主要职责
（一）
推进全市医药卫生体制改革。贯彻国家和省卫生法律法规，依法监督有关标准和技术规范的执行，拟订全市卫生改革与发展战略目标。
（二）贯彻实施国家基本药物制度、药品法典和国家基本药物目录。负责建立全市基本药物制度并组织实施；依据全省基本药物采购、配送、使用的政策规定，实行药品统一采购、统一配送；会同有关部门提出全市基本药物目录内药品生产的鼓励扶持政策，提出全市基本药物价格政策的建议。
（三）组织实施全市卫生发展规划，统筹规划与协调全市卫生资源配置，指导区域卫生规划的编制和实施。
（四）组织制定并实施农村卫生发展规划和政策措施，负责新型农村合作医疗的综合管理。
（五）制定社区卫生、妇幼卫生发展规划和政策措施，规划并指导社区卫生服务体系建设，负责妇幼保健的综合管理和监督。
（六）负责疾病预防控制工作，制定实施重大疾病防治规划与策略，贯彻国家免疫规划及政策措施，协调有关部门对重大疾病实施防控与干预，负责传染病防治工作的监督管理。
（七）负责卫生应急工作，制定卫生应急预案和政策措施，负责突发公共卫生事件监测预警和风险评估，指导实施突发公共卫生事件预防控制与应急处置，发布突发公共卫生事件应急处置信息。
（八）贯彻国家促进中医药事业发展的法律法规，制定全市中医药事业中长期发展规划，负责全市中医医疗、教学、科研工作，推进中医药的继承、创新与开发。
（九）指导规范卫生行政执法工作，按照职责分工负责职业卫生、放射卫生、环境卫生和学校卫生的监督管理，负责公共场所和饮用水的卫生安全监督管理，负责传染病防治监督。
（十）负责医疗机构（含中医院、民族医院等）医疗服务的全行业监督管理，制定医疗机构医疗服务、技术、医疗质量和采供血机构管理的政策、规范、标准，组织制定医疗卫生职业道德规范，建立医疗机构医疗服务评价和监督体系。
（十一）指导卫生人才队伍建设工作，组织制定全市卫生人才发展规划，组织实施卫生专业技术人员资格标准和医疗机构编制标准，指导卫生事业单位岗位设置和人事制度改革；负责卫生外事和涉外活动。
（十二）承担市级保健委员会的具体工作和重要保健任务，负责各有关医疗单位实施干部保健工作的组织与协调，规范健康教育、健康体检、休假疗养、健康信息管理等工作。
（十三）承担市政府地方病防治领导小组的具体工作，组织协调各有关部门开展地方病的综合防治和科研监测工作。
（十四）承担市爱国卫生运动委员会的具体工作。
（十五）承办市政府和上级主管部门交办的其他事项。
内设机构
直属单位
市人民医院、市肿瘤医院、市第三人民医院、市皮肤病医院、市第五人民医院、市妇幼保健院、市医疗急救中心、市中心血站、市卫生监督所、赣州卫生学校。
