历史沿革
新疆（乌鲁木齐）军区原为大军区，所属南疆军区、北疆军区、东疆军区为正军级，与省军区同级，下设军分区。1949年12月，以中国人民解放军第一兵团为基础组建新疆军区，为二级军区，隶属第一野战军暨西北军区建制。
1950年2月，新疆军区成立喀什、迪化、伊犁军区，分别由第二军、第六军、第五军兼，为三级军区。1955年5月，新疆军区从西北军区划出，升格为大军区，直属中央军委领导。1979年新疆军区改称乌鲁木齐军区。1985年6月，乌鲁木齐军区与兰州军区合并，同时成立新疆军区，为兵团级，隶属兰州军区领导。
北疆军区原为伊犁军区。1952年10月，伊犁军区撤销，组建伊犁军分区，仍由第五军兼。1955年1月，第五军军部整编为伊犁哈萨克自治州军区，同时撤销第五军番号和伊犁军分区。同年11月，伊犁哈萨克自治州军区改称伊犁军区。1970年4月，伊犁军区改称北疆军区。
1985年6月，全军开始“百万大裁军”。根据中央军委命令，北疆军区被撤销，所属各军分区和野战部队转隶属新疆军区直辖。
驻地
1950年组建时驻地伊宁，因该军区领率机关所在地伊宁距离中苏边境仅70公里，过于靠前，为便于作战指挥，1970年4月东迁至沙湾县城，10月又迁至石河子市；1971年10月，北疆军区由石河子再迁至乌苏。
历任领导
一、伊犁军区初期（1950-1966）的领导有：司令员：法铁依伊凡诺维奇列斯肯（俄罗斯族）、伊斯哈克夫马尔果夫（塔塔尔族）1962年外逃、廖明；政治委员：顿星云、李铨(--56.08)张世功(一)、廖明(二)
二、1966年5月份文革没开始时伊犁军区的领导有：
司令员：廖明
政治委员：张世功
副司令员：江子炎、任书田、肖飞
副政委：李国清、李绍明
参谋长：许欣之
政治部主任：李绍明（兼）
三、改成北疆军区后到撤销（1969.12-1985）的领导有：
司令员：龚兴业
政治委员：阳焕生
后期为：
司令员：幸元林、新疆军区副司令员兼
政委：钟良树、王树瑞
副司令员：任书田、赵衍庆、赵増林、阿不都克里木'马合木托夫1975.9、李凤友1975.9
副政委：李国清、李昭明、刘文锦、兼政治部主任、张晓钟1975.9；
参谋长：齐金炳
