历史沿革
福建省立医学专科学校
民国26年（1937年）6月福建省立医学专科学校创办于福建闽侯县 ，同年10月，福建省立医院划为该校附属医院。民国27年6月，因抗日战争迁往闽北沙县。同年8月，定名为福建省立医学院，学制6年，毕业生授医学士学位。
抗日战争胜利后，学校迁回福建闽侯县，在闽侯县省立医院和高级工业职业学校旧址（吉祥山）重建校舍，医科学习年限为6年，医学专修科为5年。当时仅有基础学科教师19人，兼职教师3人。
解放前夕，基础学科仅有专任教师15人。附属医院设病床30张，有临床教师12人，在校学生294人。解放前毕业生共279人。
福建医学院
福建医科大学上街校区正门
1949年11月，福建省人民政府接办福建省立医学院，改为福建医学院，学制5年。
1951年，除原设的医学本科专业外，增设医学专科（3年制），还附设中级卫生教育师资专修班。
到1957年，该院建立基础学科17个教研组，有基础学科教师90人，能按教学大纲开出实验课，同时有一所300张病床的附属合组医院。
1958年，该院从吉祥山迁到八一七中路西洋村新校舍，福州协和医院划为附属医院，还确定福建省立医院、福建省妇幼保健院、福州神经精神病防治院、福州结核病防治院、福州传染病院5所为教学医院，形成了一个教学、医疗、科研功能较为完整的高等医学教育体系。
1959年，为适应卫生预防工作的需要，增设卫生系，招收一届学生后，于1962年停止招生。还曾举办2年制卫生干部专修科。1962年，厦门医学院全部学生并入该院。到1965年，学校有教师282人，其中基础学科教师171人，临床学科教师111人，教师中有正副教授和正副主任医师34人、讲师和主治医师85人，在校学生1332人。
中华人民共和国成立后至1965年，共毕业学生3207人、副博士学位研究生2名。该院先后成立放射医学、经络、肿瘤、蛇伤、寄生虫病、创伤、高气压手术治疗、血液病8个研究室（组），取得一定的科研成果，其中“高压氧手术室的建造和临床应用”，开创了中国高压氧医学的临床应用和研究。
“文化大革命”中，学校被迫停办，院领导和一大批教职工被批判、斗争，下放农村，学校资产散失严重，停止招生达4年之久，两所附属医院与学校“脱钩”，分成8组，迁到闽西、闽北8个县，破坏极其严重。
1970年，福建医学院奉命与福建中医学院合并，迁到泉州华侨大学校址，华侨大学医学系并入，改为福建医科大学。1970年，开始招试点班学生（2年制）。1971年，筹建附属第一医院，秋季招收3年制医学专业学生。1972年，设医学、中医两系。1975年，在莆田、龙岩两县举办“社来社去”班，学制2年。
1977年秋，开始招收5年制本科学生。1978年6月，中共福建省委决定福建医科大学迁回福州原址；同年11月，中医系分出复办福建中医学院。
1980年，复办卫生系。1982年6月，恢复附属协和医院隶属关系。同年10月，福建医科大学恢复福建医学院原名。1983年10月，原晋江地区第二医院划为附属第二医院。在此期间，还举办3期在职西医学习中医班和其他短期进修班以及中级技术人员班；附设机构有制药厂、印刷厂。1984年，附属第一医院由泉州迁回福州，“福建医学院附属协和医院”正式恢复。
福建医科大学
1996年4月，经国家教委批准，更名为福建医科大学。相应的附属医院亦更名。
2003年，福建省人民政府确定为重点建设高校；同年以良好的成绩通过了教育部本科教学工作水平评估。
2011年起，筹建“福建医科大学附属第三医院”（2019年1月29日对外试运营）。
2012年11月，入选教育部卫生部第一批卓越医生教育培养计划项目试点高校。
2013年1月，入选国家级大学生创新创业训练计划项目实施高校。5月，入选第一批临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革试点高校。
2018年3月，入选福建省一流学科建设高校。
2019年7月，入选福建省一流大学建设高校。
2020年9月20日，加入海西医学联盟 。
2022年2月17日，福建医科大学与福建省肿瘤医院举行授牌仪式，福建医科大学肿瘤临床医学院成立。
2022年2月27日，福建医科大学妇儿临床医学院成立。
办学条件
院系专业
