剧情简介
游城十代在前往决斗学院实技测验的途中，与传说中的决斗者——武藤游戏偶遇，并从武藤游戏手中获得一张幸运卡「羽翼栗子球」。不过因为是勉强赶上实技测验，笔试成绩又不佳，库洛诺斯老师本想亲自为游城十代关上入学大门，没想到这反而成为他不平凡生涯的开始。
第一年(1年级)
为了夺取被封印在决斗学院地底遗迹中，拥有毁灭世界力量的三幻魔「幻魔皇拉比艾尔」、「降雷皇哈蒙」、「神炎皇乌利亚」，出现名为「七星」（SEVEN STARS）的神秘团体。相应的，决斗学院方面的游城十代、天上院明日香、万丈目准、三泽大地、恺撒亮、库洛诺斯·德·梅迪奇老师和大德寺老师，被选为七星门钥匙的守护者，并与七星猎人进行争斗。发现大德寺也是七星之一，就在战胜七星不久，幕后黑手影丸理事长突然现身，发动七星门钥匙真正的功用，开启了唤醒三幻魔力量的仪式……
第二年(2年级)
三幻魔事件结束后，前田隼人成为游戏设计者，恺撒成为职业决斗者，相继离开战斗游戏学院。不过有迪拉诺剑山等厉害的新生入学，还有爱德·菲尼克斯、斋王琢磨等极为厉害的角色故意装成新生进入决斗学院。
被爱德击败的游城十代和丸藤亮受到“光之波动”的影响。无法决斗的游城十代遇到了来自新空间的使者，找回了对决斗的热忱与兴致。另一方面，连败中的恺撒接触到地下决斗，在那重生为地狱恺撒。同时，万丈目准、天上院明日香、三泽大地等人也相继被“光之波动”所侵蚀，欧贝利斯克克·蓝宿舍变成了光之结社的据点。
到童实野町修学旅行的十代一行人，被迫接受斋王的妹妹美寿知的考验，并得知“光之波动”的真相。回到决斗学院的鲛岛校长宣布GX大赛开幕，这场原本要让学生和职业决斗者交流，进而提升学生决斗能力的活动，却意外成为牵扯到地球存亡的事件。
在最后的对决中，尽管爱徳召唤出了「命运英雄血魔-D」却还是败给了斋王，十代在之后立即向斋王挑战，成功打败了被“破灭之光”操控了的斋王，拯救了世界。另一方面，恢复正常的万丈目在GX大赛中不断获胜，击败了前来挑战的早乙女礼成为冠军，礼也因此进入决斗学院的奥西里斯·红。
第三年(3年级)
光之波动事件结束后，鲛岛校长为了提高学生的决斗水平，从决斗学院四所分院请来约翰·安德森、奥斯丁·欧布莱恩、吉姆·克劳戴尔·库克、阿蒙·加勒姆和眼镜蛇老师。
按照眼镜蛇老师的指导方针“公开决斗（Disclosure Duel）”，让学生戴着“Dis-belt”进行决斗，然而众人渐渐发觉事情不单纯，于是展开调查。但未能及时阻止，决斗学院被传送到异世界，突然来到异世界顿时让众人乱了头绪，还得对抗「尤贝尔」利用学生制造出来的僵尸，最后在两个世界的通力合作之下，成功的回到原来的世界。
为了救出迷失在异世界的约翰，十代等人再次前往异世界，在这里每场决斗都必须赌上性命。不断独自前进的游城十代，在同伴死亡和指责下，被内心黑暗吞噬成了「霸王十代」，因为吉姆和欧布莱恩的牺牲终于让他恢复正常，可是自责的他无法再使用融合。然而看到恺撒奋战的身影，让他获得前进的力量，克服心理障碍救回约翰，但这关系到12个次元的危机并未就此结束。
第四年(3年级)
因为三幻魔、光之波动和尤贝尔事件，造成时空扭曲让「Darkness（黑暗魔王）」来到这世界。在毕业前夕，众人都在为未来烦恼的时候，世界已被「Darkness」吞噬了，游城十代成了最后的希望[1]。在与约翰合力打败藤原优介后，又孤军奋战，最终用希望与信念唤醒迷失自我而被封闭的众人且打败了「Darkness（黑暗魔王）」。
