历史沿革
1952年，河南省委为适应卫生事业发展需要，成立“河南省妇幼保健院”，设床位25张，直属省卫生厅，地址位于当时的省会开封市东大街34号，占地约5亩。初建之初有职工50余人，其中包括接收教会医院医务人员30人，日本人8人（以后陆续回国）。
1954年，随省会迁入郑州，更名为“河南省妇产科医院”。因当时新院尚未建成，暂设于菜市街省二院（现郑州市第三人民医院）内。
1956年，占地23亩的新院建成，迁入新址（现在位置），并于8月1日正式开诊。
1970年1月，省革委会响应国家“战备疏散”的号召，决定撤销包括“河南省妇产科医院”在内的几所省直医疗卫生机构。医院停诊，迁至信阳，合并于信阳地区人民医院妇产科。
1973年，国外团体来郑州考察社会福利事业，要求参观专门的妇婴医院，省革委会立即批示开始恢复建立“河南省妇产科医院”。
1974年5月，河南革委会下发豫卫学[74]第二号通知，决定将正在恢复筹建的“河南省妇产科医院”划归河南医学院作为教学基地，改称“河南医学院第二附属医院”。同时撤销了河南医学院第一附属医院妇产科，将其全部人员并入新成立的“河南医学院第二附属医院”。
1975年3月8日，“河南医学院第二附属医院”正式开院。
1981年，5层门诊楼（现在急诊科位置）落成。
1981年，内科（消化系）、外科（普外、胸外）相继从河南医学院第一附属医院部分迁入，医院被批准为综合性医院。
1984年12月，更名为“河南医科大学第二附属医院”。
1986年，9层病房楼（现1号住院部）落成。
1993年3月，获批成立河南医科大学第二临床医学院。
1996年9月，医院内科学（消化内科）获得博士学位授予权。
2000年7月，郑州大学、河南医科大学、郑州工业大学三校合并，强强联合，医院更名为“郑州大学第二附属医院”。
2006年3月28日，医院高17层的外科病房楼（现2号住院部）正式投入使用。
2012年7月，郑州纺织机械厂医院并入，成为郑州大学第二附属医院南阳路院区。
2014年8月29日，医院高29层的内科病房综合楼（现6号住院部）开始投入运营。
2015年3月，正式挂牌全国三级甲等医院。
2016年9月，南阳路院区被批准为郑州大学眼耳鼻喉医院。
2016年12月26日，郑州大学第二附属医院经开区新院区举行奠基仪式。
2018年1月，医院重症医学入选国家卫计委疑难病症诊治能力提升工程。
2020年7月，医院经开区新院区主体工程顺利封顶。
几十年来，在社会各界的广泛关注和大力支持下，在几代教职工的辛勤努力下，医院取得了长足的发展，目前已经成为一所集医疗、教学、科研、康复、预防、培干为一体，学科设置齐全，技术力量雄厚，医疗设备先进的大型省级综合性医院，成为河南省重要的医学人才培养的摇篮和基地之一，为河南的卫生事业谱写了一曲绚丽篇章。
医院理念
医院坚持“以评促建、以评促改、评建结合、注重内涵”提高水平的创建方针，在医院管理、学科建设、医疗质量、医疗安全、人才培养、科研教学、医院服务等各个方面，强基础、抓内涵，快速、稳步、持续推进创建工作。
在创建过程中，郑州大学第二附属医院把创建三级甲等医院与推进医改重点工作、卫计委“医疗质量万里行”、创建“平安医院”、“三好一满意”活动及河南省“十大指标”宏观监管等有机结合起来，纳入医院的中心工作，整体部署，扎实推进。
医院文化
医院宗旨：以病人为中心
医院精神：医病、医身、医心、忘名、忘利、忘我
医院院训：厚德、博学、精医、济世
医院愿景：特色突出、国内知名