截至2021年11月，学校设有福建医科大学基础医学院、福建医科大学公共卫生学院、福建医科大学医学技术与工程学院、福建医科大学药学院、福建医科大学护理学院、福建医科大学健康学院、福建医科大学口腔医学院、福建医科大学文理艺术学院、协和临床医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、省立临床医学院、福总临床医学院、临床教学部、马克思主义学院、体育教学研究部、海外教育学院、成人教育学院、继续教育学院等20个学院（部）。
2022年2月，学校新增放射医学专业。
师资力量
截至2017年5月，学校共有教职医护员工10700多人（含附属医院），其中校本部1200多人。在学校1450名专任教师（含附属医院临床教师）中，具有博士学位占40.21%，硕士学位以上占85.17%，高级职称占68.34%。博士生导师138名，硕士生导师787名。
学校专任教师中有国家“万人计划”百千万领军人才1人，“南丁格尔”奖章获得者1人，国家有突出贡献中青年专家3人，“新世纪百千万人才工程”国家级人选6人，教育部新世纪优秀人才支持计划人选3人，卫生部有突出贡献中青年专家7人，教育部优秀青年教师资助3人，教育部骨干教师资助8人，全国高校优秀骨干教师1人，享受国务院特殊津贴专家114人，福建省“百人计划”人选8人，福建省“外专百人计划”人选1人，福建省高校领军人才1人，“闽江学者奖励计划”人选19人，福建省杰出人民教师3人，福建省杰出科技人才4人，福建省特支计划人选21人，海西产业人才高地领军人才1人，福建省优秀专家22人，福建省优秀人才6人，“福建省百千万人才工程”人选63人，福建省高校教学名师13人，福建省高校新世纪优秀人才支持计划人选52人，福建省高校杰出青年科研人才培育计划29人，福建省高校创新团队6个 。
学科专业
截至2017年5月，学校拥有博士后科研流动站2个（临床医学、基础医学），博士学位授予权一级学科2个，二级学科博士学位授权点（不含一级覆盖）2个；硕士学位授予权一级学科8个，二级学科硕士学位授权点（不含一级覆盖）1个；自主设置目录外博士、硕士学位授权二级学科点各2个；硕士专业学位授予权学科6个。2012年起，国务院学位办批准学校成为全国首批临床医学硕士专业学位“全科医学领域”招生单位之一，于2012年开始招生。
学校拥有国家重点（培育）学科1个，国家临床重点专科10个，省级临床重点专科21个，国家中医药管理局重点专科1个，省中医、中西医结合重点专科1个，省“211工程”重点学科2个，省特色重点学科4个，省级重点学科9个 。
截至2021年11月，学校共有4个ESI全球前1%学科：临床医学、药理学与毒理学、化学、神经科学与行为学。其中神经科学与行为学学科首次进入ESI全球前1%，这是本年度我校继药理学与毒理学、化学之后第3个新增ESI全球前1%学科。
教学建设
截至2017年5月，学校拥有国家级特色专业4个，教学成果奖3项，实验教学示范中心2个，人才培养模式创新实验区、专业综合改革试点、教学团队、卓越医生教育培养计划、大学生校外实践教育基地等5个，精品视频公开课、精品资源共享课、精品课程等3门。
学校共获批省级教学成果奖35项，特色专业8个，专业综合改革试点7个，服务产业特色专业4个，创新创业教育改革试点专业3个，应用型人才培养专业群3个，人才培养模式创新实验区8个，实验教学示范中心13个，虚拟仿真实验教学中心1个，教学团队9个，大学生校外实践教育基地8个，精品资源共享课6门，精品在线开放课程3门，精品课程37门。
学校拥有福建省研究生教育创新基地11个，福建省专业学位研究生联合培养示范基地3个。学校设有直属附属医院5所，非直属附属医院14所（含临床医学院2所），临床教学医院24所，专业实践教学基地58个。
国家级特色专业（4个）：药学、临床医学、基础医学、护理学。
福建省特色专业（8个）：应用心理学、医学检验、社会工作、临床医学、口腔医学、药学、护理学、预防医学。
国家级专业综合改革试点（1个）：护理学。
福建省专业综合改革试点（7个）：临床医学、药学、预防医学、口腔医学、医学检验、应用心理学。
国家级教学团队（1个）：人文护理学教学团队。