毕业典礼结束后，众人还在毕业舞会狂欢时，游城十代已经收拾好行李，准备一个人默默离开，却在「羽翼栗子球」的引导下，与传说中的游戏王武藤游戏进行一场真正的「毕业决斗」！
登场人物
主要人物
游城十代
使用卡组：英雄卡组，即元素英雄卡组和新空间卡组；邪心英雄牌组（变为霸王十代时使用）
决斗类型：享受决斗乐趣，相信卡组、相信抽卡的天才型（灵感派）
主力怪兽：元素英雄火焰翼人、元素英雄新生侠
能听到精灵之声，天才之主人公。入学时得到初代决斗王武藤游戏所赠的羽翼栗子球卡。是奥西里斯·红的希望之星和长久性学生（在第一次升学考试中他因为赢了万丈目所以有机会升入太阳神·黄但是他没有去，因为他喜欢奥西里斯·红，详情见第4集）。拥有与武藤游戏一般不会放弃和相信卡组的信念。使用E·HERO卡组，善于运用融合。光之波动时得到了自己小时候设计的新空间卡组。拥有奇迹抽卡的能力，享受决斗的乐趣，但在经历不断的严酷战斗（尤其是在尤贝尔事件）之后逐渐成熟起来，拥有了决斗者应该背负责任这一觉悟。从第157集开始，他获得了一个特异功能，当他的双眼变成不同颜色时，可以让决斗精灵实体化。为人十分迟钝乐天，特别是对于爱情。拥有第二人格——霸王十代。
万丈目准
（日文发音的把戏，万丈目在别人称呼自己时会说“先生”以表示请对方尊称“先生”，后来被误会为发音类似的“闪电”）
使用卡组：组合怪兽卡组、武装龙卡组、扰乱卡组、0攻击力卡组；白骑士团卡组（光之波动事件时）
决斗类型：骄傲自大、无懈可击型
主力怪兽：VWXYZ-神龙强击炮、武装龙LV10、扰乱之王
已经很沦落了吗?原来是精英!大财团万丈目集团的三子，入学时是号称新生中的决斗帝王，使用组合怪兽卡组。起初看不起蓝宿舍以外的学生，在被游城十代打败之后流落至北方分院，观念发生了变化，并增加了武装龙卡组和扰乱卡组。在多次事件中得到十代的帮助，逐渐认同了十代并正视自己，最终成为毕业生中3名优秀学生之一。3年级时致力于进入职业决斗。虽然早期骄傲自大的形象十分惹人厌，但是后来被十代的感染洗去了傲气，并逐渐表现出可爱的一面。
宿舍：起先为欧贝利斯克克·蓝优等生，后出校，回来后沦为奥西里斯·红（2年），最后回到欧贝利斯克·蓝（3年））
天上院明日香
使用卡组：人工智能/生化女孩卡组、冰之卡组（光之波动事件时）
决斗类型：华丽拔尖的使用仪式怪兽
决斗学院一流之女王，在学院中是人气偶像。表面刚强却也温柔地对待朋友的决斗者。吹雪失踪之后经常在晚上和丸藤亮在灯塔下讨论线索，视丸藤亮为兄长。邂逅十代之后十分欣赏十代的决斗精神和信念，在各个事件中多次得到十代的救助，逐渐对其产生好感。曾经想留校作为研究生，在和十代组队决斗之后坚定了留学的信念，但最终看到十代好像不在乎自己，未向十代表白。是毕业生的优秀学生之一。
宿舍：欧贝利斯克·蓝3年
丸藤翔
丸藤亮的弟弟。在红宿舍邂逅十代之后，将其视为自己精神上的支柱，称呼十代为“大哥”，一直不离十代左右。起初有些软弱，但在十代的感染下及不断的经历中逐渐成长，善良而可爱的他后来成为毕业生中的优秀学生，继承并超越了自己的哥哥。
宿舍：奥西里斯·红（一年级）-太阳神·黄（二年级）-太阳神·黄（三年级）-欧贝利斯克·蓝（最后）
三泽大地
使用卡组：6种属性卡组（六合卡组）磁石卡组
决斗类型：数字式研究理论教学派型
主力怪兽：水龙
