内容简介
杰乃拉尔是改造军团的最高司令官，尽管曾一再被西格玛挑拨离间与人类和异常体猎人之间的关系，但杰乃拉尔一直 坚持自己的理念而没有对人类或者异常体猎人有任何的嫌隙。然而，在蔚蓝海岸坠落事件之後，因为无法忍受异常体猎人强行要求改造军团缴械配合调查，最後发动了政变而希望成立不受人类干涉的独立国家，全员被异常体猎人宣告为异常体。他在发动政变之後移动到了宇宙中的大型雷射兵器终极武器来指挥改造军团。当改造军团最终居於劣势的时候，他将所有残馀部队经由宇宙港口集结到终极武器，而异常体猎人则继续追击而潜入了终极武器之中。在他与杰洛和艾克斯的战斗之中，西格玛启动了终极武器准备向地球开炮。理解到自己的行为已经造成了难以弥补的伤害，杰乃拉尔在最後选择以自爆的方式将终极武器破坏掉。
特效武器：双重切削、空圆舞（但在ZERO站在他的拳头上直接砍伤害要更高得多，1刀4分之1HP）
攻击方式：（只有攻击头部攻击才奏效，不会不断朝主角所在位置飞行，若爬墙过久就会使用环形激光器）
①巨型践踏 若主角当来到其下方他会停下，并且猛的往下压，使地板破碎来伤害主角
②环形激光器 放出拳头一上一下来回飞行，然後手腕不断瞄准分别放出巨大雷射球（拳头能垫脚，拳头会随主角高度改变高度，碰到拳头喷射部分会受伤）
③将军激光 於腹部放出6个飞镖状的巨型雷射束（半血后才用，发射位置固定）
改造军团
改造军团的标志
是在多普勒博士叛乱事件之後，由於理解到异常体猎人的组织架构没有办法应变大规模的异常体事件或者其他大型灾害，在凯因博士的推动之下成立的军队组织。为了要增进部队的效率，改造军团在创立的初期吸收了许多异常体猎人的资深成员，同时也参考了异常体猎人各部队的状况来设立部队的规定。在处理异常体的方针上，改造军团与异常体猎人采取的是积极合作的态度，一般的治安事件仍然由异常体猎人做为第一线，当事件规模扩大时改造军团就会介入处理。除了处理大规模的灾害之外，改造军团也著力於让思考型机器人能够更有效地为人类工作，因此除了战斗部队以外也设置了许多研究小组，但是西格玛说服了炎龙骑兵策动了袭击改造军团本部以及空中都市蔚蓝海岸的行动。伪装成改造军团士兵的异常体出现于蔚蓝海岸的袭击现场，使得原本就已不太信任改造军团的异常体猎人总监凯因博士高度怀疑改造军团就是这起事件的主谋。随後赶到现场的卡尼尔不愿意配合异常体猎人放下武器配合调查的要求，更加深了异常体猎人对改造军团的怀疑。对於异常体猎人单方面配合调查的要求碰触到了杰乃拉尔的底线，使杰乃拉尔宣布改造军团自人类社会独立，建立只有思考型机器人的理想国，而异常体猎人则依此判断改造军团异常体化，两个组织开始了之後称为改造军团大战的全面冲突，在此期间西格玛也派遣部下的电子孔雀收集分析异常体猎人及改造军团成员的战力资料，并复活分身蘑菇将生物研究所改造成了要塞，在X5败战后的改造军团已经一蹶不振，只剩下零星的部队继续勉强维持机能，在殖民地坠落事件之後改造军团已几乎不再有任何的地位存在（X4中大战里保留最完整的改造军团空军也在这次事件中全员都感染西格玛病毒，最后整个队伍都崩溃啦）卡尼尔介绍
中文名：卡尼尔
英文名：Colonel
CV：山野井仁
卡尼尔
