历史沿革
1976年6月，在省营林局组织的全省珍贵稀有动物资源调查的基础上，根据中国科学院动物研究所鸟类专家的建议，齐齐哈尔市林业局按照省营林局的要求，组建了扎龙自然保护区筹备处。
1979年黑龙江省人民政府批准建立黑龙江省扎龙自然保护区并成立扎龙自然保护区管理局。
1987年4月国务院批准扎龙自然保护区晋升为国家级自然保护区。
1992年中国加入《关于特别是作为水禽栖息地的国际重要湿地公约》，扎龙保护区被列入国际重要湿地名录。
2001年扎龙国家级自然保护区加入中国《人与生物圈》组织。
2020年12月，入选“第七批国家生态环境科普基地”名单。
地理环境
地理位置
扎龙国家级自然保护区位于黑龙江省齐齐哈尔市东南30千米处，地理坐标为东经123°47′～124°37′，北纬46°52′～47°32′，属湿地生态系统类型的自然保护区。
地质地貌
保护区位于松嫩平原西部，松嫩平原是晚中生代以来发展形成的凹陷盆地。其地貌类型主要为平原区河湖相冲击地貌类型，河流的河谷、河道极不明显，水流缓慢，兼有风成沙丘及沙地。
水文条件
保护区的水源有乌裕尔河、双阳河、新嫩江运河、“八一”幸福运河，其中乌裕尔河为形成和维持保护区湿地生态系统的主导因素。乌裕尔河流域年降水量差异较大，上游年均降水550～600毫米，下游地区为400毫米左右，下游年需水量16.6×108立方米，其中天然降水为6.6×108立方米，新嫩江运河补水7×108立方米，北部引嫩和乌裕尔河来水量为3×108立方米。本区耗水量分别为：蒸发约10×108立方米，连环湖补水工程2×108立方米，渗透和灌溉消耗4.6×108立方米。由于多年干旱及乌裕尔河、双阳河上游水利工程的影响，在二零一几年扎龙保护区每年缺水量约为3×108立方米。
土壤类型
扎龙湿地土壤共由六类组成，即黑钙土、草甸土、碱土、盐土、沼泽土和沙土，主要为黑钙土、草甸土、沼泽土。
水质：扎龙保护区水质为Ⅴ类水质，化学性质常年为pH=7.0左右，略呈碱性。
水深、水深的波动和恒定：扎龙湿地水深变化较大，雨水充沛年份，沼泽地一般水深为75厘米，湖泊水深平均1～2米；干旱年份，湿地的水则特别浅。
气候条件
保护区地处中纬度地带，属于中温带大陆性季风气候。年平均气温3.5℃。最冷月1月，平均气温-19.2℃，极端最低气温-39.5℃。最热月7月，平均气温22.8℃，极端最高气温39.9℃。年蒸发量1506.2毫米；年均相对湿度62%。
典型自然事件：扎龙保护区1998年发生特大洪水，2001年发生严重荒火。
区域范围
保护区南北长65公里，东西宽37公里，总面积21万公顷，其中核心区7万公顷，缓冲区6.7万公顷，实验区7.3万公顷。
保护区由乌裕尔河下游流域一大片永久性季节性淡水沼泽地和无数小型浅水湖泊组成，沼泽地最大水深0.75米，湖泊最大水深达5米。湿地的周围是草地、农田和人工鱼塘，每年共有6种鹤类在此繁殖和停歇，占世界鹤类种类的40%，保护区河道纵横，湖泊沼泽星罗棋布，湿地生态保持良好。
保护目标
保护对象
主要保护对象为丹顶鹤等珍禽及湿地生态系统，是中国北方同纬度地区中保留最完整、最原始、最开阔的湿地生态系统。
植物资源