有第一名的优秀入学决斗成绩的决斗者，善于使用数学理论进行组卡和决斗。日常生活中也经常应用自己的高智商与数学理论，黑板、墙壁甚至是卡片上都写着他的草稿。十代的好友。三幻魔事件时喜欢上了“七星”之一的塔尼娅。光之波动事件时受控，在目睹了运用“大一统”决斗理论的教授和十代的决斗之后恢复，致力于新决斗理论。尤贝尔事件前已经进入异次元，后来再次随十代等人进入异次元。曾劝导十代接受内心的霸王十代。最后与塔尼娅一起留在了异次元。
宿舍：太阳神·黄3年
使用卡组：电子龙卡组、暗黑电子/生化机械卡组
决斗类型：尊重对手；渴望胜利，追求刺激型（成为地狱恺撒后）
主力怪兽：电子终结龙、铠黑龙-电子暗黑龙
丸藤翔的哥哥，原决斗者学院欧贝利斯克克·蓝的学生，电子流继承人，别名凯撒亮，跟天上院吹雪是要好的朋友，实力之强就连学院里的老师也无人能敌!除了爱德·菲尼克斯曾打败过他以外，几乎未曾尝过败绩，与主角十代的毕业对决也只是以平手告终。后变成地狱凯撒亮，在职业联赛外暗中活动的职业联赛决斗者，但是由于长期进行黑暗决斗给身体的负担过大和使用暗黑电子牌组导致心脏衰竭。尤贝尔事件时冒着生命危险再次与约翰（此时被尤贝尔控制）交手并告诫十代不要再把自己看成小孩。后从异次元归来，在自己的弟弟超越自己之后决定从头努力，兄弟两人一同进军职业决斗。
天上院吹雪
使用卡组：华丽的舞台卡组/真红眼黑龙卡组
决斗类型：龙族型
主力怪兽：真红眼暗龙
明日香的哥哥，曾经是决斗学院三大天才学生之一。后因藤原优介进入Darkness世界，在三幻魔事件时成为“七星”之一，后被十代击败而恢复。因曾经长期失踪过，所以有留级。外表帅气，在学院里是人气偶像，很关心自己妹妹的感情问题，曾经指导万丈目恋爱技巧。能够冷静而全面地分析决斗局势。在各个事件中见证了十代及其他后辈的成长。
宿舍：欧贝利斯克·蓝3年（留级）
（注：吹雪和丸藤亮同是2年级时，因为不知名原因失踪后加入“七星”组织，即是GX第一部的那个邪恶组织。被击败清醒后已经是丸藤亮3年级的时候，所以回到学校继续留读2年）
爱德·菲尼克斯
使用卡组：E·HERO元素英雄卡组（所使用的融合怪兽与十代有差别）以及D·HERO命运英雄卡组
决斗类型：命运绝对型
主力怪兽：命运英雄教义人命运英雄血魔-D
世界著名的明星职业决斗者，在世界比赛中无败绩，天才决斗者，甚至初登场时以压倒性的优势击败了凯撒，并挫伤了他的自尊心。早年与斋王琢磨是挚友、同伙，后来成为十代的朋友，一起击败了斋王琢磨的妹妹斋王美寿知，并尝试帮助斋王琢磨赶走内心因为光之波动而产生的邪恶第二人格，但是在决斗中领了便当（虽然后面有复活）。在尤贝尔篇，看到阿蒙·加勒姆尝试牺牲爱人来召唤出艾克佐迪亚，输给了自己内心的正义，从而领了便当（虽然后面也还有复活）。
初登场：53集
迪拉诺剑山
使用卡组：恐龙卡组
决斗类型：进化恐龙型
比十代低一级的学生。热爱恐龙。腿骨层做手术，一时无处取材就用了恐龙化石。入学后与十代决斗后追随十代，称呼十代为“大哥”，为此和丸藤翔时有吵嘴。光之波动事件时由于身上有恐龙DNA，不受斋王控制。尤贝尔事件后成为黄宿舍的首席。毕业典礼上作为在校生发言。迟钝程度不输于十代。
宿舍：太阳神·黄2年
约翰·安德森
出身校：决斗学院北方分校3年生
使用卡组：宝玉兽卡组
决斗类型：和宝玉兽并肩作战型（等同于天才型）
主力怪兽：究极宝玉神虹龙
十代的挚友。以坑人为决斗中的最大忌讳。早期只拥有普通的宝玉兽，但仍然拥有与十代相当的决斗技巧。尤贝尔篇得到虹龙，并使用虹龙的力量把大家从异次元解脱了出来，自己则领了便当，并且“十代迫切想要救约翰的心思”成为尤贝尔篇下一幕的开端。后来被尤贝尔附体黑化，宝玉兽也黑化为高等宝玉兽，虹龙也黑化为虹暗龙，并在决斗中击败了凯撒，令其输给自身内心的黑暗领了便当。后在输给十代后洗白。约翰与十代的羁绊也因为「超融合」卡有了结晶：「虹皇新宇侠」。