改造军团的陆军军官，同时兼任改造军团陆军的指挥官和改造军团的副指挥官两个职位，是改造军团实质上的第 二号人物。卡尼尔是曾经立下多数战功的优秀军人，在战场上总是保有一贯的冷静态度，但同时有著非常关心自己的部下以及妹妹爱莉丝的另外一面。卡尼尔的战斗专长是剑术，与杰洛一直以来都是竞争对手的关系。卡尼尔本身是改造军团特别研究部在一个极机密研究计划中制作出来的思考型机器人。研究计划本身的目的是希望能够制作出兼具有强大的战斗能力和斗争心，但又爱好和平而不轻言动武的究极思考型机器人。这个计划最後并没有成功，最後制作出来的成品是两个拥有相似程式的思考型机器人，其中卡尼尔继承了战斗能力与斗争心的部份，而爱莉丝则继承了爱好和平的部份。由於两个人的程式有超过50%以上是相同的，因此很自然就成为了兄妹一般的存在。蔚蓝海岸被袭击的时候，卡尼尔率领部下前往现场，被异常体猎人怀疑是袭击蔚蓝海岸的主谋。由於卡尼尔拒绝放下武器配合调查，使得异常体猎人更加怀疑改造，最後导致了改造军团发动政变，而异常体猎人则接著宣告改造军团全员异常体化，X线中打败改造军团4个首领机器人后卡尼尔会发出战书和X（艾克斯）决斗，战败后撤离，杰洛线战斗则被爱莉丝暂时阻止，8人全灭后，改造军团会往宇宙港口集结，撤退到太空中的据点，卡尼尔则在前往最终武器的改造军团太空港断後，为改造军团的撤退争取时间，X线被X直接打倒，杰洛线则是被其体内威利博士设置的「机器人破坏程序」所误杀特效武器：冰霜晶塔、冰烈斩
攻击方式：（初战时没有墙壁，二回战时有，杰洛则8王全灭后才需要对战卡尼尔）
①瞬间移动 消失，然后突然现身於主角旁边并且进行挥击，然后急退（急退时没有接触判定，半血后不一定急退，而是再度消失）
②冲击斩 急退后先用剑防御攻击然后连续砍出3次剑气，模式固定为上、下、上（上面的可以冲刺躲避，X可以用腿铠滞空直接全部避开）
③电气攻击 举起剑放出8个电弹往两边，然后一起向上攻击（第二次战斗才用）
④巨型冲击斩 跳起然后砍出随行进会越来越大的地面剑气（第二次战斗才用）
电网蜘蛛
中文名：电网蜘蛛
英文名：Web Spidus
其他名称：密林的指挥官
CV：二又一成
电网蜘蛛
是改造军团陆军的成员，曾是杰洛的部下，前异常体猎人第零特殊部队队员，後转职进入改造军团，担任游击部队的队长，立下了许多的战功。专长於使用绳索状的电磁束，除了能够用来一边攻击敌人一边封锁敌人的行动以外也可以做为支撑自己在空中移动的媒介，在改造军团发动政变之後被指派到丛林基地，负责保卫藏在基地最深部的巨型镭射炮艾尼格玛X武器：雷电网（在面前张开一面带有电流的网，在发射途中能够对敌人造成电击伤害，但一旦网面打开就会失去电击的效果而变成单纯的障壁，可以做为墙面来攀爬，集气时会变成一面巨大的电网，能够进行广范围的电击攻击）
Zero武器：雷神击（按特殊攻击键发动，将Z光剑转换成电击向前方突刺，破坏力极高）
洛克人X4克制：分身蘑菇，死神西格玛（雷电网），炎龙骑兵（雷神击），削切猛狮（雷神击）
洛克人X4登场对其有效武器：双重切削，疾风牙（然而基本打不到Boss）
攻击方式：（第一状态用特武只攻击Boss连接的电流线能让Boss受重伤）
①闪电网 放出半跟踪的电网，被抓到会不能行动，且连续损血
②巨大闪电网/小蜘蛛 半血后召唤巨大电网，Boss会于电网范围内自由移动，并隔一段时间放出4只小蜘蛛朝主角移动（虽然因为画面问题只会有3只追击，可破坏）
