人物经历
1962年7月17日，出生于辽宁省新金县（今普兰店市）。
1980年9月，进入东北师范大学物理系学习。
1984年7月，从东北师范大学毕业，获得理学学士学位；9月，成为东北师范大学物理系研究生，师从吴兆颜教授，从事量子力学和数学物理的研究。
1987年7月，硕士毕业，获得理学硕士学位并留校任教。
1988年7月，晋升为东北师范大学物理系讲师。
1989年，被东北师范大学推荐到南开大学在职攻读博士学位，后成为葛墨林教授和杨振宁先生联合培养的博士研究生。
1990年7月，破格晋升为东北师范大学副教授。
1992年7月，从南开大学数学研究所毕业，获理学博士学位。12月，破格晋升为东北师范大学教授。
1992年——1994年，在美国纽约州立大学石溪分校从事访问研究。
1994年，兼任吉林大学博士生导师。
1996年，调任中国科学院理论物理所研究员。
2007年，任中国科学院理论物理所二级研究员。
2009年11月，当选为中国科学院院士。
2011年11月，被选为发展中国家科学院院士。
2012年7月，任中国工程物理研究院北京计算科学研究中心教授。
2015年5月，任中国工程物理研究院研究生院院长。
主要成就
科研成就
科研综述
孙昌璞主要从事量子物理、数学物理和量子信息理论的研究。提出了q变形玻色子概念，由此构造杨-Baxter方程新型解，给出其微观解释，并应用到量子信息存储。建立了退相干的因子化模型，发现了量子临界环境的动力学敏感性及其对诱导退相干的增强效应。研究了纳米机械冷却和基于超导量子电路的量子信息处理，提出了固体系统实现量子态传输的理论方案。建立了量子绝热过程的非绝热修正理论，指出了诱导规范场可观测效应和它分离手征分子的方案。
量子研究
孙昌璞的关于q-变形玻色子的工作，单篇引用达300余次，获美国ISI“经典引文奖”。该论文入选美国斯坦福大学图书馆 《Papers most cited in mathematical physics articles》。美国《科学》1995年专刊介绍中国科学发展，提及了孙昌璞的这个工作。十几年后，孙昌璞建立了这种变形玻色子和多粒子集体激发的联系，并进一步应用到量子信息存储。
孙昌璞在80年代末发展了量子绝热近似方法的非绝热修正理论。在这方面，孙昌璞还指出了诱导规范场存在可观测效应。由于近来磁约束冷原子实验的发展，十几年后，人们开始关注这个理论观念，孙昌璞等人进而提出了类似斯特恩-盖拉赫实验可能分离手征分子的理论方案，受到专门评论，认为对实验提出了新任务。
孙昌璞发现，作为量子开系统，环境出现量子相变时，与它耦合的系统的退相干会被显著增强。这种环境诱导的量子退相干效应和量子相变环境的动力学敏感性，在2008年和2009年已被德国、加拿大实验组分别证实。他们观测到了临界点上量子态不重叠的现象。
孙昌璞在2005年有关热振子与电荷量子比特耦合的致冷机制的理论探讨，与德国冷却LC介观电路的实验原理一致。他还与日本理化所小组合作发现，反演对称性破坏的约瑟夫森结系统，会发生自然原子电偶极选择定则所禁戒的跃迁，从而形成循环结构的三能级人工原子。它在绝热操作下，对总体相位敏感。2008年日本和德国联合实验证实了这种人工原子的存在。
科研项目
孙昌璞作为课题负责人，先后承担了中国科学院“国家知识创新工程”、《国家重点基础研究发展计划（973计划）》以及国家自然科学基金理论物理重大前沿交叉领域等重要项目。
学术论著
截至2018年5月，孙昌璞发表学术论文300余篇，被引用10000余次，h因子53。
科研成果奖励
截至2019年5月，孙昌璞获得多个国家级科技成果奖。
人才培养
孙昌璞注重青年人才的培养。截至2010年7月，他指导的研究生有6人获“中科院优秀博士论文”，2人获全国“百篇优秀博士论文”，1人获2006年中科院院长特别奖和美国Los Alamos国家实验室的Director Fellowship。
教学授课
2018年，孙昌璞为北京师范大学物理学科开设研究生专业课《高等量子力学》。
荣誉表彰
截至2018年5月，孙昌璞获得过美国ISI“经典引文奖”，宝钢教育基金会优秀教师特等奖以及吉林省特等劳动模范等荣誉称号，10次被评为中国科学院“优秀研究生指导教师”和“优秀导师”。
1995年，孙昌璞被评为全国先进工作者。
2019年，孙昌璞被授予南开大学“杰出校友”荣誉称号。
社会任职
截至2010年7月，孙昌璞担任过中国物理学会理事、《中国科学》、《量子光学学报》、北京大学出版社《现代物理丛书》和《COMUNICATIONS IN THEORETICAL PHYSICS》《Light: Science & Applications》的编委，英国《Journal of Physics A 》、美国《Advances in Mathematical Physics 》和几个国家部委重点实验室的学术委员，兼任清华大学和吉林大学等学校的兼职教授、南开大学的特聘讲座教授以及日本理化学研究所杰出访问教授。
人物评价
孙昌璞思想活跃，基础理论扎实，勇于创新，具有严谨踏实的学风，善于团结同志共同提高，在同行享有广泛的声誉。（南开大学物理科学学院评）
孙昌璞积极探索国家需求牵引的基础研究模式创新，并在中物院研新型究生院创建中进行实践。（北京计算科学研究中心评）
孙昌璞有不少工作得到国际认可，如q-变形玻色子工作是国际上本领域开创性工作之一。（量子信息与量子科技前沿协同创新中心评）