初登场：106集
约翰·安德森
其他人物
库洛诺斯·D·梅迪奇
年龄：35
使用卡组：古代机械卡组
主力怪兽：古代机械巨人
决斗类型：骄傲的贵族型
台词：说话结尾带有「～なのーね」（诺呢~）
骄傲自大的欧洲贵族。认为自己的工作是“发掘决斗明星”，也认为决斗是庄严神圣的事情，容不得“黑暗决斗”的说法。精英主义者。起初十分看不起作为劣等生的十代，但是日复一日，在十代的感染下，渐渐抹去了骄傲自大，并终于摆脱了对十代的偏见。
初登场：01集
前田隼人
年龄：16
使用卡组：OZ（考拉）卡组
决斗类型：弱气
一个直率而失败的人。缺乏决斗天分，但是在十代等人的热心帮助下，虽然没有胜过父亲，但他努力的表现向父亲索得了留在决斗学校的权利。后来因为DIY卡片技术出色，被帕加索斯挖去了国际幻想社，自此从事卡片DIY事业。他为十代设计的卡片是：「摩天楼2-英雄都市」。
初登场：02话
早乙女礼
宿舍：欧西里斯·红1年
使用卡组：恋爱的少女卡组、卵孵化卡组
决斗类型：专心型
稍稍有些早熟的恋爱少女。因为爱上丸藤亮，谎报年龄与性别提早进入了决斗学校，但是被十代等人揭穿，送了回去。一年后再次出现在剧情中，取代明日香成为了伪女主角，但是十代对于爱情实在是太迟钝，并没有察觉到礼的爱慕，也对礼没有什么特别的感情。
登场：20集
拿破仑教头
使用卡组：玩具军队卡组
决斗类型：我的字典上没有不可能型
主力怪兽：玩具皇帝
台词：说话结尾带有「といえます」（是也）
总是和库洛诺斯教授作对，其实不管是决斗水准还是思想境界，两个人都是一个级别。
（注：这个人物是对历史人物拿破仑·波拿巴的恶搞）
初登场：53集
斎王琢磨
卡组：秘仪之力卡组
决斗类型：预知未来型
主力怪兽：秘仪之力EX-光之支配者秘仪之力EX-暗之支配者
一个拥有预知未来能力的人。随时玩着他的塔罗牌。拥有迷惑人心的能力，并使用那种能力创办了光之结社，成为了一代反派。后来因为光之波动而产生邪恶的第二人格，以邪恶的第二人格的消灭完成洗白，自此也是十代的伙伴。尤贝尔篇被尤贝尔利用对于妹妹的关爱，和妹妹双双领了便当。
初登场：53集
加纳马尔登
宿舍：太阳·黄1年
欧贝利斯克·蓝
害羞的新生。真实身份是拿破仑教头的儿子。
初登场：106集
眼镜蛇教授
出身校：决斗学院西校教授
使用卡组：毒蛇卡组
决斗类型：阴险狡诈型
主力怪兽：毒蛇王维诺米农、毒蛇神维诺米农纳加
从西校请来的特别讲师。因为儿子死于非命，被尤贝尔利用心中对于儿子的思念而成为尤贝尔的棋子。从西校来到本校后大力推崇“死亡决斗”，让大家佩戴帮助尤贝尔收集能量的护腕。在被十代击败后，陷入了尤贝尔提供的幻觉，被诱导跳崖从而死亡。
初登场：106集
阿蒙·加勒姆
出身校：决斗学院东校3年生
使用卡组：云魔物卡组/埃及使者卡组
决斗类型：谨慎地组织、冷静地实行类型
加勒姆财阀（一个远远超越万丈目财阀的大企业集团）董事长的养子，大智慧的哲学家类型，似乎仅仅通过目光接触就能看透一些什么。被尤贝尔利用对于爱人的关爱而成为尤贝尔的棋子，作为内应存在于主角集团。跳反后成为尤贝尔的局设的一部分，诱导爱德·菲尼克斯领了便当。
初登场：106集
奥斯辛·欧布莱恩
出身校：决斗学院西校3年生
使用卡组：火山卡组
决斗类型：任务完成型
