校舍
两年内完成第一栋教学大楼（宠惠堂）及学生活动中心。1961年全校由台北市汉口街迁到外双溪现址。至此东吴师生终于有了一个属于自己的美丽校园。在台复校的过程艰辛坎坷，卫理公会及美国基督教高等教育联合会未予支持，物质条件极其窘困。但在董事会苦心奔走，海内外校友及教会热诚捐助下，东吴依然坚守严谨校风踏实办学，为东吴学子树立了良好的典范。
迁入外双溪校区后的二十年，是东吴大学在台复校后的关键成长期。历经石超庸（任期1957~1968）、桂崇基（任期1968~1969）及端木恺（任期1969~1983）三任校长。石校长任内全心致力教学水准的提升，学生成绩采严格的淘汰率，为学校奠立稳定的根基。1969年教育部终于核准东吴大学恢复大学建制。
院系组成
端木校长接任后则积极开创发展，任内增设十二个学系、七个研究所、三个博士班，图书馆、哲生楼、音乐馆及教师研究大楼等校舍相继建成，又在台北市贵阳街设城区部，并兴建两栋教学大楼。教学设施日趋完善，校区规模已然成型。爱校的热情凝聚了董事会、全体师生及校友，东吴人凭借着坚强的毅力走过惨淡岁月，培育英才无数，缔造了办学佳绩，也赢得社会的认同与支持
发展
台湾东吴大学经过过去二十年的耕耘，已成为一结构完整的综合性大学。此时期的台湾东吴大学发展为两个校区。外双溪校区位于文化风景区，安置文、外语及理三学院；城中校区位于政经文化中心，安置法、商两学院及推广部。两校区均属台北市的精华区域。东吴大学已演变成一有特色、有内涵、有制度的精致大学。历任校长致力于提升学术研究能力、拓展与国际及大陆的学术交流、推行校务运作制度化，并与社区建立良好互动关系。东吴与附近中小学形成一校群彼此支持。国内各地校友会、系友会及校友总会亦相继成立。
公元二千年东吴庆祝建校一百年，展望未来台湾东吴大学仍将秉持「养天地正气 法古今完人」的校训精神，以「教育而得天下之英才」的办学理念，培育「朴实热诚坚毅 专业通识宏观」的青年学子。不仅要维护学校作为人才培育的胜境，更在新世纪致力发展成为学术研究的清源。
