故事簡介
哥哥高坂京介（17歲）和妹妹高坂桐乃（14歲）兄妹兩人的關系近幾年處于冷戰狀态。從某個時間點開始，桐乃看到哥哥時連打招呼都沒有，隻會用像是看到髒東西般的眼神瞪他。京介認為這種關系也會一直持續下去。
某天，京介在門口撿到從來沒看過的魔法少女動畫《星塵☆小魔女梅露露》的DVD盒子，裡面竟然不是動畫的DVD，而是成人遊戲《和妹妹戀愛吧♪》的光碟。京介在晚餐時用梅露露的話題試探誰是光碟的物主，但隻得到父母充滿偏見的否定意見。
就在那天晚上，連打招呼都不會的妹妹突然來到京介房間，并且說她有事情想要商量。原來桐乃迷上了萌系動畫以及美少女遊戲中的妹系角色，卻都不敢告訴别人，隻能一直悶在心裡。被哥哥知道了自己的秘密後，從此開始了和哥哥之間的人生咨詢。
背景設定
原作小說中，故事的中心人物高坂兄妹的家在千葉縣千葉市，距離秋葉原32公裡，從離家最近的車站坐電車到JR秋葉原車站的電器街出口需要一個半小時，而坐電車大概兩個小時左右、然後在新木場換乘臨海線則來到有明的東京國際展示場。從京介的學校步行到大概十五分鐘，便可以來到隔壁鎮的中央公園——連觀光地圖上都會提到的有名景點。
電視動畫中，高坂家被設定在千葉縣千葉市的千葉站附近——千葉市中區南弁展町，但實際上千葉市并沒有中區、南弁展町這樣的地方，但千葉站附近現實卻存在有中央區弁天町的地方；而黑貓家的千葉市東天沼町和沙織公寓的神奈川縣橫濱市北區海手町在現實中也并不存在。但是，動畫中的許多場景和建築在現實中都有原型或真實存在。
例如，在劇中上鏡率極高的充滿自然氣息的公園便是千葉市的“千葉公園”，京介和麻奈實一起開讀書會的圖書館即“千葉市中央圖書館生涯學習中心”，劇中主人公京介就讀的學校“千葉縣立千葉弁展高等學校”的原型則是“千葉縣立千葉商業高等學校”，劇中“UR千葉站”在現實中則名為“JR千葉站”、京介與绫濑人生咨詢的公園真實名稱為“幕張船溜迹公園”、澀谷的108大樓（原作中作“109”，動畫中作“108”）在現實中是109大樓、新宿的出版社“MEDAASCIIWORKS”大樓的原型則是“ASCIIMEDIAWORKS”大樓、黑貓家族旅行的溫泉街的現實舞台是草津溫泉等。
原作小說中沒有設定具體的年份，但是電視動畫則将故事開始設定為2011年，随着劇情的發展時間也逐漸進入到2012年。此外，電視動畫通過報刊、海報、日曆、宣傳單等上面的日期，還對原作中沒有确切的日期進行了設定，或是對原作中的日期進行重新設定。
例如，電視動畫将京介發現桐乃興趣的日期設定為2011年6月8日，京介與老爸的對決設定為6月10日，沙織等人籌辦的“高坂京介專屬後宮一行人派對”則是在2012年3月11日。在原作中，京介深夜去秋葉原買成人遊戲和桐乃的不辭而别是在2012年3月6日，而在動畫中則設定在4月9日；在原作中，桐乃“冒牌男朋友”事件和黑貓告白分别發生在8月17日和18日，而動畫中則重新設定為8月14日和16日。
原作小說
單行本
小說單行本由ASCIIMEDIAWORKS出版發行，繁體中文版由中國台灣的台灣角川書店代理發行，簡體中文版由湖南美術出版社出版、廣州天聞角川發行。天聞角川中文版前9卷采用台灣角川中文版譯文，而10、11卷則自行翻譯。
小說單行本第1卷在日本秋葉原發售之初曾數度斷貨。小說單行本的發行量，在2010年5月第6卷發售時累計突破120萬本，2010年11月第7卷發售時達到230萬本，2011年8月時超過330萬本，2012年5月時達到430萬本，前11卷累計發售已經突破500萬本。
短篇小說
NICONICO特别篇
《我的妹妹哪有這麼可愛！~某電擊娘的人生相談~（俺の妹がこんなに可愛いわけがない～とある電撃娘（コラボ）の人生相談（ガールズトーク）～）》是在NICONICO網站推出的“俺妹×超電磁炮”兩部人氣作品的合作小說，執筆者為《我的妹妹哪有這麼可愛！》作者伏見司，插畫擔當也是《我的妹妹哪有這麼可愛！》的神崎廣。小說從2013年6月7日起到28日每周五在在線小說網站“NICONICO連載小說”上更新連載。
故事講述某日桐乃接到了和“學園都市LV5能力者禦坂美琴”在NICONICO生放送網站舉辦女子談話會的工作。想到如果成為好朋友，沒準美琴會把妹妹們介紹給自己，于是桐乃立刻接下了工作，和京介一起來到NICONICO本社……