沉着冷静制订作战方案的头脑，日日锻炼不会怠慢的寡默的战士。和眼镜蛇教授同一个学校。在决斗中成为了十代的朋友。在尤贝尔篇，为了解救成为霸王的十代，和吉姆先后领了便当。在Darkness篇输给了内心的黑暗，第二次领了便当。十分成熟可靠的人，但是他的长处不包括“热血勇敢”。
初登场：106集
吉姆·克劳戴尔·库克
出身校：决斗学院南校3年生
使用卡组：化石卡组
决斗类型：全部怪兽都变成化石型
热爱地质学和考古学。亲昵地称自己的宠物鳄鱼卡莲是家族成员。决斗中成为十代的朋友。被绷带遮起来的右眼实际上是一块拥有进入他人内心的力量的红宝石。在尤贝尔篇，为了拯救霸王十代，开始解封那种力量，和奥斯辛先后领了便当。一个献身给大地的人，热血狂放，不拘小节。
登场：106集
尤贝尔
使用卡组：于贝尔卡组决斗类型：自私型
主力怪兽：
尤贝尔
尤贝尔-被憎恶的骑士
尤贝尔-极度悲伤的魔龙
十代前世的爱人。十代前世——霸王华年早逝后，把自己改造为精灵，一路保护着霸王的灵魂。认同“相爱相杀”，认为互相给予痛苦是相爱的表现。拥有心计，懂得利用人内心的黑暗和诉求来让别人成为自己的棋子，并且几乎把孙武的三十六计用了个遍。主角集团的成员，包括万丈目准、天上院吹雪、天上院明日香、丸藤亮、爱德·菲尼克斯、奥斯辛、吉姆、斋王琢磨、约翰·安德森，几乎都是既聪明又强大不易上当的角色，却在尤贝尔的韬略下一一领了便当。后来被十代通过「超融合」的卡片吸收，成为守护十代的背后灵。
初登场：113集、130集（真身出现）
尤贝尔
藤原优介
宿舍：欧贝利斯克克·蓝3年（留级）
使用卡组：净卡组
决斗类型：冷酷型（被Darkness控制时）
原来的他是决斗学校三杰之一，与天上院吹雪、丸藤亮齐名，也和天上院吹雪是挚友。委身Darkness后获得了抹除某个人的存在痕迹以及让时光倒流的能力。因为委身于Darkness，便把自己从大家的记忆中抹除，从而成为Darkness篇的准BOSS。被十代击败后从Darkness中脱身，并得到洗白。
初登场：第157集
制作人员
原作：高桥和希、艺术家工作室
监督：辻初树
系统构成：武上纯希
决斗构成：彦久保雅博
脚本：武上纯希、吉田伸、前川淳、面出明美、铃木やすゆき
登场人物&；メインモンスターデザイン：原宪一
演出主要：鹤田寛
音响监督：平光琢也
录音监督：三ツ矢雄二
音乐：蓑部雄崇
动画制作：ぎゃろっぷ
CAST
游城十代=KENN（大桥贤一郎）
天上院明日香=小林沙苗
天上院吹雪=游佐浩二
丸藤翔=铃木真仁
前田隼人=莲岳大
丸藤亮=前田刚
万丈目准=松野太纪
三沢大地=増田裕生
クロノス·デ·メディチ（克洛诺斯·德·美蒂奇）=清水宏
鲛岛校长=岩崎征実
大徳寺先生=山口胜平
エド·フェニックス（爱德·菲尼克斯）=石田彰
斎王琢磨=子安武人
ティラノ剣山（迪诺拉剑山）=下崎紘史
ナポレオン教头（拿破仑教头）=龙田直树
D·D=井上和彦
约翰·安德森=入絵加奈子
ファラオ（法老王）=石桥美佳
鮎川恵美=根谷美智子
枕田ジュンコ=谷内友美
浜口ももえ=长浜満里子
トメさん=长浜満里子
セイコ=钉宫由稀
タイタン（泰坦）=若本规夫
ゴリ介=岩间健児
前田熊蔵=郷里大辅
迷宫兄弟（迷）=竹本英史
迷宫兄弟（宫）=西村仁
万丈目长作=平野贵裕
万丈目正司=冨田真
SAL=木内秀信
博士=田村连
タテワキ=平野贵裕
サイコショッカー（精神震撼者）=鹤冈聡
高寺=平野贵裕
向田=大坪瞳
井坂=下崎紘史
绫小路ミツル=うえだゆうじ
小原=樋口智恵子