③深幽密林 收紧电线离开画面之后在落叶处现身（半血后不再用）
削切猛狮
中文名：削切猛狮
英文名：Slash Beastleo
其他名称：钢之破坏王
削切猛狮
CV：长嶝高士是改造军团陆军的成员。他是在改造军团中数一数二的搞乱份子，当初单纯就是为了要满足自己打斗的欲望以及展现自己的力量而加入。总是想大闹一番的个性让他在战场上成为无所畏惧的英勇战士。在改造军团政变之後被分派到护送军用列车以将补给物资送到各地的任务。他快速的脚程能够从旁赶上运行中的列车而轻易地捕捉到潜伏在列车上的敌人。
X武器：双重切削（往斜前方发射的两枚音波刀，集气后直接发射8发，可破坏特殊岩层）
ZERO武器：疾风牙（冲刺中按下特殊攻击，可在冲刺时削砍）
洛克人X4克制：电网蜘蛛，杰乃拉尔（双重切削）
洛克人X4登场对其有效武器：地面猎人，雷神击
攻击方式：
①跳跃攻击 朝主角上方跳起，然后有可能猛地着地踩压
②双重切削 背朝主角，有后仰动作后固定角度砍出两个音波刀
③疾风牙 地面来回冲刺攻击
④戒备 做防御动作，然后若被攻击会立刻使用双重砍削反击
⑤破坏突击 朝墙上飞跃冲刺，被抓到后被抛向墙壁（伤害很高）
冰霜海象
中文名：冰霜海象
英文名：Frost Kibatodos
其他名称：极北的暴徒
冰霜海象
CV：冈和男是改造军团陆军的成员。曾经一度因为暴力行为被判定为异常体，在处刑之前被看上了其能力的杰乃拉尔所救而加入改造军团成为军人。尽管成为了军人，但在改造军团里是一个时常惹是生非的问题份子。一向认为军事任务就是痛痛快快地大肆破坏，对於改造军团政变打从心里欢迎。是改造军团雪地基地的指挥官，在改造军团政变之後接下了在雪地基地秘密开发新型兵器的任务
X武器：冰霜晶塔（产生巨大的冰块，能用以防护，也能给予敌方持续攻击，但是光线系无法防御，另外可冻结火系物件，集气版是巨大冰锥成列地落下）
ZERO武器：冰烈斩（空中特殊攻击+下，进行冰属性下斩，在往下的同时身体也会落下，可以微调左右位置，可冻结火系物件）
洛克人X4克制：喷射魟鱼，卡尼尔，西格玛第三形态（地面主体，冰烈斩）
洛克人X4登场对其有效武器：上升火焰、龙炎刃
攻击方式：
①身体撞击 双手互搥後於地面滑行（搥一次是直接滑，搥二次是大跳再滑，被特武攻击后也会直接滑行）
②氷剑 双肩的冰刺往上发射，接著掉下多个冰剑（着落点不定）
③氷剑V2 口喷寒气做出巨大冰块，接著让冰块碎成冰剑散开
④冰霜晶塔 口喷寒气做出巨大冰块，然后锤碎成多个冰刺散射（会留在着落点，可以打掉）
喷射魟鱼
中文名：喷射魟鱼
英文名：Jet Stingren
其他名称：水域的破坏者
喷射魟鱼
CV：细井治是改造军团海军的指挥官，由最基层的士兵努力奋斗而得到的职位，在改造军团中被视为模范的军官。他本身视自己的军人身分为最大的荣耀，将卡尼尔与杰乃拉尔视为理想的军人尊敬著，同时也非常受到杰乃拉尔的器重。在改造军团政变开始的同时，他率领部队潜入了一个滨海都市，在破坏都市的地下动力部造成大混乱之後逃到了海上的海军基地。
X武器：地面猎人（会沿地前进的鱼型飞弹，集气之後鱼型飞弹会水平飞出，按下或上键会使之炸裂同时进行上下攻击，但也会使本体消失）
ZERO武器：飞燕脚（空中冲刺，非攻击招式）
洛克人X4克制：削切猛狮，西格玛终极形态（地面主体，地面猎人）