福建省教学团队（9个）：组织与胚胎学教学团队、人体解剖学教学团队、内科学教学团队、眼视光学教学团队、毒理学教学团队、流行病与卫生统计学教学团队、病理学教学团队、人文护理学教学团队、药理学教学团队。
国家级精品课程（1门）：护理管理学。
福建省精品课程（37门）：护理学基础、卫生统计学、药物化学、口腔颌面外科学、劳动卫生与职业病学、卫生化学、机能学、急救护理学、临床免疫学和免疫学检验、实验诊断学、牙周病学、营养与食品卫生学、预防口腔医学、预防医学基础实验、分析化学、口腔修复学、临床血液学及血液检验、流行病学、内科护理学、外科护理学、外科学、医学微生物学、组织学与胚胎学、儿科学、护理管理学、生理学、卫生毒理学、行政管理学、生物化学、眼科学、药物分析、耳鼻咽喉科学、神经病学、药理学、内科学、人体解剖学、病理学。
国家级实验教学示范中心（2个）：公共卫生与预防医学实验教学中心、护理学实验教学中心。
福建省实验教学示范中心（13个）：计算机基础与医学应用实验教学示范中心、生物信息学专业实验教学中心、公共卫生与预防医学实验教学中心、基础医学专业实验教学中心、心理与行为实验教学中心、药学专业技能实验教学中心、口腔医学实验教学中心、医学技术实验教学中心、护理学实验教学中心、临床技能教学中心、药学实验教学中心、基础医学实验教学示范中心、预防医学实验教学示范中心。
福建省虚拟仿真实验教学中心（1个）：口腔医学虚拟仿真实验教学中心。
国家级人才培养模式创新实验区（1个）：护理学人才培养模式创新实验区。
福建省人才培养模式创新实验区（8个）：应用麻醉学人才培养模式创新实验区、应用型社会工作人才培养模式创新实验区、“三段式实践型”口腔医学人才培养模式、应用型临床医学人才培养模式创新实验区、复合型医学检验人才培养模式创新实验区、护理学人才培养模式创新实验区、预防医学人才培养模式创新实验区、“应用型”药学人才培养模式创新实验区 。
学术研究
科研成果
2011年至2017年5月，学校共获科研经费总量达7亿元，获各类科技项目2800多项，发表SCI收录论文3300多篇，获授权国家专利124件，获省科技奖36项，其中科技进步一等奖3项、二等奖14项,获省第十届社会科学优秀成果三等奖1项，获中华医学科技奖二等奖1项、三等奖2项，获福建医学科技奖68项，其中一等奖7项、二等奖21项,获省紫金科技创新奖5项，获省运盛青年科技奖7项。获得霍英东教育基金会高等院校青年教师奖1项。
科研机构
截至2017年5月，学校拥有4个院士工作站。拥有肿瘤免疫药物开发国家地方联合工程研究中心，福建省唯一的新药安全性评价中心。拥有教育部重点实验室1个，省级重点实验室7个，省“2011协同创新中心”2个，省级工程研究中心1个，省级工程技术研究中心2个，闽台科技合作基地1个，省高校重点实验室9个 。
学校还建有福建省创新抗体药物技术重大研发平台、福建省CAR-T细胞免疫治疗技术创新平台、福建省皮肤病性病防治研究所、福建省消化系疾病研究室、福建省血液病研究所、福建省高血压研究所、福建省生殖医学工程中心、福建省分子医学研究中心、福建省眼科研究所、福建省内分泌研究所、福建省腹部外科研究所、福建省神经病学研究所、福建省肝胆外科研究所、福建省耳鼻咽喉研究所、福建省胸心外科研究所、福建省老年医学研究所、福建省临床免疫研究所、福建省烧伤研究所、福建省骨科研究所、福建省超声医学研究所、福建省冠心病研究所、福建省神经外科研究所、福建省肝病科学研究中心、福建省食品安全风险研究中心等省级科研平台。
教育部重点实验室（1个）：省部共建消化道恶性肿瘤教育部重点实验室。
福建省重点实验室（7个）：福建省血液病学重点实验室、福建省天然药物药理学重点实验室、福建省分子神经病学重点实验室、福建省肿瘤个体化主动免疫治疗重点实验室、福建省肿瘤微生物学重点实验室、福建省癌症和神经退行性疾病转化研究重点实验室、福建省环境因素与肿瘤重点实验。
福建省工程研究中心（1个）：福建省生物医药工程研究中心。
福建省工程技术研究中心（2个）：福建省老年眼病与视觉工程技术研究中心、福建省口腔生物材料工程技术研究中心。
福建省“2011协同创新中心”（2个）：福建省干细胞转化医学2011协同创新中心、海西免疫治疗产学研协同创新中心。