大原=かねこはりい
大山=土田大
神楽坂=日野聡
早乙女レイ（早乙女蕾）=仙台エリ（仙台惠理）
国崎康介=中村大树
茂木もけ夫=渡辺庆
市ノ瀬=泉尚挚
江戸川游离=永野善一
赤井=中村太亮
青岛=知野桂树
黄田=下崎紘史
绿川=平野贵裕
雑鱼田=岩间健児
雑鱼岛=山岸弘一
墓守の长=岛田敏
サラ（沙拉）=水谷优子
影丸=麦人
ダークネス（黑暗）=游佐浩二
カミューラ（卡缪拉）=入絵加奈子
カイバーマン（海马侠）=津田健次郎
タニヤ（塔尼娅）=小宫和枝
バース=下崎紘史
アナシス（阿那西斯）=西松和彦
ザルーグ（沙鲁达[黑蝎])=楠大典
ゴーグ（高戈[黑蝎])=松本忍
クリフ（克里夫[黑蝎])=林伊织
ミーネ（美奈[黑蝎])=江马ゆかり
チック（齐克[黑蝎])=中村太亮
アビドス3世（阿比多斯三世）=宫野真守
ボーイ（光雄）=胜杏里
少年光雄=吉田麻子
影丸（年轻）=神奈延年
五阶堂宝山=石桥美佳
胡蝶兰=松井菜桜子
少年エド（少年爱徳）=吉田麻子
阿蒙=峯畅也
奥布赖恩=川本成
吉姆=岩桥直哉
アクア?ドルフィン（水色海豚）=高杉紘平
光の宇宙人=平野贵裕
ハネクリボー（飞翼毛球）=石桥美佳
ブラック·マジシャン·ガール（黑魔女）=中尾友纪
恋する乙女（恋爱少女）=鲑延未可
フェザーマン（羽翼人）=平野贵裕
スパークマン（闪电侠）=下崎紘史
おジャマ·イエロー（扰乱者·黄）=长浜満里子
おジャマ·グリーン(扰乱者·绿）=下崎紘史
おジャマ·ブラック（扰乱者·红）=岩间健児
帕枷索斯·J·古洛福德=高杉Jay二郎
武藤游戯=风间俊介
海马瀬人=津田健次郎
武藤双六=宫泽正
主题曲
歌曲
歌
作词
作曲
编曲
OP
『快晴?上升?ハレルーヤ』（1话-33话）
JINDOU
MASAYA/NAGATA/TAKE
MOJI/MASAYA
JINDOU
『99%』（34话-104话）
BOWL
丸山和弘
锦戸笃/丸山和弘
BOWL/山口一久
『ティアドロップ』（105话-156话）
丸山和弘
BOWL
『Precious Time,Glory Days』（157话-180话）
サイキックラバー
YOFFY
大石宪一郎
ED
『限界バトル』（1话-33话）
JAM Project
影山ヒロノブ/奥井雅美
影山ヒロノブ
河野阳吾
『Wake Up Your Heart』（34话-104话）
KENNwith The NaB's
The NaB's
前田克树
芳野藤丸
『太阳』（105话-156话）
BITE THE LUNG
远藤満
BITE THE LUNG/片寄明人
『Endless Dream』（157话-80话）
きただにひろし
IPPEI
动画目录
三幻魔篇（001-049）
001.继承武藤游戏的人
002.火焰翼人
003.星型人工智慧
004.五重合体VWXYZ
005.黑暗的恶魔牌组
006.羽翼粟子球的奇迹
007.翔的交通工具牌组
008.最强！电子终极龙！
009..必杀一击！回到饭桌！
010.十代和翔宿舍决斗（前篇）
011.十代和翔宿舍决斗（后篇）
012.氧气+氢气=H2O龙
013.野性解放！猴子决斗！
014.VS人造人索加
015.青春的网球决斗
016.黑夜的哥布林王
017.抽牌！抽牌！抽牌！
018.VS游戏牌组（前篇）
019.VS游戏牌组（后篇）
020.恋爱的少女
021.融合封印！十代VS三泽（前篇）
022.融合封印！十代VS三泽（后篇）