洛克人X4登场对其有效武器：冰霜晶塔、冰烈斩
攻击方式：（特武能中断所有行动）
①地面猎人 空中发出4个地面猎人，碰到墙后落入水中，然后于地面来回行进（能打掉）
②地面猎人V2 空中发出5个红色地面猎人，若主角在下方会直接向下攻击（能打掉）
③急速下冲 圆弧状环绕场地急冲
④喷射水流 来到水中进行启动涡轮吸引，接著直线冲撞
⑤冲击 使用地面猎人後往上方冲，接著对著主角冲进地面再冲出来
风暴猫头鹰
中文名：风暴猫头鹰
英文名：Storm Fukuroul
其他名称：大空的参谋长
风暴猫头鹰
CV：冈和男原本是属於改造军团参谋本部的将领，是改造军团中数一数二的智略型将官，特别专长於夜间作战。在西格玛叛乱之前就与暴风雄鹰有私交，对於打倒了暴风雄鹰的艾克斯一直都抱有敌意。但他并不喜欢冰雪企鹅，过去也曾经发生过因为被误看成是冰雪企鹅本人而发怒的事件。对於自己的军人身分非常自傲，也因此对於改造军团被宣告为异常体一事非常愤怒。在改造军团发动政变之後接掌了改造军团空军，率领部队到前线进行引诱异常体猎人的诱饵作战。
X武器：双重旋风（往前後两个方向的斜上方同时发射小型的真空旋风弹，当旋风弹击中敌人时会停留下来持续给予敌人伤害。在集气攻击时会往前後同时发射巨大的横向龙卷风而能够广范围地打击敌人）
ZERO武器：天空霸（Z光剑自动变为紫色，随时可用，能把敌方的能源攻击击破）
洛克人X4克制：炎龙骑兵（双重旋风），达布鲁
洛克人X4登场对其有效武器：瞄准雷射、落凤破
攻击方式：（Boss方中央有一个平台，特武能中断行动）
①急速下降 飞行时，如果主角在正下方，会下冲将主角抓起再抛落（伤害很高）
②3向射击 三向子弹攻击，从上往下或从下往上（半血后不再用，可以打掉）
③飓风袭击 瞄准主角发射风球（能抵挡攻击）
④飓风袭击V2 各自往随机位置发出4个风球，然后发出指令一起朝主角撞击（能抵挡攻击）
⑤飓风袭击V3 飞到正中央，然后X型4向发射多个风球，然后顺或逆时针旋转（能抵挡攻击）
⑥巨型龙卷 以主角为中心，放出三发龙卷风（有征兆，而且会有特殊音效判断是否使用）
盤旋飞马
中文名：盤旋飞马
英文名：Spiral Pegacion
其他名称：空军王子
盤旋飞马
是个性认真而充满了正义感，改造空军的年轻长官。由於年轻热血的关系，仍然时常会犯下许多错误。将已故的卡尼尔视为自己的老师，一直都仍景仰著他，并且似乎也透过卡尼尔而与爱莉丝有面识的样子。对於杀害了卡尼尔与爱莉丝的杰洛始终无法完全原谅。他所管理的改造军团空军拥有为了修复太空梭所需要的轨道翼。然而由於整个空军基地已经完全受到西格玛病毒的感染，盤旋飞马除了希望被X（艾克斯）打败，以证明世界值得托付给他，也希望能在自己真正异常体化之前与杰洛决战以为卡尼尔复仇，他的战斗风格也受过暴风雄鹰的影响。X武器：飞翼螺旋（在跳起的同时向上方发射小型的旋风，如果在移动中使用的话则旋风飞出去的方向也会朝著移动的方向偏移。在使用集气攻击时会变成向前发射、缓缓变大的大型龙卷风）
ZERO武器：疾风（冲刺时按下攻击，出现往前冲的残影）
洛克人X5克制：燃烧暴龙，戴纳摩
洛克人X5登场对其有效武器：黑暗压制
攻击方式：（Boss战点是在一架飞机上，掉下去就会即死）
①冲刺擒抱 冲刺攻击，会将主角撞飞相当一段距离（高概率会连用）
