早年经历
2004年9月，到湖南大学表演系报道。同年荣获新丝路模特大赛专业组长沙赛区第一名，湖南省十佳、最佳上镜奖。
2005年，获《三湘都市报》魅力女孩冠军以及王老吉清热暗疮片代言人选拔大赛冠军、最佳人气奖。
工作
2005年，参演电视剧《一家老小向前冲》，饰演“晓薇”。
2006年孙耀琦正式加盟湖南卫视“快乐购”，20岁的她被快乐购推选为“感恩天使”。
2007年孙耀琦开始与湖南卫视的一线主持何炅搭档节目《快乐购》。
2008年出演电视剧《好汉一箩筐》，剧中孙耀琦扮演“川贝格格”。
2009年参演《丑女无敌第二季》，饰演“女老师”。
2011年出演《新还珠格格》扮演“金琐”并走红。
2012年出演由长城影视股份有限公司出品的古装传奇情感战争剧《隋唐英雄》，该剧中孙耀琦扮演如意公主。同年3月由浙江长城影视传媒和湖南卫视联合打造的古代宫廷传奇电视剧《太平公主秘史》上映，孙耀琦饰演青年时期的上官婉儿，同时受邀做客《我是大美人》节目。
2013年受邀参加湖南卫视《一生一世合家欢》节目录制，节目现场孙耀琦与演员迟帅携手共同演绎了一段搞笑浪漫的“情侣秀”，两人因各自的精彩表现成为观众心中的优质“偶像组合”。5月受邀参加国内首档明星模仿秀《百变大咖秀》节目录制，孙耀琦现场反串“林志颖”。。
2014年出演由长城影视股份有限公司出品发行的大陆古装剧《隋唐英雄4》，剧中孙耀琦扮演“樊梨花”，并凭借亦刚亦柔、文武双全的霸王花形象受到观众的好评。
2015年出演由华夏视听、于正工作室联合出品的古装武侠剧《神雕侠侣》，剧中她饰演“陆无双”，因一张身处冰山的剧照，照片中孙耀琦身着素雅长裙，面向阳光，被网友称赞为“冰山美人”。在超级网剧《盗墓笔记》中被钦点饰演陈丞澄这个原创角色。11月出演电视剧《警察荣誉》。
2016年1月，在年代剧《青谷子》中饰演知青教师方格；2月19日，与杜海涛、吴昕、隋凯合作主演爱情喜剧电影《恭喜发财之谈钱说爱》；4月7日，受邀加盟山东卫视历史文化类喜剧季播节目《你好历史君》的录制，在第二期”翻阅三国乱世“中饰演貂蝉；5月23日，参演的古装玄幻剧《仙剑云之凡》开播，孙耀琦饰演呆萌花痴的活泼少女蘅绾绾；6月20日，在古装武侠剧《六扇门》中饰演聪明伶俐、知书达理的名门闺秀曹懿恩；7月，拍摄都市玄幻偶像剧《我的美女老师第二季》；10月，加盟原创校园纪实节目《一年级·毕业季》，担任本季的大学辅导员。
社会活动
2012年8月15日，与班杰明、王今铎亮相某公益挑战节目，致敬辛勤的劳动者，切身体验高难度的悬崖清洁工作，呼吁大家注重环保。
2013年，孙耀琦受邀参加湖南卫视“一生一世合家欢”爱心颁奖典礼，并为爱心企业颁奖。
2016年6月28日，孙耀琦受邀参加WABC&人物慈善夜，为艺术品助拍，为公益站台。
2017年7月31日，孙耀琦现身一直播，号召粉丝们给流浪龙武更多关爱，一起关注由北京领养日和一直播共同发起的“带我回家”——以领养代替购买流浪动物的公益活动。直播中，孙耀琦不仅与粉丝分享了自己养宠物的故事，还为可爱的流浪动物作画。