保护区内具有高等植物468种，隶属于67科，草本植物占绝大多数。本区无特有种，除世界种及大陆广泛分布种外，蒙古植物区系成分占15.2%；达乌里植物区系成分占14.5%；满洲植物区系成分占12.7%；华北植物区系占4.1%。根据扎龙地区植被的建群种、地形地势、水分条件、群落的结构与外貌、土壤种类等生物与非生物因子，可将该区植被分为4个类型。
动物资源
保护区有鱼类46种，隶属于9科。两栖类、爬行类相对贫乏，两栖类有四科六种，分别为极北鲵、大蟾蜍、花背蟾蜍、无斑雨蛙、黑斑蛙、黑龙江林蛙；爬行类有鳖和麻蜥两种。兽类21种，隶属5目9科。昆虫类277种，隶属于11目65科。
鸟类约260种，隶属17目48科。其中国家重点保护鸟类有35种，最为著名的是鹤类，全世界有15种，中国有9种，本区就有丹顶鹤、白鹤、白头鹤、白枕鹤和蓑羽鹤6种，不愧为独步世界的“鹤乡”。其中四种为繁殖鸟，全世界现存丹顶鹤2000只，本区即有346只的繁殖种群，占全世界丹顶鹤总数的17.3%，现已列入全球濒危种类。白枕鹤有34只，灰鹤1986年第一次发现巢，蓑羽鹤有50多只。有国家一、二级保护鸟类35种，一级有丹顶鹤、白枕鹤、白琵鹭等。沼泽边缘和临近农田常见到大鸨。除丰富的鸟资源外，还有20种兽类，包括狼、赤狐、狍、獾和黄羊等；两栖类四种，有中国林蛙、黑斜线蛙、列斑雨蛙、花嘴蟾蜍；爬行动物有3种，包括蜥蜴、淡水龟等；水生鱼类40种，鲫鱼最为丰富。
管理机构
扎龙自然保护区设有保护区管理局，建在保护区的中部偏西，主要任务是湿地保护水禽、鹤类科研繁育。几个小岛上有居民居住。
旅游资源
扎龙自然保护区中的“扎龙湖观鸟旅游区”长8公里，宽9公里，面积1550公顷，包括：
榆树岗，观鸟者可以接待处听情况介绍，看有关扎龙自然保护区和鹤的录象电影，登望鹤楼远眺鹤类等水禽赖以栖息繁殖的湿地景观，及参观展览厅和鹤类驯养繁殖场；
龙泡子（扎龙南湖）大泡子（扎龙北湖）、西沟子（系自然河道）和扎龙养鱼池，观鸟者可以明水水面观察到众多的雁鸭类、秧鸡类、鸥类等游禽及在近水草甸栖息的小涉禽；
九间房、大场子，为芦草沼泽景观，观鸟者可以观赏到鹭类、鹮类的群巢区和鹤、鹳等涉禽及沼泽猛禽；
土木克西岗，可看到大量农田居民区鸟类；
扎龙苗圃及其毗邻草甸草原，可观察到林栖鸟类和草原旷野鸟类及大鸨、蓑羽鹤等。在“扎龙湖观鸟旅游区”里，游客可观保护区和鹤的录象电影，登楼凭眺湿地景观，参观养殖场，在苗圃和林场内，可观察到林栖鸟类和草原旷野鸟。
交通线路
外界交通
齐齐哈尔市飞机场至扎龙保护区约36.6公里，途经水边公路、齐扎公路，车程约45分钟；公交车乘坐111路至火车站换乘306路，车程约2小时10分钟。
齐齐哈尔市高铁南站至扎龙保护区约30.8公里，途经水边公路、齐扎公路，车程约40分钟；公交车乘坐28路至大岗子换乘306路，车程约2小时。
齐齐哈尔市火车站至扎龙保护区约29.7公里，途经联通大道、齐扎公路，车程约40分钟；公交车乘坐306路，车程约1小时。
市内自驾
自驾游可以上G10绥满高速、S19嫩泰高速进入齐齐哈尔市市区，沿联通大道前行2.5公里左右左转，进入齐扎公路前行22公里左右即可到达。
市内公交
已经到达齐齐哈尔市市内选择乘坐公共交通出行，可以乘坐市内公交306路。乘坐地点：齐齐哈尔市龙沙区龙南街天成运业集团院内（齐齐哈尔市糖酒大楼斜对过）。
