早年經曆
2004年9月，到湖南大學表演系報道。同年榮獲新絲路模特大賽專業組長沙賽區第一名，湖南省十佳、最佳上鏡獎。
2005年，獲《三湘都市報》魅力女孩冠軍以及王老吉清熱暗瘡片代言人選拔大賽冠軍、最佳人氣獎。
工作
2005年，參演電視劇《一家老小向前沖》，飾演“曉薇”。
2006年孫耀琦正式加盟湖南衛視“快樂購”，20歲的她被快樂購推選為“感恩天使”。
2007年孫耀琦開始與湖南衛視的一線主持何炅搭檔節目《快樂購》。
2008年出演電視劇《好漢一籮筐》，劇中孫耀琦扮演“川貝格格”。
2009年參演《醜女無敵第二季》，飾演“女老師”。
2011年出演《新還珠格格》扮演“金瑣”并走紅。
2012年出演由長城影視股份有限公司出品的古裝傳奇情感戰争劇《隋唐英雄》，該劇中孫耀琦扮演如意公主。同年3月由浙江長城影視傳媒和湖南衛視聯合打造的古代宮廷傳奇電視劇《太平公主秘史》上映，孫耀琦飾演青年時期的上官婉兒，同時受邀做客《我是大美人》節目。
2013年受邀參加湖南衛視《一生一世合家歡》節目錄制，節目現場孫耀琦與演員遲帥攜手共同演繹了一段搞笑浪漫的“情侶秀”，兩人因各自的精彩表現成為觀衆心中的優質“偶像組合”。5月受邀參加國内首檔明星模仿秀《百變大咖秀》節目錄制，孫耀琦現場反串“林志穎”。。
2014年出演由長城影視股份有限公司出品發行的大陸古裝劇《隋唐英雄4》，劇中孫耀琦扮演“樊梨花”，并憑借亦剛亦柔、文武雙全的霸王花形象受到觀衆的好評。
2015年出演由華夏視聽、于正工作室聯合出品的古裝武俠劇《神雕俠侶》，劇中她飾演“陸無雙”，因一張身處冰山的劇照，照片中孫耀琦身着素雅長裙，面向陽光，被網友稱贊為“冰山美人”。在超級網劇《盜墓筆記》中被欽點飾演陳丞澄這個原創角色。11月出演電視劇《警察榮譽》。
2016年1月，在年代劇《青谷子》中飾演知青教師方格；2月19日，與杜海濤、吳昕、隋凱合作主演愛情喜劇電影《恭喜發财之談錢說愛》；4月7日，受邀加盟山東衛視曆史文化類喜劇季播節目《你好曆史君》的錄制，在第二期”翻閱三國亂世“中飾演貂蟬；5月23日，參演的古裝玄幻劇《仙劍雲之凡》開播，孫耀琦飾演呆萌花癡的活潑少女蘅绾绾；6月20日，在古裝武俠劇《六扇門》中飾演聰明伶俐、知書達理的名門閨秀曹懿恩；7月，拍攝都市玄幻偶像劇《我的美女老師第二季》；10月，加盟原創校園紀實節目《一年級·畢業季》，擔任本季的大學輔導員。
社會活動
2012年8月15日，與班傑明、王今铎亮相某公益挑戰節目，緻敬辛勤的勞動者，切身體驗高難度的懸崖清潔工作，呼籲大家注重環保。
2013年，孫耀琦受邀參加湖南衛視“一生一世合家歡”愛心頒獎典禮，并為愛心企業頒獎。
2016年6月28日，孫耀琦受邀參加WABC&人物慈善夜，為藝術品助拍，為公益站台。
2017年7月31日，孫耀琦現身一直播，号召粉絲們給流浪龍武更多關愛，一起關注由北京領養日和一直播共同發起的“帶我回家”——以領養代替購買流浪動物的公益活動。直播中，孫耀琦不僅與粉絲分享了自己養寵物的故事，還為可愛的流浪動物作畫。
