熊杰:中国科学院水生生物研究所副研究员-中文百科频道

人物经历

教育背景

2003年9月-2007年6月，南京农业大学，水产养殖学，农学学士;

2007年9月-2011年11月,中国科学院水生生物研究所，水生生物学，理学博士;

工作经历

2012年1月-2015年12月，中国科学院水生生物研究所，助理研究员;

2014年8月-2015年8月，美国密歇根大学，博士后；

2015年12月至今，中国科学院水生生物研究所，副研究员；

主要成就

科研成就

科研项目

（1）三种四膜虫全基因组N6-甲基腺嘌呤的鉴定及其功能进化,主持,国家级,2017-01--2020-12

（2）中国科学院青年创新促进会会员人才专项,主持,部委级,2016-01--2019-12

（3）中国科学院知识创新工程青年人才领域前沿项目,主持,市地级,2014-01--2015-12

（4）模式生物嗜热四膜虫转录组数据库建设,主持,院级,2014-01--2015-12

（5）模式原生动物嗜热四膜虫DNA复制起点的鉴定及其特征分析,主持,国家级,2014-01--2016-12

（6）原生动物四膜虫生殖小核(germlinenucleus)体功能(somaticfunction)的分子基础研究,主持,国家级,2019-01--2021-12

论文著作

（1） Single-cell transcriptome sequencing of rumen ciliates provides insight into their molecular adaptations to the anaerobic and carbohydrate-rich rumen microenvironment, Molecular phylogenetics and evolution, 2020, 第 7 作者

（2） Sexual cell cycle initiation is regulated by CDK19 and CYC9 in Tetrahymena thermophila, Journal of Cell Science, 2020, 第 5 作者

（3） Proteomic identification and expression of oral apparatus constituents in cell regeneration of giant ciliate Stentor coeruleus (strain WHEL), Gene, 2020, 第 5 作者

（4） Tetrahymena Comparative Genomics Database (TCGD): a community resource for Tetrahymena, Database, 2019, 第 8 作者

（5） Insights into the origin and evolution of Peritrichia (Oligohymenophorea, Ciliophora) based on analyses of morphology and phylogenomics, Molecular phylogenetics and evolution, 2019, 第 3 作者

（6） RNAi-dependent Polycomb repression controls transposable elements in Tetrahymena, Genes & development, 2019, 第 2 作者

（7） Hidden genomic evolution in a morphospecies—The landscape of rapidly evolving genes in Tetrahymena, PLoS biology, 2019, 第 1 作者

（8） Exploration of Genetic Variations through Single‐cell Whole‐genome Sequencing in the Model Ciliate Tetrahymena thermophila, Journal of Eukaryotic Microbiology, 2019, 第 3 作者

（9）进展中的原生动物学研究:热点领域与新格局, Progress of protozoological studies in China: Hot spots and new patterns, 中国科学:生命科学, 2019, 第 1 作者

（10） xploration of Genetic Variations through Single‐cell Whole‐genome Sequencing in the Model Ciliate Tetrahymena thermophila, Journal of Eukaryotic Microbiology, 2019, 第 3 作者

（11） EOGD: the Euplotes octocarinatus genome database, BMC Genomics, 2018, 第 4 作者

（12） A DP-like transcription factor protein interacts with E2fl1 to regulate meiosis in Tetrahymena thermophila, Cell cycle, 2018, 第 5 作者

（13） Pseudocohnilembus persalinus genome database-the first genome database of facultative scuticociliatosis pathogens, BMC genomics, 2018, 第 5 作者

（14） A germline-limited piggyBac transposase gene is required for precise excision in Tetrahymena genome rearrangement, Nucleic Acids Research, 2017, 第 4 作者

（15） Dissecting relative contributions of cis-and trans-determinants to nucleosome distribution by comparing Tetrahymena macronuclear and micronuclear chromatin, Nucleic Acids Research, 2016, 第 1 作者

（16） Epidermal growth factor-induced stimulation of proliferation and gene expression changes in the hypotrichous ciliate, Stylonychia lemnae, Gene, 2016, 通讯作者

（17）四膜虫功能基因组数据库增量更新 2016-生活史和减数分裂转录组及磷酸化蛋白组资源建设, 基因组学与应用生物学, 2016, 通讯作者

（18） Tracing the structural evolution of eukaryotic ATP binding cassette transporter superfamily, Scientific reports, 2015, 第 1 作者

（19） Genome of the facultative scuticociliatosis pathogen Pseudocohnilembus persalinus provides insight into its virulence through horizontal gene transfer, Scientific reports, 2015, 第 1 作者

（20） The genome of the myxosporean Thelohanellus kitauei shows adaptations to nutrient acquisition within its fish host, Genome biology and evolution, 2014, 第 2 作者

（21） Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation, Genes & development, 2013, 第 2 作者

（22） Tetrahymena functional genomics database (TetraFGD): an integrated resource for Tetrahymena functional genomics, Database, 2013, 第 1 作者

（23） Transcriptome analysis of the model protozoan, Tetrahymena thermophila, using deep RNA sequencing, PLoS One, 2012, 第 1 作者

（24） Tetrahymena Gene Expression Database (TGED): a resource of microarray data and co-expression analyses for Tetrahymena, Science China Life sciences, 2011, 第 1 作者

（25） Gene network landscape of the ciliate Tetrahymena thermophila, PloS one, 2011, 第 1 作者

（26） Genome-wide identification and evolution of ATP-binding cassette transporters in the ciliate Tetrahymena thermophila: A case of functional divergence in a multigene family, BMC evolutionary biology, 2010, 第 1 作者