民族起源
胡图族是中部非洲的一个族群，主要聚居于卢旺达和布隆迪，是该两国的最大族群。根据美国中央情报局的资料，84%的卢旺达人以及85%的布隆迪人属胡图族。胡图族与图西族十分相近，他们的语言、体格和文化都没有很大的分别，其差异主要在于社会阶级。比利时和德国殖民时期，外来殖民者选择肤色较浅、鼻梁较高的人群作为统治阶级，称为图西族。
在殖民主义消失后，胡图族掌握了卢旺达的政权，开始对图西族进行报复。与此同时，在布隆迪当权的图西族也对胡图族进行了种族清洗。1990年图西族成立开始进行颠覆政府的活动，随后两族对立导致了胡图族政府开始操纵卢旺达大屠杀，上百万名图西族人被杀。图西族的卢旺达爱国阵线最终联合邻国乌干达军队成功夺取政权。
卢旺达大屠杀
胡图和图西两族分别占卢旺达全国人口的85%和14%，前者讲法语,以农耕为生；后者操英语和斯瓦希利语,从事游牧业。1994年4月,卢旺达的胡图族哈比亚利马纳总统和布隆迪总统一起乘坐的飞机在卢旺达首都机场上空被击毁,两位总统双双遇难。
从此,卢旺达爆发了长达4个月的大屠杀和武装冲突。根据国际红十字会估算,在短短100多天里,卢旺达700多万人口中有近80万人被杀，400万人无家可归，其中200万人逃往国外，酿成了世纪罕见的灾难。这次仇杀的被害者大多为图西族人（占人口多数），不仅如此，胡图族屠杀者对主张民族和解的本民族同胞同样滥杀。
此前20年时间，两族间就曾发生过3次较大的武装冲突(1959年、1963年和1973年)。卢旺达邻国布隆迪的民族问题也与其相似，胡图族与图西族分别占全国人口的85%和13%，两族间也多次发生大规模的流血冲突和军事政变，造成数十万人丧生，上百万人沦为难民，这为以后的刚果（金）的大屠杀埋下了祸根。
遗传学
现代的Y染色体的遗传研究表明，密切的种族的胡图族和其他邻近的班图族人民，特别是图西族之间的血缘关系。像图西人的胡图族主要属于E1b1a单倍型类群（83%），这与从西部非洲的班图人扩张。少数人进行的E2（8%），B（4%），E1b1b（3%）和R1（1%）的分支。
一代又一代的基因抹杀任何可能曾经存在这两个班图语的民族-著名的是身高体建立和面部特征鲜明的物理区别。由于频谱的物理变化中的人民，比利时当局法律规定的种族归属，在20世纪20年代，基于对经济的标准。正式的和离散的社会分工，因此强加给不明确的生物区别。
在几十年的干预在一定程度上，这些类别的透气性具体化了的生物的区别，产生一个更高的精英和更短的下层阶级，但关系不大的基因库已经存在了几个世纪前。社会范畴，因此真实的，但有一点，如果任何检测的胡图族和图西族之间的遗传分化。
后殖民历史
1890年到1918年时卢旺达为德国的殖民地，1918年到1962年为比利时的殖民地。少数民族图西族（约18%）始终统治着占约80%左右人口的胡图族。在比利时人离开后，政权交还给占多数人口的胡图人。在1962年卢旺达独立后，政府也未妥善处理民族之间的对立问题。
在20多年的时间里，卢旺达政府一直对图西族实行种族歧视政策。在大屠杀前的三年里，国家控制的媒体甚至把图西族人视同为国家的敌人，大力加以挞伐和煽动，引起图西族人的恐惧和仇恨。一家受到党政军多名要人支持的RTLM广播电台在大屠杀前九个月，宣传对图西族人的仇恨，甚至公开宣布须被处决的名单。
布隆迪于1962年7月1日获得完全独立。图西族国王（Mwambutsa IV Bangiriceng)建立君主立宪制。但却在1966年时由军人出身的首相罢黜了原本的王子（他才刚篡位没有多久），开始进入军人独裁执政的时期。1972年4月下旬至9月，估计有20万至30万胡图族人被杀害，约30万人成为难民。
1976年让-巴蒂斯特·巴加扎上校在一场不流血政变中的上台。虽然巴加扎领导的是以图西族为主的军事政权，但他鼓励土地的改革，选举制度改革和民族和解。1984年巴加扎作为唯一的候选人，当选为国家元首。这种少数民族占高位的不正常社会结构埋下国家不稳定的恶种，并且在1993年10月时到达最高峰。
那时刚上任才四个月、布隆迪有史以来第一位胡图人身份的元首，也是首任民选总统的梅契尔·恩达达雅（Melchior Ndadaye），遭到主要是胡图族极端分子中政府高官暗杀。恩达达雅的死，导致全面性的种族冲突，在这场种族冲突中至少有二十万的双方人口遭到屠杀，而当中原来有人口6.5万的图西人被屠杀至剩下5000人不到。
截至2006年，胡图族和图西族之间的暴力事件已经平息，但在卢旺达和布隆迪的局势仍然紧张，数十万卢旺达人仍然生活在国外（见大湖地区的难民危机）。