福建省高校重点实验室（9个）：感染与肿瘤福建省高校重点实验室、干细胞工程与再生医学福建省高校重点实验室、天然药物药理学福建省高校重点实验室、脑老化与神经变性疾病福建省高校重点实验室、口腔医学福建省高校重点实验室、放射生物福建省高校重点实验室、环境与健康福建省高校重点实验室、医学生物信息学福建省高校重点实验室、纳米医药技术福建省高校重点实验室 。
学术资源
学术刊物
学校编辑出版的学术刊物《福建医科大学学报》、《福建医科大学学报（社科版）》、《中华高血压杂志》和《心血管康复医学杂志》等。
《福建医科大学学报》创刊于1959年，是医药卫生综合类学术期刊，国内外公开发行，被《中国学术期刊（光盘版）》、《中国学术期刊综合评价数据库》、《万方数据-数字化期刊群》、《中国医学文摘》、《中国生物学文摘》等重要数据库和文摘期刊收录 。
《福建医科大学学报（社会科学版）》前身为创办于1983年的《高等医学教育研究》半年刊，内部发行。学报已被《中国期刊网》、《中国期刊全文数据库（CJFD）》、《中国学术期刊（光盘版）》、《中国学术期刊综合评价数据库》、《中文科技期刊数据库》、《万方数据——数字化期刊群》、《中国核心期刊（遴选）数据库》等数据库全文收录 。
《中华高血压杂志》创刊于1993年，由中华预防医学会、福建医科大学主办，福建医科大学附属第一医院承办，为中华预防医学会系列杂志，高血压联盟（中国）学术期刊，是中文核心期刊、中国科技核心期刊、中国科技引文数据库收录期刊、中国科学评价中心核心学术期刊、中国核心期刊（遴选）数据库收录期刊、中国医学核心期刊、美国《化学文摘》收录期刊、WHO西太平洋地区医学索引数据库收录期刊 。
馆藏资源
截至2021年8月，福建医科大学图书馆藏有纸质图书总量171.93万册，电子图书440.27万册，电子期刊81万册，学位论文967.06万册，音视频44645小时，数据库79个（包含子库），其中包含CNKI、万方、维普等中文数据库39个，OVID外文医学检索平台、LWW医学全文期刊、EBMR、BP、FMRS、牛津、海量外文图书等外文数据库34个，自建库4个，附属医院数据库2个。数据存储容量总计近60T。
学校领导
现任领导
历任校长
文化传统
校标
校标图案主体由字母“M”、蛇杖和阿拉伯数字“1937”等基本元素组合构成。图案呈圆形，图案内圆上弧为书法家舒同先生手写的中文校名，下弧是福建医科大学英文全称。
校标设计元素涵义
1、元素1为变化后的蛇杖造型，又形似DNA双螺旋结构，体现现代医学属性。
2、元素2取自汉语拼音“Mǐn（闽）”和英文“Medical（医学）”首个字母“M”，又似打开的书籍，体现高等教育属性。
3、元素3形似汉字“闽”（福建），体现学校地域属性。
4、1937为建校时间，体现历史年代属性 。
校训
勤奋、严谨、求实、创新
校歌
青春医大、和谐医大
作词：黄锦萍作曲：卢荣昱
歌词：
告诉你一个我们、我们的向往；
选择了医学就选择了健康向上；
恪守医德、不负生命相托；
福建医科大学上街校区鸟瞰图
救死扶伤责任重于、重于泰山；
啊！青春医大、和谐医大；
医学高峰从这里开始登攀；
勤奋、严谨、求实、创新；
铿锵誓言在校园里、校园里回响；
告诉你一个我们、我们的信念；
选择了医学就表白了奉献的志愿；
跨越式发展取得累累硕果；
人才基地培养祖国栋梁；
啊！青春医大、和谐医大；
万千学子在这里奋力扬帆；
勤奋、严谨、求实、创新；
灿烂未来向我们向我们召唤！
所获荣誉
2020年11月，被评为第二届全国文明校园。
2022年2月，选入第一批“三全育人”综合改革试点单位名单。
知名校友
侯宗濂（1900-1992）——福建医科大学首任校长，是中国近现代著名的生理学家和医学教育家。
吴孟超（1922~）——福建医科大学名誉校长，师从中国著名外科学家裘法祖，为闽籍中科院院士、著名肝胆外科专家、2005年度国家最高科学技术奖获得者，被誉为“中国肝胆外科之父”。2011年6月，受聘为福建医科大学名誉校长。
姜小鹰——福建医科大学教授，2011年荣获第43届国际南丁格尔奖章，是我国唯一获得此项荣誉的护理教育工作者。
陈列平——福建医科大学教授，福建医科大学免疫治疗研究所所长。2014年获得肿瘤免疫学界顶级大奖——威廉·科利奖。