023.脱力！木瓜豆腐决斗！
024.复活！万丈目闪电！
025.VS万丈目闪电（前篇）武装龙的威胁
026.VS万丈目闪电（后篇）武装龙LV7
027.课外学习是黑暗决斗（前篇）
028.课外学习是黑暗决斗（后篇）
029.VSDarkNess（前篇）真红眼黑龙的挑战
030.VSDarkNess（后篇）真红眼黑龙的攻击
031.库洛偌斯VS吸血美女卡缪拉
032.恺撒VS卡缪拉！幻魔之门发动
033.光辉！光闪羽翼人！
034.温泉旅情！青眼白龙！
035.兄弟的团结！搞乱三角飓风！
036.三泽地VS亚马逊！娶亲决斗！
037.肉弹决斗！亚马逊的死亡擂台！
038.水中决斗！传说中的城市亚特兰堤斯！
039.名侦探闪电VS黑蝎盗贼团
040.H.E.R.O闪光！
041.暗之斗牛发动！明日香VS泰坦
042.学园祭决斗！黑魔导女孩乱入
043.给明日香的第二次恋爱机会！？
044.第七人的影子
045.VSArmnile！E.HERO完全封印
046.地水炎风融合！贤者之石！
047.明日香VS万丈目！人工智能天使－弁天－
048.VS影丸（前篇）两个幻魔
049.VS影丸（后篇）三幻魔觉醒n
光之波动篇（050—104）
050.准人V库洛偌斯！艾雅斯岩的日出！
051.VS恺撒（前篇）能量融合×电子终极龙
052.VS恺撒（后篇）最终融合
053.命运的开始！新入生爱德.菲尼克斯
054.闪电VS精英君金属捣乱王出发
055.狄拉诺剑山登场
056.翔VS昆虫少女！昆虫女王
057.恺撒VS爱德职业联盟赛的决斗
058.VS爱德（前篇）E.HEROE.HERO!
059.VS爱德（后篇）命运的D.HERO!
060.明日香VS吹雪兄妹的偶像之路
061.斋王登场！命运的占卜卡
062.新E.HERO！NEOS！
063.剑山VS咖哩魔人！辛辣决斗！
064.翔VS剑山！对大哥的火热想念决斗！
065.地狱恺撒亮聚合机甲终结龙！
066.十代初梦决斗！
067.VS爱德（前篇）新的力量！水之新生侠.水之海豚侠
068.VS爱德（后篇）炎之新生侠.火炎NEOS！！
069.克洛诺斯VS拿破仑！玩具士兵的进军！
070.明日香VS万丈目白闪电！
071.VS海上霸者巨大战舰-旋轮开进！
072.破坏“卡组破坏“吧
073.剑山VS斋王！这是恐龙DNA！n
074.黄泉青蛙！生之青蛙！死亡青蛙！
075.修学旅行搭档决斗
076.究极合体！王者联盟077.恐怖的四帝卡组！造物主EMA！
078.最强组合！？十代&
爱德！（前篇）
079.最强组合！？十代&爱德！（后篇）
080.绝望国度的美少女爱丽思！
081.知识问答比赛！？VS猜谜卡组！
082.三泽大地VS万丈目！
083.地狱恺撒亮VS师尊鲛岛
084.世界大会开幕！目标第一！
085.操纵神卡「太阳神的翼神龙」的男子！？
086.决斗的花道
087.加油！捣乱3人组（上集）
088.加油！捣乱3人组（下集）
089.地狱凯撒VS暗吹雪
090.学园的自尊心
091.一回杀的死神
092.三方决斗
093.白夜的决斗！十代VS明日香（前篇）
094.白夜龙！十代VS明日香（后篇）
095.仁至义尽的兄弟决斗亮VS翔
096.相对性地形！十代VS天才博士
097.登场！谜之世界冠军！
098.终于发动！究极的D之卡
099.十代VS镭射卫星的恐怖
100.究极的秘密仪式「THE WORLD」