②疾风 冲刺结束後使用，有明显预备动作后放出分身撞击主角
③飞翼螺旋 飞到空中，然後手举高接著与翅膀一起挥下发出旋风，除有攻击力外还会吹飞主角，并且旋风随行进会越来越大（最少也会二连发）
④飞行员擒抱 以特技飞行般的方式，由各种不同的角度朝敌方快速冲撞攻击的技能（有瞄准俯冲，空中或横向高速冲撞，以及从正下方冲上来的升龙拳，都会撞飞主角，此时无敌）
燃烧暴龙
中文名：燃烧暴龙
英文名：Burn Dinorex
其他名称：侏罗纪的炼狱
燃烧暴龙
是改造军团灾害对策小队的成员。他被派遣管理圣豪斯山的熔岩区域，监测火山的活动，但他却瞒著上层在火山里头建造了自己的武器仓库，使用火山的能源非法地制造武器以谋利。燃烧暴龙是一个以蛮勇闻名的战士，能够用与巨大的身形不相称的敏捷活动来压制对手，因此也习惯用暴力来解决事情。在燃烧暴龙的武器收藏中有著为了修复太空梭所需要的加速火箭，但他并不愿意平白地交出加速火箭，并且认为加速火箭只是异常体猎人用来讨伐他的藉口，因此坚决地要求一战。X武器：大地火焰（抛物线发射火球，触物後会持续燃烧，并放出火星，集气版为前後发射火焰风暴，具强贯穿及连射性）
ZERO武器：断地炎（空中特殊攻击+下，进行炎属性下斩，在往下的同时身体也会落下，可以微调左右位置）
洛克人X5克制：刺针蔷薇，混乱壁画W（蓝电子眼）
洛克人X5登场对其有效武器：飞翼螺旋、疾风
攻击方式：
①大地火焰 朝主角所在二连发喷出火球，接著会朝旁边散出小火块
②火焰擒抱 弯曲身体，然后以背部朝向主角的姿势直接冲撞（此时背部无敌，随生命值减少使用方式会稍微改变）
③火焰球 跳到墙上朝主角喷火球（最少3连发）
④火焰摇篮 吐出火焰短时间覆盖整个地面
⑤燃烧擒抱 先跳到墙上，然后用巨大的火球包裹自身使用火焰擒抱，同时在经过的路径上留下火苗，火苗会在冲刺结束之後变成巨大的火柱
涉及人员
他们并非是改造军团的成员，但在改造军团大战时，他们也涉及入战斗之中，其中炎龙骑兵是引发改造军团大战的凶手，而另外两人都是西格玛的部下
分身蘑菇
中文名：分身蘑菇
英文名：Split Mushroom
其他名称：废墟小恶魔
CV：丸田麻里
原本是担任生物研究所管理员的思考型机器人，拥有像调皮的孩子一般的人格设定。在研究所被废弃的时候，他也遭到了废弃处份。他在西格玛的协助之下被复活，并且重新掌控了生物研究所。在改造军团叛乱的时候，他将生物研究所改造成了要塞，以玩乐的心态无差别地攻击侵入研究所的敌人而引起了异常体猎人的注意。
X武器：灵魂躯体（在面前一定距离处产生一个剪影状的分身，这个分身会与艾克斯本身做出一样的动作，使用分身接触敌人时能够让敌人受到连续的伤害。集气攻击会在面前产生一个实体的分身，这个分身不会有装甲也没有办法使用集气射击和操作骑乘装甲。当分身出现的时候，艾克斯的本体会以无敌状态停留在原地，分身则可以自由操作行动）
ZERO武器：空圆舞（习得之后ZERO可以进行二段跳跃，但使用过飞燕脚后不能发动，同时使跳斩变为回旋斩）
洛克人X4克制：电子孔雀（灵魂躯体），杰乃拉尔（空圆舞），西格玛最终形态（空圆舞）
洛克人X4登场对其有效武器：雷电网，雷神击
攻击方式：（用特武打他的话接下来会只放灵魂躯体，但若是已经开始使用其他技能就没办法啦）
