于淼

于淼

複旦大學生命科學學院研究員
于淼,女,漢族人,現任複旦大學生命科學學院研究員。[1]主要研究方向是開發新型的高通量測序技術描述染色質在細胞核中的三維結構并利用此信息解讀非編碼基因調控元件是如何參與其靶基因的表達調控和将前沿單細胞表觀遺傳組以及多組學測序技術應用于類器官模型,從基因組學、表觀遺傳組學和轉錄組學水平分析器官發育過程中的轉錄調控機制以及個體化腫瘤模型的遺傳特征,并進一步研究與疾病相關的非編碼區突變的潛在緻病機理。
  • 中文名:于淼
  • 民族:漢
  • 出生地:
  • 畢業院校:
  • 學位/學曆:
  • 職業:教師
  • 專業方向:
  • 職務:複旦大學生命科學學院研究員
  • 學術代表作:
  • 主要成就:

人物經曆

2006–2010北京大學,化學與分子工程學院,學士;

2010–2015美國芝加哥大學(UniversityofChicago),化學系,博士,Dr.ChuanHe(何川)實驗室;

2015–2020路德維希癌症研究所聖叠戈分所(LudwigInstituteforCancerResearch,SanDiegoBranch),博士後,Dr.BingRen(任兵)實驗室。

主要成就

2013–2015,霍華德休斯醫學研究院(HHMI)國際留學生獎學金;

2014,國家優秀自費留學生獎學金;

2019,入選上海海外高層次人才項目。

論文著作

1.  Juric, I. *, Yu, M. *, Abnousi, A., Raviram, R., Fang, R., Zhao, Y., Zhang, Y., Qiu, Y., Yang, Y., Li, Y., Ren, B., Hu, M. MAPS: Model-based analysis of long-range chromatin interactions from PLAC-seq and HiChIP experiments. PLoS Comput Biol. 2019, 15: e1006982.

2. Yu, M., Ren, B. The three-dimensional organization of mammalian genomes. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 2017, 33: 265-289.

3. Fang, R.*, Yu, M.*, Li, G., Chee, S., Liu, T., Schmitt, A.D., Ren, B. Mapping of long-range chromatin interactions by proximity ligation-assisted ChIP-seq. Cell Res. 2016, 26: 1345-1348.

4. Yu, M.*, Ji, L.*, Neumann, D.A., Groom, J., Chung, D., Westpheling, J., He, C., and Schmitz, R.J. Base-resolution detection of N4-methylcytosine in genomic DNA using 4mC-TAB-seq. Nucleic Acids Res. 2015, 43: e148.

5. Yu, M., Song, C.X., and He, C. Detection of mismatched 5-hydroxymethyluracil in DNA by selective chemical labeling. Methods 2015, 72: 16-20.

6. Yu, M., Hon, G.C., Szulwach, K.E., Song, C.X., Jin, P., Ren, B., and He, C. Tet-assisted bisulfite sequencing of 5-hydroxymethylcytosine. Nat. Protoc. 2012, 7: 2159-2170.

7. Yu, M.*, Hon, G.C.*, Szulwach, K.E.*, Song, C.X., Zhang, L., Kim, A., Li, X., Dai, Q., Shen, Y., Park, B., Min, J.H., Jin, P., Ren, B., and He, C. Base-resolution analysis of 5-hydroxymethylcytosine in the mammalian genome. Cell 2012, 149: 1368-1380. (衍生産品5hmC TAB-Seq Kit sold by Wisegene)

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