101.爱德必杀的一击！「blood D」
102.光之波动VS尼奥斯
103.十代危机！场地魔法「光之结界」
104.胜利的去向？！十代VS斋王
尤贝尔篇（105—156）
105.新学期开始！波折的预感
106.十代和宝玉兽卡组的约翰
107.新空间VS宝玉兽
108.教授·眼镜蛇的刺客
109.十代与炎之奥布赖恩
110.暴龙剑山与化石龙之吉姆
111.万丈目闪电与云卡组之阿蒙
112.闪电VS台风之眼
113.十代VS背叛的元素英雄
114.绝体绝命！满是伤痕的英雄
115.搜捕精灵的基斯
116.宝玉兽vs地狱的守门犬
117.决战！十代vs科布拉教授
118.恐怖！毒蛇王维诺米农
119.三重结体融合！岩浆尼奥斯
120.异世界的战斗！宝玉兽VS神鹰女郎
121.沙漠的生存战！约翰VS蚁地狱
122.决斗学园危机！丧尸学生的恐怖！
123.礼救出作战！E.HEROVS堕天使护士
124.学园分裂！空腹决斗
125.约翰·吉姆·奥布赖恩VS假面三骑士
126.十代VS万丈目·龙骑士暗黑之剑
127.封印解除者·马尔登
128.宝玉兽VS电子终结龙
129.三幻魔的威胁！十代VS马尔登
130.虹龙觉醒
131.皇牌卡大集合！打开吧，次元之门！
132.赌上性命的决斗
133.十代VS暗黑界的斥候斯卡
134.十代VS暗黑界的骑士祖尔
135.十代VS暗黑界的狂王布隆
136.邪心经典发动！暗黑界之魔神虹
137.翔的决心！「友情之证」
138.霸王降临·死亡决斗者们
139.暗黑融合！业火炎魔！！
140.空前绝后·超融合发动
141.恐怖的霸王！彷徨的奥布赖恩
142.生存下来的胜利者就是正义！霸王VS奥布赖恩
143.火山恶魔VS最凶之邪心英雄
144.发动！究级封印解放仪式术
145.究极封印神艾克佐迪奥斯召唤！
146.被封印的融合
147.因缘的对决！电子流VS宝玉兽
148.究极龙对决！电子终结VS黑虹
149.魔神对抗！幻魔VS艾克佐迪亚
150.“尤贝尔”召唤！
151.NEOS VS 高等宝石兽
152.超融合发动！彩虹新生侠
153.被选中之卡对决！元素英雄VS尤贝尔
154.苏醒的霸王十代！
155.彩虹新生侠VS尤贝尔究极态
156.十代复活！？新的启程
Darkness篇（157—180）
157.潜在的威胁！「谜之来访者」
158.再见吧决斗校园！十代选择的道路
159.Darkness的真相！十代VS吹雪
160.融合之魂！新生侠VS五神龙
161.Shall We Duel-我们去决斗好吗？配对决斗的邀请
162.十代VS明日香隐藏了心意的覆盖卡
163.来自精神震撼者的挑战书
164.被继承的电子暗黑龙
165.目标！万丈目，成为职业决斗者之路！
166.武装龙VS龙骑士·D·End
167.报恩的决斗！克罗诺斯VS“吊车尾男孩”
168.毕业决斗开始！新生侠VS荷露斯之黑炎龙
169.决断的代价！奥布赖恩的炎之暗
170.斋王再临！「绝对命运决定力」发动！！
171.命运之终焉！熔岩新生侠VS暗之支配者
172.决斗学园的危机！阻挡在前的宝玉兽
173.Darkness的侵占被夺去的记忆
174.发动！「净界」恐怖的负影响
175.大混战！十代VS约翰VS藤原
176.羁绊守护者虹皇新生侠VS净惰骑士
177.恐怖的组合！「虚无与无限」
178.最后之希望！游城十代
179.再见了十代！泪之毕业礼
180.真正的毕业决斗！十代VS传说的决斗者
