人物经历
2019-至今:中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所,研究员
2016-2018年:美国斯坦福大学,研究员
2012-2016年:美国斯坦福大学,博士后
2010-2011年:美国凯斯西储大学,博士后
2005-2010年:美国凯斯西储大学,计算机科学博士
2001-2005年:清华大学,计算机科学学士
主要成就
科研成就
代表性论文(*通讯作者)
Xin Li#, Yungil Kim#, Emily K. Tsang#, Joe R. Davis#, Farhan N. Damani, Colby Chiang, Zachary Zappala, Benjamin J. Strober, Alexandra J. Scott, Andrea Ganna, Jason Merker, Daniel MacArthur, GTEx Consortium, Ira M. Hall, Alexis Battle*, Stephen B. Montgomery*. The impact of rare variation on gene expression across tissues. Nature 550(7675):239-243, 2017
Xin Li*, Alexis Battle, Konrad J. Karczewski, Zach Zappala, David A. Knowles, Kevin S. Smith, Kim R. Kukurba, Eric Wu, Noah Simon, Stephen B. Montgomery*. Transcriptome sequencing of a large human family identifies the impact of rare non-coding variants. Am J Hum Genet 95(3):245-256, 2014
Xin Li, Jing Li*. Haplotype reconstruction in large pedigrees with untyped individuals through IBD Inference. J Comput Biol 18(11):1411-1421, 2011
Xin Li, Xiaolin Yin, Jing Li*. Efficient identification of identical-by-descent status in pedigrees with many untyped individuals. Bioinformatics 26(12):i191-i198, 2010
人才培养
本课题组聚焦于人类基因组研究下一步的关键目标即人类遗传变异功能图谱的解析。
(1)人类个体罕见遗传变异的负荷及对个体健康的影响。
(2)人类基因组非编码区的功能解析。
(3)转录组测序在治疗诊断疑难疾病中的应用。
(4)现代人工智能和机器学习方法对于人类基因组功能解析和精准医疗的应用。
荣誉表彰
C. W. Cotterman Award, American Society of Human Genetics, 2015.