局限性
1.計算總資産淨利率的“總資産”與“淨利潤”不匹配
總資産淨利率=淨利潤/總資産
（1）分母中的總資産是全部資産提供者（包括股東和債權人）享有的權利
（2）淨利潤是專門屬于股東的。
由于該指标分子與分母的“投入與産出”不匹配，因此，不能反映實際的回報率。
從财務管理的基本理念看，企業的金融資産是投資活動的剩餘，是尚未投入實際經營活動的資産。應将其從經營資産中剔除。與此相适應，金融費用也應從經營收益中剔除，才能使經營資産和經營收益匹配。因此，正确計量基本盈利能力的前提是區分經營資産和金融資産，區分經營收益與金融收益（費用）。
2.沒有區分金融負債與經營負債。
負債的成本（利息支出）僅僅是金融負債的成本，經營負債是無息負債。因此必須區分經營負債與金融負債，利息與金融負債相除，才是真正的平均利息率。
區分金融負債與經營負債後，金融負債與股東權益相除，可以得到更符合實際的财務杠杆。經營負債沒有固定成本，本來就沒有杠杆作用，将其計入财務杠杆，會歪曲杠杆的實際作用。
針對上述問題，人們對傳統的财務分析體系做了一系列的改進，逐步形成了一個新的分析體系。
績效評價
從企業績效評價的角度來看，杜邦分析法隻包括财務方面的信息，不能全面反映企業的實力，有很大的局限性，在實際運用中需要加以注意，必須結合企業的其他信息加以分析。主要表現在：
1、對短期财務結果過分重視，有可能助長公司管理層的短期行為，忽略企業長期的價值創造。
2、财務指标反映的是企業過去的經營業績，衡量工業時代的企業能夠滿足要求。但在目前的信息時代，顧客、供應商、雇員、技術創新等因素對企業經營業績的影響越來越大，而杜邦分析法在這些方面是無能為力的。
3、在目前的市場環境中，企業的無形知識資産對提高企業長期競争力至關重要，杜邦分析法卻不能解決無形資産的估值問題
應用
總資産周轉次數是資産負債表的概括，反映了企業的營運能力；權益乘數是資産負債表的概括，代表了企業的财務狀況。有了杜邦公式，就能輕易的分清企業的優勢和劣勢，就能找出股東回報率低的原因，然後對症下藥。
比如，如果銷售淨利率比較低，說明公司的盈利能力不強，如果總資産周轉次數很高，說明企業的營運能力很強，産品從銷售到收回現金的時間較短，産品屬于薄利多銷型；如果銷售淨利率比較高，說明盈利能力很強，如果總資産周轉次數很低，說明企業的營運能力很弱，産品從銷售到收回現金的時間較長，産品屬于厚利少銷型；
如果權益乘數較低，說明企業沒有充分利用财務杠杆的作用，因為權益乘數=1+負債/股東權益，這個時候增加借款會提高權益淨利率。但權益乘數的提高不是無限制的，負債一多，企業的财務風險就會增大，因為每年需要償還大量的固定利息。公司的資産負債率一高，再借款時的利率會很高，有可能會超過公司資産的收益率，這時再增加借款就得不償失了。
