了。
相關評論
一位日本老闆，因為把受污染的工業用米倒賣到食用市場，東窗事發，一根繩子上吊死了。聽到這個消息，不知怎麼的，感到有點不是滋味。不用說，無論按哪一國的标準，日本米老闆都屬于奸商，幹了昧良心的黑心事，但事發之後能夠自己了結，說明此人還有臉皮。同樣做這種事情的中國老闆，這些年來不知有多少，可從沒有聽說有哪個自殺過。
恥感文化
這樣的事，文化學者也許會站出來說，這是因為日本是恥感文化，而中國是樂感文化，恥感文化的環境下，人們最怕的是丢臉，所以，日本人丢了臉，要自殺。當然，如果我們要相信這種文化解釋是合理的，有必要加上進一步的說明，因為在事實上，做了丢臉的事不自殺的日本人，也比比皆是。比如對待侵略中國的問題，很多日本人的選擇是拼命掩飾，不惜制造出所謂“真實的曆史證據”，抹殺當年侵略戰争中的罪行，甚至把罪行說成是正義之舉。也許，隻有涉及自己人的時候，因丢臉而導緻的羞恥感，才會驅使一個人去自殺。也就是說，在自己人圈子裡的丢臉，才有真正撼動生命的恥辱。
樂感文化
即使在這裡如此這般地批判日本文化，也無論如何對自己的樂感文化得意不起來。因為這麼多年來，中國絕大多數人為制造的食品安全問題，都是針對自家老百姓的，甚至有的人喪心病狂地把毒大米、毒酒、毒鴨蛋、香精兌的飲料、藥物含量偏高的魚肉，賣給自己的親友。這樣的人，又有哪個忏悔過？這樣人為的食品安全事故，即使出自大企業之手，如此番三聚氰胺添加事件中的三鹿集團，看到的，都是一連串的欺與瞞。地下操作，強詞奪理，以勢壓人，實在瞞不住了，才羞羞答答地說要收回産品，同時把責任推到“不法奶農”身上。即便三鹿的正式道歉，也閉口不談自己的責任，言外之意，好像自家也是受害者。似乎所有的造假者，所有把有毒有害食品推向市場的人，都有一副厚臉皮，厚到刀槍不入鐵布衫金鐘罩的境地。
據說做小姐賣皮肉的女孩，多半不會在自己家鄉做生意，因為怕碰到熟人。可是，作假摻假者，即使對自己的家鄉人，也照坑不誤，殺熟連連，連小姐的那點羞恥感也蕩然無存。被抓住，算倒黴；沒抓着，接着幹。這樣的樂感文化，實在是過于歡悅，歡悅到了沒羞沒臊的地步。
更進一步想，其實也不僅是制假造假者如此，其他人也好不了多少。在自己家鄉為官的官員，為了一點回扣或者GDP，把污染企業引進家鄉，或者放任礦主在自己家鄉濫采濫挖，挖得水幹樹枯，鄉親沒法活，好像也沒有什麼人感到羞愧。有些人，甚至在自己的鄉親跟這些污染企業和礦主沖突時，居然毅然決然地站在後者一邊，為自己的金主看家護院，擺平一切。大學變相賣文憑，明知道給不了人家任何學問，卻一面給有權有錢者送碩士博士學位，一面向社會兜售函授文憑，現在又加上了大辦所謂的三本班，等于給那些高考根本不合格的人濫發文憑。還有跟國外不良大學的合作辦學，借國人對外國文憑的迷信，對高考落榜生收取高額學費，中外結合，聯手坑人。這些事，難道說就比那些食品造假毒人要好多少嗎？這樣的造假文化，這樣的造假坑人甚至坑了熟人都毫不羞恥的文化，實際上比那些毒大米、毒奶粉還可怕。