①灵魂躯体 爬在墙壁上不断放出分身，全部放出后依次朝主角位置飞行撞击（分身可以用特武消除）
②集气灵魂躯体 跳到中间上方旋转，一段时间後放出一个实体的分身，并且於舞台中进行固定轨道移动以及墙间跳跃（用特武攻击两次本体后这招强制结束）
③集气灵魂躯体V2 大致同技能②，但是本体移速加快，且分身和本体都多出现在墙壁反弹然后撞击地面放出毒气（用特武攻击两次本体后这招强制结束）
电子孔雀
中文名：电子孔雀
英文名：Cyber Kujacker
其他名称：网路卫士
CV：二又一成
原本是为了防御骇客而设计，设置在电脑空间的网路防卫程式。在受到西格玛的改造之後，变成了高傲而残虐的个性。在改造军团政变之後，开始无差别地破坏一切与网路连接的程式，引起了异常体猎人的注意。除了破坏网路以外，他也在西格玛的指示之下收集分析异常体猎人及改造军团成员的战力资料。
X武器：照准镭射（操作在面前的准星锁定敌人，当开始攻击时会自动瞄准被准星锁定住的敌人连续发射雷射，最多可以一次锁定三个敌人。集气攻击时会变成巨大的雷射光束，给予敌人连续的伤害，可以自由调整雷射的发射角度来追踪会移动的敌人，但受到攻击会强制中断）
ZERO武器：落凤破（使用储存起来的能量重击地面，同时往九个不同的方向发射出大型的能源弹，在使用落凤破的期间杰洛也会暂时进入无敌状态，也可以在近距离给予Boss多次的损伤）
洛克人X4克制：风暴猫头鹰，死神西格玛（落凤破）
洛克人X4登场对其有效武器：灵魂躯体，龙炎刃
攻击方式：（特武能直接中断他的行动）
①瞬间移动 突然消失然后随机位置出现，可能和主角位置重叠
②羽根攻击 在主角附近出现，接著蹲下，然後让羽毛往外刺
③上升砍削 在主角位置出现，接著再往上跳
④追尾弹 於舞台边缘上空出现，朝主角打出准星，接著放出追踪弹（一段时间没打到会自爆，一共7次）
炎龙骑兵
中文名：炎龙骑兵
英文名：MAGMA DRAGOON
其他名称：爆炎武术家
CV：长嶝高士
异常体猎人第14特殊部队的队长，是精研各种徒手格斗技的武术家，拥有非常高的实力而受到信赖及敬重，作为武术家，其长久以来的愿望是与X或者ZERO进行一场决斗，因此西格玛唆使其破坏啦天空城蔚蓝海岸的动力系统使其坠落使其下方的人类城市变成一片废土，并将罪名污蔑给改造军团迫使改造军团叛乱，他本人则在破坏了蔚蓝海岸之後，背叛了异常体猎人，躲到火山地带，将前来试图处分掉他的异常体猎人全部打倒
X武器：上昇火焰（正上方发射一发火焰弹，可以破坏冰块或木质的障碍物。集气是火球弹包覆全身，一边跳跃一边进行上勾拳攻击，此时无敌）
ZERO武器：龙炎刃（一边跳起一边向前上方炎属性斩击。此时的跳跃高度会比平常更高）
洛克人X4克制：冰霜海象，电子孔雀（龙炎刃），爱莉丝（龙炎刃），幻影西格玛，西格玛终极形态。枪手身体（龙炎刃）
洛克人X4登场对其有效武器：双重旋风，雷神击
攻击方式：（Boss房两边是岩浆一触即死，1回战时Boss也能用骑乘装甲对战）
①波动踢 垂直跳起来後腿部包覆火焰斜踢
②波动拳 直线火焰二连发（半血后3连发）
③上昇火焰 一边跳跃一边进行火焰升龙拳攻击
④喷射火焰 来到画面边缘张开嘴，接著喷火（此时完全不会动）
⑤岩浆柱 做出火球，然后丢入岩浆，接着岩浆上涌成火柱
⑥火山弹 向上喷火，接着落下多个火焰弹
